More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_16800 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_42370  transposase  97.52 
 
 
403 aa  821    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  97.02 
 
 
403 aa  819    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  92.48 
 
 
406 aa  780    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  100 
 
 
403 aa  838    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  72.25 
 
 
400 aa  586  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  62.15 
 
 
413 aa  514  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  60.15 
 
 
411 aa  512  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  60.47 
 
 
402 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  61.13 
 
 
411 aa  508  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  60.99 
 
 
387 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  60.99 
 
 
402 aa  506  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  60.73 
 
 
402 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  60.21 
 
 
402 aa  503  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  60.21 
 
 
402 aa  503  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  60 
 
 
411 aa  502  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  60.21 
 
 
402 aa  504  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  61.38 
 
 
411 aa  499  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  60.47 
 
 
402 aa  498  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  59.95 
 
 
402 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  59.69 
 
 
402 aa  497  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  61.4 
 
 
411 aa  494  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  59.95 
 
 
402 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  59.69 
 
 
402 aa  491  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  59.42 
 
 
402 aa  489  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  60.22 
 
 
382 aa  474  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  58.67 
 
 
431 aa  472  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  60.22 
 
 
382 aa  474  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  57.76 
 
 
348 aa  437  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  57.76 
 
 
348 aa  437  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  58.05 
 
 
348 aa  436  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  51.91 
 
 
422 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  48.21 
 
 
399 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  44.57 
 
 
422 aa  340  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  43.64 
 
 
381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  43.64 
 
 
381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  45.07 
 
 
408 aa  323  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  44.09 
 
 
408 aa  322  7e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0668  transposase  61.88 
 
 
231 aa  311  2e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000294639  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  40.63 
 
 
435 aa  303  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0717  transposase  61.4 
 
 
219 aa  296  6e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0318714  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  35.78 
 
 
391 aa  242  7.999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  36.81 
 
 
397 aa  237  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  36.81 
 
 
397 aa  237  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1584  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  36.67 
 
 
417 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.758267 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1623  IS605 family transposase OrfB  32.55 
 
 
377 aa  216  7e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.139017  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.34 
 
 
396 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  36.22 
 
 
399 aa  213  5.999999999999999e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  36.22 
 
 
399 aa  213  5.999999999999999e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1254  IS605 family transposase OrfB  33.77 
 
 
378 aa  212  1e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  36.86 
 
 
368 aa  211  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  34.4 
 
 
391 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  33.58 
 
 
391 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5477  IS605 family transposase OrfB  36.83 
 
 
416 aa  208  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.461601  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  35.82 
 
 
399 aa  209  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  33.82 
 
 
391 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  32.82 
 
 
395 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0757  IS605 family transposase OrfB  32.81 
 
 
382 aa  207  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.825829  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  35.57 
 
 
393 aa  206  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0263  IS605 family transposase OrfB  32.29 
 
 
382 aa  206  6e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00049231  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  33.16 
 
 
390 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  35.57 
 
 
424 aa  206  7e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  32.73 
 
 
372 aa  203  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  33.42 
 
 
373 aa  203  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  32.91 
 
 
373 aa  203  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  33.42 
 
 
373 aa  202  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  33.95 
 
 
370 aa  202  7e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  33.51 
 
 
373 aa  202  8e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  36.62 
 
 
377 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  35.61 
 
 
381 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  33.78 
 
 
372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  34.73 
 
 
410 aa  201  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  34.8 
 
 
410 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  32.22 
 
 
372 aa  200  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0394  transposase, IS605 OrfB family  31.99 
 
 
402 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  32.22 
 
 
372 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  34.55 
 
 
405 aa  199  7.999999999999999e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3797  IS605 family transposase OrfB  34.59 
 
 
429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3319  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  34.7 
 
 
415 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6840  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.36 
 
 
396 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.643066  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  33.24 
 
 
373 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  33.24 
 
 
373 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  35.86 
 
 
375 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  33.16 
 
 
370 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  33.24 
 
 
373 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  37.53 
 
 
381 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  35.1 
 
 
377 aa  196  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3509  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.64 
 
 
398 aa  196  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  36.25 
 
 
376 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  35.36 
 
 
361 aa  194  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  31.5 
 
 
383 aa  193  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  35.28 
 
 
405 aa  193  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  31.23 
 
 
416 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1800  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  35.17 
 
 
386 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31256  normal  0.500943 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  33.07 
 
 
398 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  31.59 
 
 
383 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  33.07 
 
 
398 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6349  transposase  34.08 
 
 
429 aa  190  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0899  transposase, IS605 OrfB family  31.2 
 
 
363 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000841843  hitchhiker  0.0000000725079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  31.52 
 
 
440 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  32.19 
 
 
416 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.537832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>