More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4995 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4995  ABC transporter, transmembrane region  100 
 
 		 605 aa  1233    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0356136  normal  0.528337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0762  ABC transporter related  65.5 
 
 		 605 aa  816    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4843  ABC transporter related  70.2 
 
 		 605 aa  901    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0733  ABC transporter related  64.83 
 
 		 605 aa  814    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0731  ABC transporter related  67.88 
 
 		 605 aa  831    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.91 
 
 		 598 aa  291  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  34.4 
 
 		 578 aa  286  1.0000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  35.49 
 
 		 567 aa  282  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  35.15 
 
 		 572 aa  281  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  35.49 
 
 		 567 aa  281  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  35.67 
 
 		 582 aa  278  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  32.9 
 
 		 601 aa  277  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  35.08 
 
 		 572 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  35.48 
 
 		 582 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  32.27 
 
 		 636 aa  275  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  34.28 
 
 		 610 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  38.15 
 
 		 728 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  34.92 
 
 		 575 aa  274  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0839  ABC transporter related  32.23 
 
 		 590 aa  273  6e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000691959  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  35.24 
 
 		 582 aa  272  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  32.1 
 
 		 575 aa  272  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  32.82 
 
 		 584 aa  272  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  32.99 
 
 		 591 aa  271  2.9999999999999997e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  34.53 
 
 		 566 aa  271  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  32.95 
 
 		 576 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  34.39 
 
 		 596 aa  271  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.79 
 
 		 567 aa  270  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  34.44 
 
 		 582 aa  270  5e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  32.94 
 
 		 580 aa  270  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  32.41 
 
 		 601 aa  269  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  31.1 
 
 		 595 aa  269  1e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  37.1 
 
 		 728 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.35 
 
 		 613 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3493  ABC transporter related  36.81 
 
 		 608 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5374  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  31.4 
 
 		 590 aa  266  7e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.33633 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  33.95 
 
 		 579 aa  266  8.999999999999999e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2444  ABC transporter related  32.6 
 
 		 580 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  34.81 
 
 		 575 aa  265  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  35.67 
 
 		 595 aa  266  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0266  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.69 
 
 		 632 aa  265  2e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.57 
 
 		 572 aa  265  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  29.77 
 
 		 579 aa  264  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  33.66 
 
 		 603 aa  264  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5296  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  31.41 
 
 		 590 aa  264  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.859182  normal  0.362454 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  34.51 
 
 		 725 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  34.89 
 
 		 596 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4829  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  31.41 
 
 		 590 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.311889 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1273  ABC-type transport system ATPase  33.27 
 
 		 622 aa  263  6e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.788537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  33.07 
 
 		 603 aa  263  6e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1690  ABC transporter related  29.71 
 
 		 607 aa  263  6.999999999999999e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1890  ABC transporter related  33.27 
 
 		 607 aa  263  6.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  31.28 
 
 		 571 aa  263  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.28 
 
 		 571 aa  263  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  32.78 
 
 		 572 aa  262  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  33 
 
 		 603 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.28 
 
 		 571 aa  261  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.28 
 
 		 571 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  34.24 
 
 		 764 aa  262  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  33.01 
 
 		 669 aa  262  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  33.47 
 
 		 594 aa  262  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.28 
 
 		 571 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  32.8 
 
 		 644 aa  261  2e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4878  response regulator receiver protein  34.61 
 
 		 991 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.360645  normal  0.0233171 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  34.61 
 
 		 587 aa  261  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3801  response regulator receiver protein  34.61 
 
 		 981 aa  261  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19150  ABC transporter, composite transmembrane permease and ATP binding components  33.66 
 
 		 615 aa  260  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0954  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  33.67 
 
 		 596 aa  260  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  35.16 
 
 		 596 aa  260  4e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.11 
 
 		 571 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0853  ABC transporter-related protein  31.07 
 
 		 591 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3526  ABC transporter related  33.09 
 
 		 598 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  33.07 
 
 		 582 aa  260  6e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1595  ABC transporter related  34.06 
 
 		 607 aa  260  7e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00338699  normal  0.481245 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0597  ABC transporter related  33.27 
 
 		 596 aa  260  7e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.51 
 
 		 596 aa  259  8e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1782  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.8 
 
 		 588 aa  259  8e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.11 
 
 		 571 aa  259  8e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3356  ABC transporter related  33.09 
 
 		 594 aa  259  8e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0405132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0009  ABC transporter related  40.05 
 
 		 597 aa  259  8e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.11 
 
 		 571 aa  259  9e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0682  ABC transporter related  34.63 
 
 		 606 aa  259  9e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  31.82 
 
 		 556 aa  259  9e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1909  ABC transporter related  31.62 
 
 		 672 aa  259  9e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1830  ABC transporter related  34.64 
 
 		 596 aa  259  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  37.83 
 
 		 623 aa  259  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.11 
 
 		 571 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1783  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.8 
 
 		 588 aa  258  2e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  40.47 
 
 		 768 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3236  ABC transporter related  31.83 
 
 		 598 aa  258  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00224105  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4572  ABC transporter, transmembrane region  33.65 
 
 		 546 aa  258  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  34.32 
 
 		 578 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  33.81 
 
 		 568 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  33.07 
 
 		 620 aa  258  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5251  response regulator receiver protein  36.26 
 
 		 893 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0456799 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0988  ABC transporter related  32.6 
 
 		 591 aa  258  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.026388 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  31.11 
 
 		 571 aa  258  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1001  ABC transporter related protein  32.44 
 
 		 593 aa  258  3e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.97 
 
 		 579 aa  258  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2102  ABC transporter related  36.32 
 
 		 623 aa  258  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  32.41 
 
 		 606 aa  258  3e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>