More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2099 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2099  ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 		 273 aa  555  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2855  extracellular solute-binding protein  52.73 
 
 		 274 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3515  extracellular solute-binding protein family 3  51.27 
 
 		 275 aa  283  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.821579  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1982  extracellular solute-binding protein  55.79 
 
 		 276 aa  282  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6167  extracellular solute-binding protein  55.23 
 
 		 277 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6460  extracellular solute-binding protein  55.13 
 
 		 237 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.112663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4984  extracellular solute-binding protein  47.94 
 
 		 276 aa  246  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0182902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2096  ABC transporter substrate-binding protein  50.2 
 
 		 273 aa  238  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4595  amino acid ABC transporter  30.63 
 
 		 317 aa  122  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  33.73 
 
 		 586 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  32.02 
 
 		 583 aa  116  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4320  extracellular solute-binding protein family 3  28.12 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  28.34 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  29.84 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  32.41 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  28.31 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5457  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00912634  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  29.1 
 
 		 320 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2800  extracellular solute-binding protein  32.27 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3874  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3683  extracellular solute-binding protein family 3  27.38 
 
 		 301 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5139  extracellular solute-binding protein  30.87 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.900284 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  29.13 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0782  serine/threonine protein kinase  30.92 
 
 		 604 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0797  protein kinase  30.92 
 
 		 604 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 260 aa  99.4  6e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0778  protein kinase  30.77 
 
 		 604 aa  99  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.91 
 
 		 264 aa  99  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.12 
 
 		 264 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  31.66 
 
 		 265 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2597  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.13 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144936  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.12 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4136  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.15 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.502518  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.47 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  30.08 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  30.08 
 
 		 264 aa  96.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  30.08 
 
 		 264 aa  96.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1135  extracellular solute-binding protein  31.45 
 
 		 274 aa  96.7  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  30.08 
 
 		 264 aa  96.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.08 
 
 		 264 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3050  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 311 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3034  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 311 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3093  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 311 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6020  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 		 264 aa  95.9  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7701  extracellular solute-binding protein family 3  25.86 
 
 		 323 aa  95.9  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  0.675112 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0348  extracellular solute-binding protein  29.69 
 
 		 264 aa  95.5  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  32.35 
 
 		 265 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3686  extracellular solute-binding protein family 3  30.2 
 
 		 310 aa  95.5  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6682  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.97 
 
 		 257 aa  95.5  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2071  extracellular solute-binding protein family 3  30.93 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.012684 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1701  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  29.36 
 
 		 243 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.2 
 
 		 266 aa  94.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1967  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  31 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.8 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  28.91 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6320  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0695145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 277 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  29 
 
 		 265 aa  93.2  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2277  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.3 
 
 		 243 aa  93.2  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  32.14 
 
 		 254 aa  93.2  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  30.5 
 
 		 246 aa  92.8  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3939  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.25 
 
 		 259 aa  92.4  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  hitchhiker  0.00393875 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4198  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 257 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4897  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 		 267 aa  92  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.569673 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5447  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 		 267 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.111655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1210  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26240  periplasmic histidine-binding protein HisJ  28.75 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279452  normal  0.75514 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5128  extracellular solute-binding protein family 3  27.34 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212164  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.89 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.89 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.89 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  31.7 
 
 		 254 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.15 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3950  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.358906 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.89 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  29.52 
 
 		 265 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1067  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 		 264 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2538  extracellular solute-binding protein  32.48 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.527572  normal  0.516137 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  29.52 
 
 		 265 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0724  extracellular solute-binding protein  32.78 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.150259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.52 
 
 		 265 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.52 
 
 		 265 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  25.5 
 
 		 313 aa  90.1  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 302 aa  90.1  4e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0741  extracellular solute-binding protein  32.37 
 
 		 259 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790935 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5997  extracellular solute-binding protein  29.36 
 
 		 262 aa  89.7  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.502118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0255  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 257 aa  89.7  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3016  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 		 246 aa  89.7  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.032906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1067  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 		 264 aa  89.4  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4899  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 257 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.092586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0366  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 259 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.996881  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2995  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 257 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0849  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 259 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0453147  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5371  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 257 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0073  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.39 
 
 		 267 aa  89  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0708  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 		 264 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.956063  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1224  extracellular solute-binding protein family 3  27.09 
 
 		 322 aa  89.4  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.324397  decreased coverage  0.00201805 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1163  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 		 264 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.0605845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>