60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1022 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1022  exopolysaccharide synthesis, ExoD  100 
 
 		 210 aa  417  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0915242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4949  Exopolysaccharide synthesis ExoD  56.12 
 
 		 198 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.811076 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1212  Exopolysaccharide synthesis ExoD  58.38 
 
 		 201 aa  222  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1242  Exopolysaccharide synthesis ExoD  58.38 
 
 		 201 aa  222  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3473  exopolysaccharide synthesis ExoD  34.26 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0369  exopolysaccharide synthesis, ExoD  37.35 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3754  Exopolysaccharide synthesis ExoD  31.79 
 
 		 189 aa  89  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3452  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.81 
 
 		 219 aa  88.6  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2365  Exopolysaccharide synthesis ExoD  34.46 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4288  exopolysaccharide synthesis protein, putative  29.81 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2415  Exopolysaccharide synthesis ExoD  34.46 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4959  exopolysaccharide synthesis ExoD  28.57 
 
 		 203 aa  84.7  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.938152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1827  exopolysaccharide synthesis, ExoD  33.15 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2622  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.23 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512151  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4382  Exopolysaccharide synthesis ExoD  32.11 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0680521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4269  exopolysaccharide synthesis ExoD  28.49 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528198  decreased coverage  0.0088823 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2869  exopolysaccharide synthesis, ExoD  32.07 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0769  exopolysaccharide synthesis protein  27.22 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0140556  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0150  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  29.41 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0209  exopolysaccharide synthesis protein  34.5 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.742112  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2814  exopolysaccharide synthesis, ExoD  34.57 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0151  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  30 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1368  exopolysaccharide synthesis protein  28.42 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0481317  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1428  exopolysaccharide synthesis protein ExoD  28.42 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3870  uncharacterized ABC-type transport system permease protein  30.59 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0307  exopolysaccharide synthesis, ExoD  25 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3786  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.7 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232502  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2728  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.07 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0212409 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1302  exopolysaccharide synthesis, ExoD  31.36 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1479  exopolysaccharide synthesis ExoD  24.86 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.438541  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0979  Exopolysaccharide synthesis ExoD  31.06 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2866  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.05 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1099  hypothetical protein  29.69 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0863  exopolysaccharide synthesis ExoD  30.85 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2346  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.56 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1096  hypothetical protein  28.89 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2945  exopolysaccharide synthesis, ExoD  32.24 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0152237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1193  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.81 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1063  exopolysaccharide synthesis ExoD  30.97 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.0691712 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1027  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.59 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01796  Exopolysaccharide synthesis, ExoD  23.12 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0457786  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00184  ExoD protein  27.47 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.358269  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1440  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.75 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2195  exopolysaccharide synthesis ExoD  25.43 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1981  ABC transporter permease  25 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5451  exopolysaccharide synthesis ExoD  26.74 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5628  exopolysaccharide synthesis ExoD  31.64 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.411355  normal  0.038562 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2725  exopolysaccharide synthesis, ExoD  26.55 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0922  Exopolysaccharide synthesis ExoD  24.35 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.93119e-33 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4172  exopolysaccharide synthesis, ExoD  25.4 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000786793  normal  0.185707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3324  Exopolysaccharide synthesis ExoD  24.35 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183092  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1715  uncharacterized ABC-type transport system permease component-like protein  26.32 
 
 		 177 aa  52  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1758  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.22 
 
 		 260 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3868  molybdate ABC transporter inner membrane protein  25.4 
 
 		 195 aa  52  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175484  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4082  hypothetical protein  22.92 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269354  normal  0.0311141 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5009  exoD protein  28.09 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5360  hypothetical protein  23.83 
 
 		 317 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  hitchhiker  0.00309893 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6438  exopolysaccharide synthesis ExoD  26.75 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2718  exopolysaccharide synthesis, ExoD  21.51 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0682  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.14 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>