More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_39100 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_39100  cysteine desulfurase, sufS  100 
 
 		 449 aa  892    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0233253  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3060  aminotransferase, class V  74.88 
 
 		 407 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.349128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1092  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  69.39 
 
 		 430 aa  580  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16930  putative pyridoxal-phosphate dependent enzyme  73.57 
 
 		 401 aa  581  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00364141  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1527  cysteine sulfinate desulfinase  71.57 
 
 		 401 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1529  cysteine sulfinate desulfinase  72.57 
 
 		 401 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126316  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4195  aminotransferase, class V  72.07 
 
 		 401 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1138  aminotransferase class V  72.57 
 
 		 401 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1335  aminotransferase, class V  70.4 
 
 		 413 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1472  putative pyridoxal-phosphate dependent enzyme  72.32 
 
 		 401 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4090  aminotransferase class V  71.82 
 
 		 401 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  43.83 
 
 		 404 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  42.32 
 
 		 405 aa  336  3.9999999999999995e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.32 
 
 		 417 aa  333  3e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  41.67 
 
 		 403 aa  332  6e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.04 
 
 		 404 aa  330  3e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0690  cysteine desulfurase  41.06 
 
 		 405 aa  328  8e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144442  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.18 
 
 		 451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  40.8 
 
 		 408 aa  327  3e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0735  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.86 
 
 		 403 aa  326  5e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  40.75 
 
 		 419 aa  326  6e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2777  aminotransferase, class V  44.31 
 
 		 409 aa  325  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.75 
 
 		 418 aa  325  1e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  41.32 
 
 		 420 aa  323  5e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  41.31 
 
 		 406 aa  322  7e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  41.31 
 
 		 406 aa  322  7e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  41.31 
 
 		 406 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  41.31 
 
 		 406 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4450  aminotransferase class V  44.5 
 
 		 405 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.728371  hitchhiker  0.000499767 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  41.31 
 
 		 406 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  41.31 
 
 		 406 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  41.31 
 
 		 406 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.75 
 
 		 429 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  40.55 
 
 		 405 aa  320  3e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  40.55 
 
 		 405 aa  320  3.9999999999999996e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.86 
 
 		 429 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0836  cysteine desulfurase  42.03 
 
 		 415 aa  319  5e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  41.06 
 
 		 406 aa  320  5e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.36 
 
 		 429 aa  319  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.81 
 
 		 406 aa  318  1e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  41.06 
 
 		 406 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.85 
 
 		 572 aa  318  2e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  41.71 
 
 		 414 aa  317  3e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.8 
 
 		 417 aa  317  3e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.81 
 
 		 406 aa  317  3e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  41.71 
 
 		 414 aa  317  3e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0967  cysteine desulfurase, aminotransferase, class V  41.85 
 
 		 399 aa  315  9e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  37.94 
 
 		 408 aa  315  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.86 
 
 		 406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3131  cysteine desulfurase  41.55 
 
 		 415 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0743  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.07 
 
 		 445 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  41.5 
 
 		 420 aa  312  5.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  38.91 
 
 		 665 aa  313  5.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  42.18 
 
 		 414 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3507  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.07 
 
 		 445 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  43 
 
 		 407 aa  312  7.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.06 
 
 		 413 aa  312  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  41.96 
 
 		 413 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3379  cysteine sulfinate desulfinase  44.86 
 
 		 401 aa  310  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.52 
 
 		 413 aa  311  2e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0808  cysteine desulfurase  42.03 
 
 		 415 aa  310  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  38.24 
 
 		 425 aa  311  2e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3698  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.56 
 
 		 445 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  37.44 
 
 		 404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03290  hypothetical protein  42.57 
 
 		 403 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.3 
 
 		 662 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0859  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.41 
 
 		 403 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.36 
 
 		 414 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3789  aminotransferase, class V  41.65 
 
 		 456 aa  310  5e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.36 
 
 		 420 aa  309  5e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.21 
 
 		 414 aa  309  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.3 
 
 		 414 aa  310  5e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  41.73 
 
 		 682 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3575  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.81 
 
 		 445 aa  309  8e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  42.49 
 
 		 604 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  41.79 
 
 		 412 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  42.49 
 
 		 604 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.61 
 
 		 407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.99 
 
 		 406 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  38.07 
 
 		 569 aa  308  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2951  cysteine sulfinate desulfinase  44.11 
 
 		 401 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00101745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.79 
 
 		 406 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.08 
 
 		 415 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.13 
 
 		 413 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.82 
 
 		 644 aa  306  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  39.65 
 
 		 417 aa  306  3e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.21 
 
 		 416 aa  307  3e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.77 
 
 		 657 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.77 
 
 		 404 aa  306  4.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0767  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.75 
 
 		 403 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.36 
 
 		 418 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0925  cysteine sulfinate desulfinase  43.86 
 
 		 401 aa  306  6e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.002092  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40 
 
 		 419 aa  306  6e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.36 
 
 		 418 aa  306  6e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  37.66 
 
 		 414 aa  306  7e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  37.44 
 
 		 406 aa  305  9.000000000000001e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  40.64 
 
 		 416 aa  305  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.11 
 
 		 406 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0840  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.06 
 
 		 437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.550163  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.76 
 
 		 419 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>