More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1589 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1589  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 
213 aa  433  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0079  uracil phosphoribosyltransferase  81.22 
 
 
212 aa  353  1e-96  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000379157 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0482  uracil phosphoribosyltransferase  67.92 
 
 
211 aa  296  2e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.715144 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03330  uracil phosphoribosyltransferase  64.9 
 
 
212 aa  287  7e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0356  uracil phosphoribosyltransferase  68.08 
 
 
212 aa  282  3.0000000000000004e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.925277 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3539  uracil phosphoribosyltransferase  64.32 
 
 
212 aa  269  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.434465  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0515  uracil phosphoribosyltransferase  65.09 
 
 
211 aa  268  5e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00743886  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04490  uracil phosphoribosyltransferase  66.2 
 
 
212 aa  267  7e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.14716 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0207  uracil phosphoribosyltransferase  66.51 
 
 
211 aa  267  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0275  uracil phosphoribosyltransferase  62.44 
 
 
213 aa  264  5.999999999999999e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.68494  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4937  uracil phosphoribosyltransferase  62.44 
 
 
215 aa  264  8.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9322  Uracil phosphoribosyltransferase  62.91 
 
 
212 aa  261  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0471  uracil phosphoribosyltransferase  65.57 
 
 
211 aa  261  6.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.09301  normal  0.0581273 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4832  uracil phosphoribosyltransferase  62.04 
 
 
217 aa  258  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8568  uracil phosphoribosyltransferase  60.75 
 
 
217 aa  257  9e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0766288  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0800  uracil phosphoribosyltransferase  59.72 
 
 
211 aa  255  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03340  uracil phosphoribosyltransferase  58.69 
 
 
218 aa  255  4e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.594912  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0647  uracil phosphoribosyltransferase  59.72 
 
 
211 aa  254  5e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26040  uracil phosphoribosyltransferase  60.09 
 
 
212 aa  253  2.0000000000000002e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
209 aa  219  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  50.72 
 
 
209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  50.72 
 
 
209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  48.33 
 
 
209 aa  210  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  53.17 
 
 
209 aa  209  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  53.17 
 
 
209 aa  209  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  49.28 
 
 
209 aa  209  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1306  uracil phosphoribosyltransferase  49.28 
 
 
214 aa  209  3e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.12178  normal  0.272748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6429  uracil phosphoribosyltransferase  50.94 
 
 
207 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2515  uracil phosphoribosyltransferase  52.61 
 
 
208 aa  206  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 
209 aa  205  4e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  50.49 
 
 
210 aa  204  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2394  uracil phosphoribosyltransferase  50.95 
 
 
208 aa  205  5e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0693016  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0240  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 
208 aa  205  5e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  46.89 
 
 
209 aa  205  5e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 
209 aa  204  9e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
209 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
209 aa  203  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
209 aa  203  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
209 aa  203  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
209 aa  203  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
209 aa  203  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
209 aa  203  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
209 aa  203  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
209 aa  203  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
209 aa  203  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
209 aa  203  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1036  uracil phosphoribosyltransferase  49.51 
 
 
211 aa  202  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0997591 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  48.79 
 
 
203 aa  202  4e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  49.28 
 
 
209 aa  201  6e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  48.34 
 
 
211 aa  201  6e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12130  uracil phosphoribosyltransferase  47.6 
 
 
213 aa  200  9.999999999999999e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  47.85 
 
 
209 aa  200  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  48.34 
 
 
211 aa  200  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0689  uracil phosphoribosyltransferase  47.89 
 
 
212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04610  uracil phosphoribosyltransferase  48.34 
 
 
209 aa  200  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107009  hitchhiker  0.000000328703 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  48.33 
 
 
209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 
209 aa  199  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0546  uracil phosphoribosyltransferase  48.57 
 
 
208 aa  198  3.9999999999999996e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0666714  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  49.51 
 
 
210 aa  198  6e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4197  uracil phosphoribosyltransferase  47.17 
 
 
211 aa  198  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0551495  normal  0.563023 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1245  uracil phosphoribosyltransferase  47.85 
 
 
209 aa  198  6e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000033391  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0260  uracil phosphoribosyltransferase  48.56 
 
 
209 aa  197  7.999999999999999e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000384888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  49.03 
 
 
209 aa  197  7.999999999999999e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1350  uracil phosphoribosyltransferase  47.17 
 
 
219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.51348 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0208  uracil phosphoribosyltransferase  49.28 
 
 
209 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  49.28 
 
 
213 aa  195  4.0000000000000005e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0206  uracil phosphoribosyltransferase  49.28 
 
 
209 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0833  uracil phosphoribosyltransferase  45.19 
 
 
303 aa  194  9e-49  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00074745  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 
207 aa  193  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  48.79 
 
 
226 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05530  uracil phosphoribosyltransferase  48.1 
 
 
207 aa  193  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0980  uracil phosphoribosyltransferase  47.14 
 
 
209 aa  193  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  48.08 
 
 
370 aa  192  3e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  47.83 
 
 
216 aa  192  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 
216 aa  192  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  46.86 
 
 
216 aa  192  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1787  uracil phosphoribosyltransferase  45.19 
 
 
209 aa  191  5e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.823416  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2971  uracil phosphoribosyltransferase  46.86 
 
 
211 aa  189  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1316  uracil phosphoribosyltransferase  46.45 
 
 
208 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.58002  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1648  uracil phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4386  uracil phosphoribosyltransferase  47.64 
 
 
207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0829  uracil phosphoribosyltransferase  46.19 
 
 
210 aa  188  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0684126 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1559  uracil phosphoribosyltransferase  46.19 
 
 
209 aa  189  4e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0188638  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
210 aa  188  5.999999999999999e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2188  uracil phosphoribosyltransferase  47.87 
 
 
216 aa  187  9e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0831132  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0279  uracil phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
210 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0557  uracil phosphoribosyltransferase  45.15 
 
 
209 aa  186  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000988166  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4836  uracil phosphoribosyltransferase  48.34 
 
 
224 aa  186  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213595  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2519  uracil phosphoribosyltransferase  47.14 
 
 
216 aa  185  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1005  uracil phosphoribosyltransferase  44.29 
 
 
208 aa  184  8e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0773  uracil phosphoribosyltransferase  44.76 
 
 
210 aa  184  9e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.236088 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1986  uracil phosphoribosyltransferase  46.45 
 
 
216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252014  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4221  uracil phosphoribosyltransferase  44.02 
 
 
210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0788  uracil phosphoribosyltransferase  46.45 
 
 
216 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0190472  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4070  uracil phosphoribosyltransferase  49.52 
 
 
208 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3025  uracil phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 
216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0316309 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1303  uracil phosphoribosyltransferase  43.81 
 
 
208 aa  183  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1785  uracil phosphoribosyltransferase  45.24 
 
 
211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2386  uracil phosphoribosyltransferase  45.97 
 
 
216 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2102  uracil phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 
209 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>