More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_41890 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  100 
 
 
449 aa  889    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  48.17 
 
 
452 aa  403  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  48.42 
 
 
482 aa  395  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  42.43 
 
 
491 aa  347  3e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2486  sugar transporter  40.49 
 
 
509 aa  328  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2375  sugar transporter  42.57 
 
 
489 aa  322  6e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00427288  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1952  sugar transporter  40.53 
 
 
482 aa  321  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  42.11 
 
 
480 aa  317  2e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  41.11 
 
 
477 aa  315  9.999999999999999e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5665  sugar transporter  39.64 
 
 
471 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.600192 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3729  sugar transporter  39.64 
 
 
471 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4639  sugar transporter  39.64 
 
 
471 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  40.32 
 
 
463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  37.61 
 
 
480 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  40.09 
 
 
463 aa  303  6.000000000000001e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  39.87 
 
 
468 aa  294  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  36.49 
 
 
450 aa  293  4e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  40.32 
 
 
474 aa  290  4e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  38.44 
 
 
492 aa  286  8e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  40.23 
 
 
447 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  42.02 
 
 
468 aa  282  9e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1014  sugar transporter  38.69 
 
 
480 aa  278  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  36.08 
 
 
446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  38.37 
 
 
480 aa  273  6e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  34 
 
 
480 aa  267  2.9999999999999995e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  35.54 
 
 
466 aa  266  4e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  34.9 
 
 
472 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  36.77 
 
 
480 aa  261  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  36.84 
 
 
475 aa  259  6e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  33.26 
 
 
482 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  34.27 
 
 
484 aa  257  2e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  36.01 
 
 
476 aa  257  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  37.81 
 
 
507 aa  256  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  36.34 
 
 
468 aa  256  7e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  36.14 
 
 
477 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  33.33 
 
 
533 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  33.63 
 
 
497 aa  254  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  35.08 
 
 
458 aa  253  4.0000000000000004e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  34.98 
 
 
473 aa  253  6e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  34.09 
 
 
448 aa  251  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  36.36 
 
 
472 aa  251  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  35.04 
 
 
473 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  34.68 
 
 
457 aa  247  3e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  33.78 
 
 
472 aa  246  6e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  33.78 
 
 
472 aa  246  6e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  33.11 
 
 
464 aa  245  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  33.78 
 
 
472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  33.78 
 
 
472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  33.78 
 
 
472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  33.78 
 
 
472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  33.78 
 
 
472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  33.56 
 
 
472 aa  243  5e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  33.56 
 
 
472 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  34 
 
 
472 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  34 
 
 
472 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  34 
 
 
472 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  34 
 
 
472 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  34 
 
 
472 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  35.23 
 
 
450 aa  241  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  35.06 
 
 
464 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  34.83 
 
 
464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  34.83 
 
 
464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  34.83 
 
 
464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  34.83 
 
 
464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  34.83 
 
 
464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  34.83 
 
 
464 aa  234  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  34.83 
 
 
464 aa  234  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  34.83 
 
 
464 aa  234  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  34.83 
 
 
464 aa  234  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  34.83 
 
 
464 aa  234  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  34.97 
 
 
465 aa  234  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  34.83 
 
 
464 aa  234  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  34.83 
 
 
464 aa  234  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  33.26 
 
 
442 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  35.43 
 
 
452 aa  233  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  35.43 
 
 
452 aa  233  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  33.11 
 
 
471 aa  232  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1681  D-xylose proton-symporter  33.63 
 
 
464 aa  231  1e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.142267  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  34.61 
 
 
464 aa  232  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  33.48 
 
 
490 aa  230  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  34.96 
 
 
516 aa  229  8e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  33.26 
 
 
459 aa  228  1e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  33.79 
 
 
444 aa  227  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  32.88 
 
 
441 aa  227  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  32.97 
 
 
471 aa  225  2e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  35.07 
 
 
473 aa  222  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  34.27 
 
 
475 aa  219  8.999999999999998e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  34.62 
 
 
473 aa  219  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  30.15 
 
 
475 aa  216  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  30.07 
 
 
448 aa  215  9.999999999999999e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  31.75 
 
 
438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0824  sugar transporter  37.44 
 
 
456 aa  213  7e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2048  sugar transporter  32.45 
 
 
478 aa  212  9e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  32.27 
 
 
445 aa  212  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1624  hypothetical protein  31.75 
 
 
471 aa  208  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  30.94 
 
 
474 aa  208  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1619  hypothetical protein  31.98 
 
 
471 aa  208  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  31.02 
 
 
466 aa  208  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  31.97 
 
 
499 aa  206  6e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  28.23 
 
 
477 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>