160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_09860 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_09860  membrane protein  100 
 
 		 316 aa  627  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0683  integral membrane protein-like protein  81.88 
 
 		 324 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.636144 
 
 
-
 
NC_004310  BR1326  hypothetical protein  57.61 
 
 		 323 aa  346  3e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0756849  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1286  hypothetical protein  57.61 
 
 		 323 aa  346  3e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.600402  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3384  hypothetical protein  57.56 
 
 		 315 aa  333  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1858  hypothetical protein  57.61 
 
 		 315 aa  333  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0717922  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0484  hypothetical protein  59.49 
 
 		 331 aa  332  6e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3617  hypothetical protein  55.66 
 
 		 350 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0743  hypothetical protein  53.85 
 
 		 350 aa  315  6e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2485  hypothetical protein  56.44 
 
 		 310 aa  312  4.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.607254  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0879  hypothetical protein  54.63 
 
 		 317 aa  311  7.999999999999999e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00199978  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3951  hypothetical protein  55.02 
 
 		 350 aa  309  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0277158  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0781  hypothetical protein  52.6 
 
 		 350 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0598791  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0821  hypothetical protein  52.6 
 
 		 350 aa  306  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.915427  normal  0.313105 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5576  hypothetical protein  52.23 
 
 		 355 aa  298  6e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.484423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2527  hypothetical protein  52.55 
 
 		 340 aa  297  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3039  hypothetical protein  51.53 
 
 		 344 aa  268  5.9999999999999995e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0362949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0774  hypothetical protein  32.26 
 
 		 344 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.551414  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0886  hypothetical protein  32.14 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4925  hypothetical protein  30.9 
 
 		 344 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0184  hypothetical protein  33.56 
 
 		 360 aa  146  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0756  hypothetical protein  31.6 
 
 		 351 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.287958 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  35.52 
 
 		 850 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0633  hypothetical protein  29.87 
 
 		 351 aa  143  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4466  hypothetical protein  32.92 
 
 		 363 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  35.52 
 
 		 850 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  35.52 
 
 		 850 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5268  hypothetical protein  32.26 
 
 		 344 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  35.17 
 
 		 850 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  30.95 
 
 		 850 aa  139  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4027  hypothetical protein  34.46 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1145  hypothetical protein  34.4 
 
 		 312 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0504  hypothetical protein  29.51 
 
 		 351 aa  137  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.579853 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1656  hypothetical protein  33.02 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0333336  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0267  hypothetical protein  33.11 
 
 		 692 aa  136  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  30.61 
 
 		 850 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1324  hypothetical protein  31.45 
 
 		 368 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  30.61 
 
 		 850 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3194  integral membrane protein-like protein  29.43 
 
 		 393 aa  134  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00740284  decreased coverage  0.00804794 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1091  hypothetical protein  31.68 
 
 		 376 aa  134  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3203  hypothetical protein  31.82 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.030051 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1469  hypothetical protein  31.11 
 
 		 368 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0291454  normal  0.344342 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2169  integral membrane protein-like protein  31.76 
 
 		 338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3833  hypothetical protein  31.25 
 
 		 353 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00492954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5547  hypothetical protein  29.94 
 
 		 364 aa  129  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0563067  normal  0.327902 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5128  hypothetical protein  29.62 
 
 		 320 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79824  normal  0.0594862 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0832  hypothetical protein  30 
 
 		 314 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5004  hypothetical protein  29.47 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0901  hypothetical protein  32.65 
 
 		 329 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  31 
 
 		 867 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0977  hypothetical protein  31.01 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0804  hypothetical protein  32.31 
 
 		 313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1006  protein of unknown function DUF470  31.01 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2688  hypothetical protein  28.83 
 
 		 343 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2915  hypothetical protein  28.83 
 
 		 343 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3589  hypothetical protein  28.53 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106529  hitchhiker  0.00246674 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  29.25 
 
 		 867 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4044  hypothetical protein  30.4 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2810  putative membrane protein of unknown function  28.88 
 
 		 351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  28.24 
 
 		 870 aa  119  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0841  integral membrane protein-like protein  26 
 
 		 339 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.18385 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0161  integral membrane protein  29.9 
 
 		 584 aa  119  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0150458 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  29.63 
 
 		 877 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1658  hypothetical protein  28.33 
 
 		 356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1041  hypothetical protein  27.67 
 
 		 368 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  29.05 
 
 		 881 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  28.66 
 
 		 875 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  30.51 
 
 		 872 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5424  hypothetical protein  29.49 
 
 		 320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06897  hitchhiker  0.00740076 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1342  hypothetical protein  30.04 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.481458  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5838  hypothetical protein  34.78 
 
 		 378 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  27.54 
 
 		 869 aa  109  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  28.52 
 
 		 739 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1503  hypothetical protein  27.39 
 
 		 317 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1476  hypothetical protein  27.39 
 
 		 317 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1045  hypothetical protein  28.03 
 
 		 517 aa  105  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000634893  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2647  hypothetical protein  30.56 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.412337 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  26.01 
 
 		 872 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  31.36 
 
 		 866 aa  99.8  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3502  hypothetical protein  28.95 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1685  hypothetical protein  30.24 
 
 		 516 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  25.33 
 
 		 880 aa  94.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  26.73 
 
 		 871 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  26.73 
 
 		 871 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  25.33 
 
 		 880 aa  94.7  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  29.17 
 
 		 863 aa  88.6  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  29.17 
 
 		 863 aa  88.6  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5038  hypothetical protein  27.18 
 
 		 333 aa  87  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00557373 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  25.17 
 
 		 864 aa  87  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  25.95 
 
 		 864 aa  86.7  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  27.78 
 
 		 813 aa  85.9  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  26.06 
 
 		 854 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2497  hypothetical protein  28.57 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  28.68 
 
 		 896 aa  85.1  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2633  hypothetical protein  29.58 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.390769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3263  hypothetical protein  29.41 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1467  hypothetical protein  28.78 
 
 		 635 aa  84.7  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0012  hypothetical protein  28.98 
 
 		 340 aa  82.4  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  31.16 
 
 		 864 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  31.62 
 
 		 844 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>