More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1496 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1496  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 851 aa  1709    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6683  UvrD/REP helicase  27.38 
 
 		 966 aa  270  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0759039  normal  0.87543 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  26.76 
 
 		 946 aa  177  7e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  26.76 
 
 		 946 aa  177  7e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_917  predicted protein  27.02 
 
 		 657 aa  156  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.770015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0230  UvrD/REP helicase  25.49 
 
 		 751 aa  156  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.381446  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  25.57 
 
 		 787 aa  153  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.35 
 
 		 729 aa  145  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.55 
 
 		 731 aa  144  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  25.23 
 
 		 735 aa  144  8e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  25.43 
 
 		 672 aa  144  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  25.59 
 
 		 735 aa  143  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0674  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.96 
 
 		 734 aa  143  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  27.27 
 
 		 625 aa  142  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  24.14 
 
 		 768 aa  142  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  27.73 
 
 		 655 aa  141  6e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  25.89 
 
 		 741 aa  140  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  24.47 
 
 		 728 aa  140  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  24.1 
 
 		 726 aa  139  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  25.35 
 
 		 728 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  25.35 
 
 		 728 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  25.24 
 
 		 728 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.16 
 
 		 751 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.16 
 
 		 753 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  25.49 
 
 		 744 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.08 
 
 		 751 aa  137  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.08 
 
 		 747 aa  137  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 		 747 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  25 
 
 		 753 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  25 
 
 		 751 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  25.2 
 
 		 721 aa  136  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.84 
 
 		 753 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  25.59 
 
 		 728 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 		 751 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  23.99 
 
 		 720 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  23.99 
 
 		 720 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  25.59 
 
 		 728 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  25.7 
 
 		 743 aa  136  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.61 
 
 		 743 aa  136  1.9999999999999998e-30  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  23.99 
 
 		 720 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  23.99 
 
 		 720 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  24.45 
 
 		 706 aa  136  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  24.19 
 
 		 720 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  23.99 
 
 		 720 aa  135  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  24.19 
 
 		 720 aa  135  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  24.19 
 
 		 720 aa  135  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  24.19 
 
 		 720 aa  135  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  25.04 
 
 		 721 aa  135  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1536  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.91 
 
 		 768 aa  134  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  23.88 
 
 		 720 aa  134  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  23.88 
 
 		 720 aa  134  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  23.88 
 
 		 720 aa  134  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  23.88 
 
 		 720 aa  134  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  23.88 
 
 		 720 aa  134  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 705 aa  133  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.08 
 
 		 786 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  24.92 
 
 		 722 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  23.8 
 
 		 666 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  24.88 
 
 		 722 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.21 
 
 		 781 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.65 
 
 		 741 aa  132  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.88 
 
 		 747 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  25.35 
 
 		 735 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.62 
 
 		 739 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.15 
 
 		 748 aa  132  4.0000000000000003e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3440  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 682 aa  132  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.155249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  24.73 
 
 		 726 aa  132  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  24.61 
 
 		 722 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  24.53 
 
 		 724 aa  131  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  25.04 
 
 		 797 aa  131  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  24.14 
 
 		 723 aa  130  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.6 
 
 		 802 aa  130  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  24.73 
 
 		 722 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  25.67 
 
 		 723 aa  130  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  26.97 
 
 		 723 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546872  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1120  UvrD/REP helicase  23.21 
 
 		 728 aa  130  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169782  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  24.73 
 
 		 722 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  24.72 
 
 		 722 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  24.72 
 
 		 722 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  25.86 
 
 		 816 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  24.73 
 
 		 722 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  24.73 
 
 		 722 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  23.22 
 
 		 739 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.11 
 
 		 745 aa  129  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1824  UvrD/REP helicase  23.51 
 
 		 679 aa  129  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000550793  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  25.86 
 
 		 729 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.53 
 
 		 742 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0437  UvrD/REP helicase  26.91 
 
 		 682 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1666  UvrD/REP helicase  21.41 
 
 		 921 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.921097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0497  DNA-dependent helicase II  25.47 
 
 		 726 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.615928  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3979  DNA-dependent helicase II  23.64 
 
 		 720 aa  129  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0053327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  24.58 
 
 		 772 aa  129  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  24.13 
 
 		 724 aa  129  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  26.36 
 
 		 779 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  24.92 
 
 		 668 aa  128  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  24.81 
 
 		 727 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  23.89 
 
 		 721 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  24.42 
 
 		 721 aa  128  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  23.66 
 
 		 707 aa  128  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  24.62 
 
 		 744 aa  127  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>