More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1554 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1554  preprotein translocase, SecY subunit  100 
 
 		 424 aa  841    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0492066  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  45.65 
 
 		 418 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  44.73 
 
 		 420 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  44.29 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  43.96 
 
 		 435 aa  372  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  44.26 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  43.95 
 
 		 429 aa  360  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  43.16 
 
 		 423 aa  350  3e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4934  preprotein translocase, SecY subunit  43.34 
 
 		 439 aa  349  5e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000290796  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2923  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.99 
 
 		 427 aa  349  7e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000208113  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  42.59 
 
 		 419 aa  347  2e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  42.99 
 
 		 419 aa  346  4e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  42.36 
 
 		 435 aa  346  4e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  40.47 
 
 		 435 aa  346  5e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  44.74 
 
 		 447 aa  345  6e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  44.5 
 
 		 447 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  44.47 
 
 		 445 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  41.16 
 
 		 435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  42.21 
 
 		 429 aa  342  5e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  42.17 
 
 		 428 aa  343  5e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  44.5 
 
 		 447 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  43.19 
 
 		 419 aa  341  2e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  42.07 
 
 		 435 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  43.13 
 
 		 457 aa  338  9.999999999999999e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  42.34 
 
 		 444 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  42.62 
 
 		 421 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  40.78 
 
 		 437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  42.82 
 
 		 453 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  43.29 
 
 		 431 aa  336  5e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  40.05 
 
 		 435 aa  336  5e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  41.84 
 
 		 435 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  41.26 
 
 		 435 aa  335  5.999999999999999e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3647  preprotein translocase, SecY subunit  41.4 
 
 		 442 aa  335  7e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00118801  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  41.53 
 
 		 421 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  40.74 
 
 		 435 aa  333  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  41.71 
 
 		 443 aa  333  5e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  39.49 
 
 		 437 aa  332  6e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  42.18 
 
 		 443 aa  332  9e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  41.09 
 
 		 443 aa  332  9e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  39.39 
 
 		 437 aa  331  2e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1735  preprotein translocase subunit SecY  43.06 
 
 		 452 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  41.75 
 
 		 442 aa  329  5.0000000000000004e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  42.38 
 
 		 437 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  41.77 
 
 		 445 aa  329  6e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  40.81 
 
 		 446 aa  329  7e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  40.19 
 
 		 446 aa  328  8e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0381  preprotein translocase subunit SecY  42.82 
 
 		 452 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  40.14 
 
 		 419 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  42.09 
 
 		 438 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  41.15 
 
 		 444 aa  327  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  41.45 
 
 		 443 aa  327  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  40.19 
 
 		 446 aa  327  3e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  40.72 
 
 		 437 aa  327  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  41.45 
 
 		 443 aa  327  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  39.95 
 
 		 446 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  42.24 
 
 		 445 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  43.12 
 
 		 422 aa  325  7e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0951  preprotein translocase, SecY subunit  42.35 
 
 		 448 aa  325  8.000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.830582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  37.8 
 
 		 463 aa  325  8.000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  41.47 
 
 		 443 aa  325  9e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  39.53 
 
 		 440 aa  325  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  40.23 
 
 		 443 aa  325  1e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  40.85 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  41.57 
 
 		 443 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  39.91 
 
 		 443 aa  324  2e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  40.5 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  40.36 
 
 		 438 aa  323  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  40.14 
 
 		 432 aa  323  3e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080  preprotein translocase subunit SecY  42.22 
 
 		 441 aa  323  3e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0404503  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  40.43 
 
 		 446 aa  323  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  39.67 
 
 		 434 aa  323  4e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  40.9 
 
 		 437 aa  323  4e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2633  preprotein translocase, SecY subunit  42.73 
 
 		 431 aa  322  6e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3123  preprotein translocase, SecY subunit  43.15 
 
 		 436 aa  322  7e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0340  preprotein translocase subunit SecY  39.72 
 
 		 443 aa  322  8e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00542322  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  41.47 
 
 		 443 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  41.57 
 
 		 442 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0973  preprotein translocase subunit SecY  39.73 
 
 		 428 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  37.98 
 
 		 443 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  37.98 
 
 		 443 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  40.82 
 
 		 446 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  40.22 
 
 		 441 aa  320  3e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  40.09 
 
 		 436 aa  320  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  37.98 
 
 		 442 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000898122  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  41.39 
 
 		 443 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  39.74 
 
 		 445 aa  319  5e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  37.98 
 
 		 443 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  37.98 
 
 		 443 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000433507 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  40.79 
 
 		 441 aa  319  6e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0582  preprotein translocase subunit SecY  41.31 
 
 		 435 aa  319  7e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  41.23 
 
 		 448 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  37.98 
 
 		 444 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  37.85 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  37.98 
 
 		 444 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  39 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  40.76 
 
 		 446 aa  318  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1374  preprotein translocase subunit SecY  38.02 
 
 		 431 aa  318  1e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0289241  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  40.19 
 
 		 448 aa  318  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2514  preprotein translocase subunit SecY  41.97 
 
 		 452 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  39.42 
 
 		 441 aa  317  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>