18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6478 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6478  hypothetical protein  100 
 
 		 469 aa  959    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4051  hypothetical protein  34.55 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.749152  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6477  hypothetical protein  26.48 
 
 		 507 aa  63.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1948  hypothetical protein  34.17 
 
 		 669 aa  62.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247552  normal  0.114071 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0896  hypothetical protein  37.62 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.08458  normal  0.380175 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1846  hypothetical protein  30 
 
 		 524 aa  53.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.378193  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0471  hypothetical protein  33.71 
 
 		 454 aa  50.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2093  putative virulence effector protein  27.18 
 
 		 465 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1966  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.05 
 
 		 578 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2381  putative virulence effector protein  27.18 
 
 		 461 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.723161  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4240  hypothetical protein  31.46 
 
 		 465 aa  48.5  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0163273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52100  hypothetical protein  27.48 
 
 		 486 aa  47.4  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1882  putative virulence effector protein  26.44 
 
 		 452 aa  46.6  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4050  hypothetical protein  30.3 
 
 		 629 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35522  normal  0.114627 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1539  hypothetical protein  30.63 
 
 		 597 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1435  putative virulence effector protein  26.5 
 
 		 402 aa  44.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  26.61 
 
 		 899 aa  44.7  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51980  hypothetical protein  25.25 
 
 		 581 aa  43.9  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>