More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2421 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2421  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  100 
 
 		 684 aa  1399    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243595 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  40.24 
 
 		 652 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  47.96 
 
 		 1629 aa  475  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4228  winged helix family two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 509 aa  379  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.290807  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  39.26 
 
 		 799 aa  340  5e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4548  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  37 
 
 		 614 aa  303  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.06 
 
 		 224 aa  302  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1629  multi-component transcriptional regulator  37.9 
 
 		 613 aa  290  4e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.703021  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.16 
 
 		 224 aa  287  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.71 
 
 		 224 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3722  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.62 
 
 		 635 aa  280  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.940611  normal  0.125775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1723  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  34.48 
 
 		 597 aa  280  7e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000776738 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3668  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.62 
 
 		 635 aa  280  8e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.21 
 
 		 226 aa  279  9e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.01 
 
 		 225 aa  277  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.01 
 
 		 225 aa  277  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  59.01 
 
 		 225 aa  274  5.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3505  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43 
 
 		 665 aa  263  6.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.6 
 
 		 224 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3139  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.81 
 
 		 676 aa  255  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.990746 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0163  multi-component transcriptional regulator  51.74 
 
 		 725 aa  250  7e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.892768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0298  winged helix family two component transcriptional regulator  57.21 
 
 		 230 aa  223  7e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.88518  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.09 
 
 		 234 aa  214  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  45.7 
 
 		 231 aa  194  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.24 
 
 		 225 aa  193  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 224 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1212  two component transcriptional regulator  44.21 
 
 		 232 aa  184  6e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0899901  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  42.6 
 
 		 222 aa  183  9.000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3626  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.42 
 
 		 231 aa  180  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2487  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.42 
 
 		 231 aa  180  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 231 aa  179  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 235 aa  177  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 230 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 241 aa  177  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 230 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 230 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 231 aa  177  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 224 aa  177  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 231 aa  177  7e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 242 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  42.17 
 
 		 250 aa  176  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.89 
 
 		 224 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 219 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1142  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 		 227 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 240 aa  174  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 283 aa  174  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  44.75 
 
 		 220 aa  174  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1620  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 		 227 aa  174  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000174219  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  44.29 
 
 		 220 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 227 aa  173  7.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1581  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40.71 
 
 		 223 aa  173  9e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03590  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  40.53 
 
 		 226 aa  173  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0594239 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 227 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  43.84 
 
 		 220 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2647  response regulator receiver domain-containing protein  42.92 
 
 		 224 aa  172  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.1 
 
 		 219 aa  173  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 219 aa  173  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 250 aa  172  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  43.84 
 
 		 220 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 228 aa  172  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  40.79 
 
 		 237 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  40.53 
 
 		 230 aa  172  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 235 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 221 aa  171  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.38 
 
 		 220 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.44 
 
 		 224 aa  171  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1012  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 257 aa  171  4e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.658807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 220 aa  171  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  40.97 
 
 		 223 aa  171  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 227 aa  171  5e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0295  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.75 
 
 		 242 aa  170  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0307  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.75 
 
 		 242 aa  170  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  43.36 
 
 		 228 aa  170  8e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  37.84 
 
 		 224 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 227 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 227 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.99 
 
 		 219 aa  169  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0057  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.08 
 
 		 225 aa  169  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 225 aa  169  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2674  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 		 230 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238816  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  37.39 
 
 		 224 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 236 aa  168  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 220 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0485  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  39.73 
 
 		 244 aa  168  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.74 
 
 		 214 aa  167  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3337  two component response regulator  38.74 
 
 		 221 aa  167  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13760  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.47 
 
 		 225 aa  167  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  40.71 
 
 		 232 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 224 aa  167  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  41.44 
 
 		 224 aa  167  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  43.38 
 
 		 220 aa  167  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_004310  BR0604  DNA-binding response regulator  40.97 
 
 		 229 aa  166  9e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  36.78 
 
 		 246 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  39.04 
 
 		 238 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  41.55 
 
 		 223 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 239 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 233 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2177  response regulator receiver protein  40.36 
 
 		 223 aa  166  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.44 
 
 		 223 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0603  DNA-binding response regulator  41.56 
 
 		 229 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>