More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A0536 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6322  glycogen branching enzyme  81.7 
 
 		 733 aa  760    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529539  normal  0.166008 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1737  glycogen branching enzyme  99.78 
 
 		 738 aa  900    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1543  glycogen branching enzyme  99.78 
 
 		 738 aa  900    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.408672  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7032  glycogen branching enzyme  83.48 
 
 		 735 aa  771    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1338  1,4-alpha-glucan branching enzyme  100 
 
 		 448 aa  899    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2863  glycogen branching enzyme  70.63 
 
 		 736 aa  648    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1332  glycogen branching enzyme  83.71 
 
 		 736 aa  768    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.802487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1566  glycogen branching enzyme  99.78 
 
 		 738 aa  900    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5592  glycogen branching enzyme  81.25 
 
 		 733 aa  757    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6086  glycogen branching enzyme  83.26 
 
 		 736 aa  766    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6497  glycogen branching enzyme  83.93 
 
 		 736 aa  769    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0536  1,4-alpha-glucan branching enzyme  100 
 
 		 448 aa  899    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6823  glycogen branching enzyme  70.63 
 
 		 736 aa  654    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.851597 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5489  glycogen branching enzyme  83.93 
 
 		 732 aa  773    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461102  decreased coverage  0.0000652942 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0239  glycogen branching enzyme  69.04 
 
 		 775 aa  632  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0137851  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4391  glycogen branching enzyme  70.63 
 
 		 741 aa  634  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.470909 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  67.71 
 
 		 768 aa  630  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4050  glycogen branching enzyme  67.71 
 
 		 768 aa  630  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  64.88 
 
 		 733 aa  605  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  65.32 
 
 		 732 aa  600  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4229  glycogen branching enzyme  65.33 
 
 		 750 aa  597  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  64.06 
 
 		 728 aa  589  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  61.74 
 
 		 743 aa  585  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  63.17 
 
 		 728 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  61.52 
 
 		 741 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  62.86 
 
 		 741 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  60.94 
 
 		 736 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  63.17 
 
 		 728 aa  581  1e-164  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  63.45 
 
 		 770 aa  578  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  60.71 
 
 		 736 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  60.49 
 
 		 736 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4136  glycogen branching enzyme  62.19 
 
 		 725 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5384  glycogen branching enzyme  61.52 
 
 		 737 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.475893  normal  0.712549 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3937  glycogen branching enzyme  62.19 
 
 		 725 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  60.04 
 
 		 736 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5563  glycogen branching enzyme  59.96 
 
 		 735 aa  568  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  61.88 
 
 		 784 aa  568  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  61.88 
 
 		 784 aa  568  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  61.66 
 
 		 785 aa  566  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  62.28 
 
 		 732 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5099  glycogen branching enzyme  61.61 
 
 		 736 aa  567  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0222717  normal  0.0266219 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  60.99 
 
 		 738 aa  565  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03669  glycogen branching enzyme  65.27 
 
 		 727 aa  566  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  61.61 
 
 		 732 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0215  1,4-alpha-glucan branching enzyme  62.28 
 
 		 739 aa  559  1e-158  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  60.49 
 
 		 712 aa  556  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03284  glycogen branching enzyme  59.06 
 
 		 728 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0237204  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0282  1,4-alpha-glucan branching enzyme  59.06 
 
 		 728 aa  553  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.890555  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0277  glycogen branching enzyme  59.96 
 
 		 727 aa  553  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03237  hypothetical protein  59.06 
 
 		 728 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0399493  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3632  glycogen branching enzyme  59.06 
 
 		 728 aa  553  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  60.81 
 
 		 760 aa  551  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0280  glycogen branching enzyme  59.06 
 
 		 728 aa  553  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.388281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3911  glycogen branching enzyme  59.06 
 
 		 728 aa  553  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1104  1,4-alpha-glucan branching enzyme  61.12 
 
 		 729 aa  553  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  61.38 
 
 		 722 aa  552  1e-156  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3714  glycogen branching enzyme  59.06 
 
 		 728 aa  553  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.470927  normal  0.781278 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3892  glycogen branching enzyme  59.06 
 
 		 728 aa  553  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4744  glycogen branching enzyme  59.06 
 
 		 728 aa  552  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2861  1,4-alpha-glucan branching enzyme  61.16 
 
 		 726 aa  553  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2091  glycogen branching enzyme  57.62 
 
 		 677 aa  550  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1658  glycogen branching enzyme  61.11 
 
 		 721 aa  550  1e-155  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0104457  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4647  glycogen branching enzyme  58.84 
 
 		 728 aa  548  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1464  1,4-alpha-glucan branching enzyme  62.42 
 
 		 742 aa  550  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3908  glycogen branching enzyme  58.84 
 
 		 728 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.635495 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3728  glycogen branching enzyme  58.61 
 
 		 728 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.636396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3805  glycogen branching enzyme  58.61 
 
 		 728 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8169  glycogen branching enzyme  60.54 
 
 		 785 aa  547  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7545  1,4-alpha-glucan branching enzyme  63.06 
 
 		 768 aa  547  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3650  glycogen branching enzyme  59.28 
 
 		 735 aa  544  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3840  glycogen branching enzyme  58.84 
 
 		 728 aa  543  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.933712 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3348  glycogen branching enzyme  59.51 
 
 		 735 aa  542  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  59.6 
 
 		 740 aa  544  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0223  glycogen branching enzyme  58.84 
 
 		 727 aa  543  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2740  glycogen branching enzyme  61.88 
 
 		 736 aa  544  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0889  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.33 
 
 		 807 aa  543  1e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3847  glycogen branching enzyme  58.61 
 
 		 728 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.579586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3739  glycogen branching enzyme  58.39 
 
 		 728 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  59.1 
 
 		 727 aa  543  1e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4428  glycogen branching enzyme  60.36 
 
 		 731 aa  543  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0415  1,4-alpha-glucan branching enzyme  60.95 
 
 		 723 aa  538  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03375  glycogen branching enzyme  60.31 
 
 		 728 aa  541  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  56.66 
 
 		 729 aa  538  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3321  1,4-alpha-glucan branching enzyme  58.84 
 
 		 728 aa  539  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  60.14 
 
 		 748 aa  536  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3603  1,4-alpha-glucan branching enzyme  58.31 
 
 		 736 aa  535  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.747738  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1133  glycogen branching enzyme  60.85 
 
 		 725 aa  534  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3760  glycogen branching enzyme  57.58 
 
 		 749 aa  533  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0147  glycogen branching enzyme  58.84 
 
 		 727 aa  532  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3681  glycogen branching enzyme  60 
 
 		 812 aa  533  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.024212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0612  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.58 
 
 		 631 aa  534  1e-150  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4118  glycogen branching enzyme  58.84 
 
 		 727 aa  532  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2024  glycogen branching enzyme  58.19 
 
 		 677 aa  530  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2960  1,4-alpha-glucan branching enzyme  56.6 
 
 		 633 aa  529  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3113  glycogen branching enzyme  58.84 
 
 		 638 aa  529  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4006  glycogen branching enzyme  58.84 
 
 		 727 aa  531  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4165  glycogen branching enzyme  57.91 
 
 		 716 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1207  glycogen branching enzyme  56.89 
 
 		 716 aa  525  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  57.46 
 
 		 716 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2162  glycogen branching enzyme  58.11 
 
 		 625 aa  527  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>