More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2846 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 289 aa  587  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  68.17 
 
 		 289 aa  397  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  68.57 
 
 		 293 aa  395  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  68.57 
 
 		 293 aa  395  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  67.36 
 
 		 291 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  65.95 
 
 		 300 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  64.29 
 
 		 309 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  52.13 
 
 		 283 aa  290  3e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  52.14 
 
 		 276 aa  286  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  47.52 
 
 		 282 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 281 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 282 aa  281  7.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  48.55 
 
 		 283 aa  273  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 283 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  48.75 
 
 		 281 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  47.67 
 
 		 280 aa  269  4e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  47.67 
 
 		 280 aa  269  5e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  50 
 
 		 289 aa  269  5e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 		 278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  47.14 
 
 		 280 aa  265  5.999999999999999e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  46.1 
 
 		 282 aa  263  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  49.48 
 
 		 288 aa  263  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  51.25 
 
 		 278 aa  263  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  53.31 
 
 		 277 aa  261  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  46.57 
 
 		 280 aa  261  1e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0476  pantoate--beta-alanine ligase  47.14 
 
 		 281 aa  261  1e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  47.83 
 
 		 281 aa  259  4e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  45.88 
 
 		 281 aa  258  9e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  46.38 
 
 		 281 aa  258  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 281 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  49.65 
 
 		 287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 		 291 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  48.59 
 
 		 286 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.56 
 
 		 529 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  45.88 
 
 		 282 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  45.74 
 
 		 282 aa  251  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  44.6 
 
 		 286 aa  249  3e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  47.9 
 
 		 285 aa  249  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  47.48 
 
 		 280 aa  249  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  46.29 
 
 		 283 aa  249  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  44.68 
 
 		 282 aa  248  9e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  44.68 
 
 		 282 aa  248  9e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 283 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  47.31 
 
 		 283 aa  248  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  45.94 
 
 		 283 aa  247  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  45.94 
 
 		 283 aa  247  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  44.68 
 
 		 282 aa  247  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  49.07 
 
 		 281 aa  246  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  45.94 
 
 		 284 aa  246  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  44.48 
 
 		 284 aa  247  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  43.99 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  48.33 
 
 		 281 aa  246  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  44.33 
 
 		 282 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  44.33 
 
 		 282 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  45.94 
 
 		 283 aa  246  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  44.52 
 
 		 284 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  47.64 
 
 		 288 aa  246  4e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  48.97 
 
 		 287 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  44.52 
 
 		 284 aa  245  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  44.33 
 
 		 282 aa  245  6e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  49.06 
 
 		 281 aa  245  6e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  45.58 
 
 		 283 aa  245  6.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  45.58 
 
 		 283 aa  245  6.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  45.58 
 
 		 283 aa  245  6.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  46.07 
 
 		 279 aa  245  6.999999999999999e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  44.52 
 
 		 284 aa  245  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  48.7 
 
 		 281 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  44.52 
 
 		 284 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  42.43 
 
 		 539 aa  244  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  44.52 
 
 		 284 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  48.62 
 
 		 287 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  52.36 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  48.78 
 
 		 287 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  45.23 
 
 		 283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  45.23 
 
 		 283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  45.96 
 
 		 284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  45.96 
 
 		 284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  45.96 
 
 		 284 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  45.23 
 
 		 283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 280 aa  243  3e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  43.62 
 
 		 282 aa  243  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  44.76 
 
 		 283 aa  243  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  45.23 
 
 		 284 aa  243  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  44.29 
 
 		 289 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  47.96 
 
 		 281 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  47.96 
 
 		 281 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1707  pantoate--beta-alanine ligase  43.97 
 
 		 282 aa  242  5e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  43.62 
 
 		 282 aa  242  5e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  47.58 
 
 		 281 aa  241  7e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  45.16 
 
 		 283 aa  241  7e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  47.1 
 
 		 279 aa  241  1e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  48.16 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  46.01 
 
 		 277 aa  241  1e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  48.01 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  41.58 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  47.21 
 
 		 281 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  41.58 
 
 		 282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  45.02 
 
 		 286 aa  239  4e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  48.3 
 
 		 273 aa  239  4e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  47.18 
 
 		 283 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>