More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3693 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3440  allantoinase  93.96 
 
 
447 aa  851    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3693  allantoinase  100 
 
 
447 aa  909    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2026  allantoinase  77.4 
 
 
449 aa  723    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3169  allantoinase  76.47 
 
 
455 aa  712    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  65.38 
 
 
446 aa  597  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08130  allantoinase  67.73 
 
 
503 aa  592  1e-168  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2590  allantoinase  63.55 
 
 
476 aa  558  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247318  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2841  allantoinase  62.41 
 
 
450 aa  536  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0714  allantoinase  58.2 
 
 
449 aa  508  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.866042  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4726  allantoinase  58.49 
 
 
443 aa  490  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2778  allantoinase  58.14 
 
 
457 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5937  allantoinase  59.55 
 
 
569 aa  449  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2550  allantoinase  54.09 
 
 
435 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0293487  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2077  Allantoinase  56.06 
 
 
473 aa  441  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0235  allantoinase  52.4 
 
 
442 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5681  allantoinase  49.68 
 
 
480 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2784  allantoinase  50.11 
 
 
468 aa  402  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0839  allantoinase  48.9 
 
 
453 aa  384  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  42.98 
 
 
448 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4867  putative allantoinase  44.72 
 
 
473 aa  362  1e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04603  allantoinase (Eurofung)  45.1 
 
 
506 aa  343  5e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0105503  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00740  allantoinase, putative  46.41 
 
 
481 aa  316  6e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260502  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  37.5 
 
 
449 aa  285  1.0000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  38.19 
 
 
461 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  35.24 
 
 
453 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  35.24 
 
 
453 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  35.24 
 
 
453 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  35.24 
 
 
453 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  34.78 
 
 
453 aa  271  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  34.78 
 
 
453 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  34.78 
 
 
453 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  34.55 
 
 
453 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  34.55 
 
 
453 aa  268  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  36.81 
 
 
448 aa  268  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  34.55 
 
 
453 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  34.55 
 
 
453 aa  266  4e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  35.49 
 
 
449 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.42 
 
 
454 aa  260  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  33.93 
 
 
458 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  34.99 
 
 
452 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.55 
 
 
494 aa  213  3.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0962  dihydroorotase  33.64 
 
 
474 aa  212  9e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.414994  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.68 
 
 
457 aa  210  4e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34891  Allantoinase  42.24 
 
 
579 aa  208  1e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.93559  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0624  amidohydrolase  32.7 
 
 
394 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  34.03 
 
 
431 aa  186  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  31.6 
 
 
446 aa  186  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  31.09 
 
 
442 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35101  predicted protein  35.14 
 
 
570 aa  185  1.0000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  32.08 
 
 
432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  33.11 
 
 
429 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  31 
 
 
445 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  32.81 
 
 
446 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  31.53 
 
 
446 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  30.63 
 
 
444 aa  179  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  32.51 
 
 
446 aa  179  8e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7538  allantoinase protein  34.13 
 
 
458 aa  179  8e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  31.59 
 
 
454 aa  178  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  31.88 
 
 
456 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  31.88 
 
 
456 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  29.79 
 
 
444 aa  177  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  29.79 
 
 
444 aa  176  6e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  31.88 
 
 
456 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  29.4 
 
 
441 aa  176  9e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  28.22 
 
 
447 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.22 
 
 
447 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.25 
 
 
429 aa  173  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  31.9 
 
 
445 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  29.7 
 
 
440 aa  172  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  32.56 
 
 
426 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.27 
 
 
424 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  30.22 
 
 
442 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.7 
 
 
429 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.09 
 
 
424 aa  170  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  31.14 
 
 
468 aa  170  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  30.9 
 
 
458 aa  170  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.04 
 
 
425 aa  169  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0124  dihydroorotase  29.91 
 
 
430 aa  169  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00282243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  30.25 
 
 
441 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  29.64 
 
 
444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.22 
 
 
428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.6 
 
 
425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.26 
 
 
425 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  29.64 
 
 
444 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  28.67 
 
 
444 aa  166  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  31 
 
 
425 aa  166  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  30.54 
 
 
464 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  32.02 
 
 
431 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  31.45 
 
 
445 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1709  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.92 
 
 
433 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11551  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  29.66 
 
 
444 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5703  amidohydrolase  32.88 
 
 
454 aa  163  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0693398  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  29.98 
 
 
465 aa  162  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.65 
 
 
434 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  31.58 
 
 
442 aa  161  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4635  Allantoinase  32.34 
 
 
459 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453471  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  31.06 
 
 
436 aa  160  4e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  28.02 
 
 
453 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  32.92 
 
 
488 aa  159  7e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  30.96 
 
 
430 aa  159  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.32072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>