58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5360 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5360  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  606  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  hitchhiker  0.00309893 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5009  exoD protein  49.7 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1027  Exopolysaccharide synthesis ExoD  40.39 
 
 		 220 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4269  exopolysaccharide synthesis ExoD  30 
 
 		 200 aa  87.4  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528198  decreased coverage  0.0088823 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2869  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.37 
 
 		 220 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2415  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.74 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4382  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.29 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0680521 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2365  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.74 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0369  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.5 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1827  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.5 
 
 		 227 aa  79  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2346  exopolysaccharide synthesis, ExoD  31.55 
 
 		 210 aa  78.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1479  exopolysaccharide synthesis ExoD  30.11 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.438541  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0307  exopolysaccharide synthesis, ExoD  26.42 
 
 		 209 aa  75.5  0.000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3786  Exopolysaccharide synthesis ExoD  31.47 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232502  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2622  exopolysaccharide synthesis, ExoD  21.28 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512151  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1428  exopolysaccharide synthesis protein ExoD  25.13 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1368  exopolysaccharide synthesis protein  25.13 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0481317  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0769  exopolysaccharide synthesis protein  23.83 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0140556  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0150  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  25.77 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0151  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  26 
 
 		 218 aa  68.9  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3870  uncharacterized ABC-type transport system permease protein  26.11 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1096  hypothetical protein  26.32 
 
 		 200 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1099  hypothetical protein  25.73 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2731  exopolysaccharide synthesis, ExoD  35.07 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176932  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2945  exopolysaccharide synthesis, ExoD  31 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0152237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1687  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.22 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.882846 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3754  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.55 
 
 		 189 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2195  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.54 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4949  Exopolysaccharide synthesis ExoD  24.02 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.811076 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3452  Exopolysaccharide synthesis ExoD  25.99 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2841  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.89 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.61734 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2728  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.49 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0212409 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4959  exopolysaccharide synthesis ExoD  28.49 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.938152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6438  exopolysaccharide synthesis ExoD  30.84 
 
 		 223 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01796  Exopolysaccharide synthesis, ExoD  25.57 
 
 		 191 aa  53.5  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0457786  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1022  exopolysaccharide synthesis, ExoD  23.83 
 
 		 210 aa  52.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0915242 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1981  ABC transporter permease  24.86 
 
 		 191 aa  52.4  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3473  exopolysaccharide synthesis ExoD  29.08 
 
 		 212 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1715  uncharacterized ABC-type transport system permease component-like protein  33.54 
 
 		 177 aa  52.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1212  Exopolysaccharide synthesis ExoD  24.16 
 
 		 201 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4288  exopolysaccharide synthesis protein, putative  25 
 
 		 210 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1242  Exopolysaccharide synthesis ExoD  24.16 
 
 		 201 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1302  exopolysaccharide synthesis, ExoD  24.42 
 
 		 231 aa  50.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3324  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.22 
 
 		 194 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183092  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2866  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.74 
 
 		 223 aa  47.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3868  molybdate ABC transporter inner membrane protein  29.44 
 
 		 195 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175484  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1440  Exopolysaccharide synthesis ExoD  35.29 
 
 		 219 aa  47  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0922  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.67 
 
 		 194 aa  47  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.93119e-33 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2725  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.39 
 
 		 195 aa  47  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4172  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.89 
 
 		 195 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000786793  normal  0.185707 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2718  exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.82 
 
 		 200 aa  46.2  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2501  exopolysaccharide synthesis, ExoD  31.78 
 
 		 191 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00116546  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0209  exopolysaccharide synthesis protein  23.46 
 
 		 198 aa  44.7  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.742112  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1193  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.4 
 
 		 210 aa  43.1  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4613  exopolysaccharide synthesis, ExoD  32.26 
 
 		 222 aa  42.7  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4082  hypothetical protein  28 
 
 		 195 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269354  normal  0.0311141 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0979  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.97 
 
 		 210 aa  42.7  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1063  exopolysaccharide synthesis ExoD  32.5 
 
 		 198 aa  42.4  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.0691712 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>