52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_31080 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_31080  hypothetical protein  100 
 
 
436 aa  880    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2916  HipA domain-containing protein  39.25 
 
 
448 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.615087  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0870  HipA domain protein  38.95 
 
 
448 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.379459  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3691  HipA domain-containing protein  36.82 
 
 
449 aa  227  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.521497  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0340  hypothetical protein  35.48 
 
 
456 aa  220  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2517  HipA domain protein  35.59 
 
 
426 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0212524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0502  hypothetical protein  33.25 
 
 
430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3170  hypothetical protein  34.99 
 
 
455 aa  208  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0883  HipA domain-containing protein  33.92 
 
 
457 aa  207  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.732882  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5379  HipA-like  34.95 
 
 
438 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5482  HipA domain-containing protein  34.95 
 
 
438 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639986  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  25.76 
 
 
430 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  26.35 
 
 
430 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  26.49 
 
 
412 aa  60.1  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  25.17 
 
 
387 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  28.95 
 
 
451 aa  56.6  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  30.48 
 
 
390 aa  56.6  0.0000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  26.62 
 
 
387 aa  55.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  25.13 
 
 
440 aa  55.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  27.49 
 
 
430 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  23.05 
 
 
435 aa  52.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  29.32 
 
 
405 aa  52  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  28.28 
 
 
444 aa  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  26.83 
 
 
312 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  31.74 
 
 
414 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  23.19 
 
 
420 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  29.57 
 
 
418 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  24.87 
 
 
440 aa  50.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  30.43 
 
 
415 aa  49.7  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  31.74 
 
 
415 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  26.62 
 
 
480 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  29.32 
 
 
426 aa  48.9  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  30.33 
 
 
433 aa  48.5  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  24.75 
 
 
419 aa  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  28.12 
 
 
412 aa  47.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  29.37 
 
 
431 aa  47.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  28.14 
 
 
422 aa  47.4  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  29.23 
 
 
392 aa  47.4  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  27.03 
 
 
447 aa  47.4  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5936  HipA N-terminal domain protein  25.83 
 
 
456 aa  47  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  26.52 
 
 
420 aa  47  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  24.64 
 
 
414 aa  46.6  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  27.27 
 
 
421 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  24.74 
 
 
431 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  27.9 
 
 
419 aa  45.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  29.52 
 
 
449 aa  45.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3446  HipA domain-containing protein  27.13 
 
 
617 aa  44.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  27.59 
 
 
418 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0727  hypothetical protein  26.22 
 
 
443 aa  44.3  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13683  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  27.64 
 
 
425 aa  44.3  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  26.54 
 
 
427 aa  43.9  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  27.16 
 
 
404 aa  43.5  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>