More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0517 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0517  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  100 
 
 		 139 aa  280  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355984  normal  0.550913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4061  putative response regulator receiver protein  69.92 
 
 		 137 aa  187  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.164869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7676  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  58.33 
 
 		 136 aa  153  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4802  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 150 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.972925  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3805  response regulator receiver domain-containing protein  36.67 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.234893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1870  response regulator receiver protein  34.95 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1493  response regulator receiver  33.05 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3799  response regulator receiver/diguanylate phosphodiesterase  30.83 
 
 		 415 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3857  response regulator receiver domain-containing protein  32.2 
 
 		 165 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3853  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  32.23 
 
 		 417 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.548821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0529  putative response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 169 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1876  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  34.91 
 
 		 416 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.296132  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0496  two component transcriptional regulator  42.5 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.569564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4036  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.5 
 
 		 225 aa  57  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  34.81 
 
 		 229 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1285  response regulator receiver domain-containing protein  28.1 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0213798  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1496  response regulator and cylclic diguanylate phosphodiesterase  27.83 
 
 		 413 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000286  response regulator VieA  23.2 
 
 		 384 aa  51.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926031  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2365  two component signal transduction response regulator  30.6 
 
 		 575 aa  51.2  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4687  DNA-binding transcriptional regulator BasR  35.63 
 
 		 222 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.20519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4547  DNA-binding transcriptional regulator BasR  35.63 
 
 		 222 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4638  DNA-binding transcriptional regulator BasR  35.63 
 
 		 222 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4638  DNA-binding transcriptional regulator BasR  35.63 
 
 		 222 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4554  DNA-binding transcriptional regulator BasR  35.63 
 
 		 222 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  37.04 
 
 		 224 aa  50.4  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.94 
 
 		 1195 aa  50.4  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3392  response regulator transcription regulator protein  38.75 
 
 		 224 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3603  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.25 
 
 		 226 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  37.35 
 
 		 219 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3281  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.25 
 
 		 226 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 		 1127 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0174  putative PAS/PAC sensor protein  24.62 
 
 		 498 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2942  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  26.87 
 
 		 451 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2580  putative diguanylate phosphodiesterase  26.32 
 
 		 413 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.465232 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0590  DNA-binding response regulator  29.91 
 
 		 230 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3511  two component transcriptional regulator  31.65 
 
 		 224 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699106  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0823  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.41 
 
 		 456 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.449732 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.37 
 
 		 900 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269875  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1527  two component transcriptional regulator  30.19 
 
 		 230 aa  47.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255733  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1834  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 681 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1831  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 685 aa  47.4  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3750  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  27.46 
 
 		 397 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03984  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with BasS  33.33 
 
 		 222 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4667  DNA-binding transcriptional regulator BasR  33.33 
 
 		 222 aa  47  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03945  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4353  DNA-binding transcriptional regulator BasR  33.33 
 
 		 222 aa  47  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4578  DNA-binding transcriptional regulator BasR  33.33 
 
 		 222 aa  47  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.800667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3914  DNA-binding transcriptional regulator BasR  33.33 
 
 		 222 aa  47  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.730701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5626  DNA-binding transcriptional regulator BasR  33.33 
 
 		 222 aa  47  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  28.69 
 
 		 1379 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2164  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 461 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.340092 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3680  histidine kinase A domain-containing protein  33.61 
 
 		 220 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.894604 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2827  response regulator receiver protein  24.24 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2713  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.1 
 
 		 454 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4252  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 461 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1098  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 461 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1091  two component transcriptional regulator  36.14 
 
 		 239 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 		 2107 aa  46.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1260  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.63 
 
 		 452 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000141339 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3875  two component transcriptional regulator  31.65 
 
 		 224 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000754116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0660  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 461 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 		 1038 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0187  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  23.97 
 
 		 457 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  32.59 
 
 		 252 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0660  two component transcriptional regulator  31.65 
 
 		 224 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000270487 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1016  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 461 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1140  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 461 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2807  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 466 aa  45.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.75933  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5240  response regulator  33.33 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1161  response regulator  27.73 
 
 		 380 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1088  response regulator  27.73 
 
 		 380 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1940  response regulator  25.76 
 
 		 397 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249901  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0930  response regulator  27.73 
 
 		 380 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3444  response regulator receiver protein  27.05 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  32.59 
 
 		 247 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  32.59 
 
 		 242 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1803  two component transcriptional regulator  31.73 
 
 		 232 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782093  normal  0.890279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5762  two component transcriptional regulator  31.45 
 
 		 234 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120401  normal  0.403713 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  32.59 
 
 		 242 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3233  two component transcriptional regulator  30.28 
 
 		 230 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0994  response regulator  27.73 
 
 		 380 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1091  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 460 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  32.59 
 
 		 282 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  32.59 
 
 		 242 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  32.59 
 
 		 282 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3962  two component transcriptional regulator  31.19 
 
 		 221 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4662  DNA-binding response regulator  28.04 
 
 		 230 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  32.59 
 
 		 247 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  32.59 
 
 		 247 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  32.59 
 
 		 250 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4663  DNA-binding response regulator  28.04 
 
 		 230 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  25.4 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  32.59 
 
 		 247 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0049  two component transcriptional regulator  30.43 
 
 		 225 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0753  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.15 
 
 		 241 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.407347  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1117  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 462 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.144471  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  32.59 
 
 		 247 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.82 
 
 		 219 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  27.2 
 
 		 1066 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>