65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_51980 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_51980  hypothetical protein  100 
 
 
581 aa  1145    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1539  hypothetical protein  45.57 
 
 
597 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0472  von Willebrand factor type A  37.99 
 
 
403 aa  173  5.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4241  von Willebrand factor, type A  38.26 
 
 
401 aa  170  7e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33156  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2623  hypothetical protein  34.38 
 
 
419 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00179753  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2880  hypothetical protein  35.16 
 
 
423 aa  123  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3156  von Willebrand factor, type A  34.32 
 
 
575 aa  103  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.314115  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4158  von Willebrand factor type A  30.17 
 
 
429 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.590263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3349  von Willebrand factor, type A  32.94 
 
 
429 aa  74.3  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1721  von Willebrand factor, type A  28 
 
 
1356 aa  69.7  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13107  normal  0.394888 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  47 
 
 
444 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  40.28 
 
 
489 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  52.27 
 
 
484 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3320  von Willebrand factor, type A  28 
 
 
855 aa  67.4  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1396  von Willebrand factor, type A  28.4 
 
 
504 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000309187  hitchhiker  0.000141462 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1312  hypothetical protein  34.88 
 
 
436 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00429215  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1846  hypothetical protein  32.3 
 
 
524 aa  63.9  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.378193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  45.28 
 
 
3409 aa  63.9  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1435  putative virulence effector protein  26.64 
 
 
402 aa  63.5  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3225  von Willebrand factor, type A  26.67 
 
 
477 aa  60.5  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  41.05 
 
 
3472 aa  60.5  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  41.05 
 
 
3471 aa  60.5  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4136  von Willebrand factor type A  30.38 
 
 
461 aa  59.7  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.281515  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  39.81 
 
 
3521 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2216  von Willebrand factor type A  29.7 
 
 
427 aa  58.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359753  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  57.65 
 
 
268 aa  58.2  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  51.95 
 
 
1261 aa  57.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2073  von Willebrand factor, type A  27.88 
 
 
436 aa  57.4  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.04125  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  29.52 
 
 
2449 aa  56.6  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1306  von Willebrand factor type A  29.71 
 
 
681 aa  53.9  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104381  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  56.06 
 
 
926 aa  52.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  44.9 
 
 
630 aa  52.4  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2093  putative virulence effector protein  25.81 
 
 
465 aa  51.6  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52100  hypothetical protein  28.32 
 
 
486 aa  51.2  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  39.13 
 
 
928 aa  50.8  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  39.08 
 
 
2179 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2381  putative virulence effector protein  24.19 
 
 
461 aa  50.4  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.723161  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2063  hypothetical protein  28.5 
 
 
251 aa  50.4  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0618531  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1748  ssrAB activated gene  32.97 
 
 
442 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.135386  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0322  D-amino acid dehydrogenase, large subunit  23.35 
 
 
452 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1795  von Willebrand factor type A  24.12 
 
 
626 aa  49.3  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1119  G5 domain protein  31.37 
 
 
1859 aa  48.9  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.983019  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  57.58 
 
 
423 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  34.74 
 
 
2272 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1567  ssrAB activated gene  32.97 
 
 
439 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1711  ssrAB activated gene  32.97 
 
 
441 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1773  ssrAB activated gene  32.97 
 
 
439 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420884  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1708  ssrAB activated gene  32.97 
 
 
441 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.483925  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2102  putative virulence effector protein  22.94 
 
 
442 aa  47.4  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0895  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.61 
 
 
621 aa  47.4  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.693546  normal  0.575051 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1882  putative virulence effector protein  28.95 
 
 
452 aa  47  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3155  hypothetical protein  31.15 
 
 
513 aa  47  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0450583  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0079  surface layer protein  65.62 
 
 
404 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  2.3790999999999998e-28  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2633  hypothetical protein  26.25 
 
 
451 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.270397  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  29.87 
 
 
1888 aa  45.8  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0471  hypothetical protein  22.3 
 
 
454 aa  45.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0525  hypothetical protein  52 
 
 
334 aa  44.7  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2870  hypothetical protein  26.36 
 
 
509 aa  44.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.457968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6478  hypothetical protein  26 
 
 
469 aa  44.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4905  hypothetical protein  26.7 
 
 
317 aa  44.3  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  25.95 
 
 
308 aa  44.3  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  35.82 
 
 
352 aa  43.9  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0896  hypothetical protein  29.82 
 
 
421 aa  43.9  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.08458  normal  0.380175 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1965  hypothetical protein  22.61 
 
 
486 aa  43.9  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.93 
 
 
1162 aa  43.5  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>