228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1121 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1121  degV family protein  100 
 
 		 294 aa  616  1e-175  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0606  DegV family protein  43.64 
 
 		 295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1558  DegV family protein  43.49 
 
 		 295 aa  281  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1061  degV family protein  38.14 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0946944  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1056  degV family protein  37.37 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  34.83 
 
 		 292 aa  176  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10840  degV family protein  32.63 
 
 		 291 aa  166  4e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00470044  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3275  degV family protein  31.88 
 
 		 292 aa  162  7e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632597  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16140  hypothetical protein  33.73 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224707 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  33.68 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2064  hypothetical protein  31.03 
 
 		 289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0791292  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  32.31 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  29.8 
 
 		 291 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3343  degV family protein  30 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000215363  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  29.66 
 
 		 286 aa  143  4e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  33.1 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1150  degV family protein  31.01 
 
 		 309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.444716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  30.34 
 
 		 287 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  30.46 
 
 		 291 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09150  hypothetical protein  30.56 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000277277  normal  0.476622 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  29.31 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  31.8 
 
 		 286 aa  136  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  31.8 
 
 		 286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  31.45 
 
 		 286 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  32.28 
 
 		 281 aa  135  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  31.45 
 
 		 286 aa  135  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  31.45 
 
 		 286 aa  135  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  31.45 
 
 		 286 aa  135  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  31.45 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  31.8 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06330  degV family protein  28.67 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.139961 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  31.1 
 
 		 286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  31.1 
 
 		 286 aa  132  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  29.43 
 
 		 279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  27.11 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09160  degV family protein  28.87 
 
 		 311 aa  123  3e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.356982  normal  0.378413 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  29.39 
 
 		 281 aa  119  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  32.5 
 
 		 281 aa  116  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  30.77 
 
 		 299 aa  116  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  26.64 
 
 		 303 aa  115  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  29.79 
 
 		 282 aa  116  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  27.11 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  27.11 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  30.04 
 
 		 283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  28.72 
 
 		 280 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  28.07 
 
 		 282 aa  108  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  29.23 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0982  degV family protein  26.26 
 
 		 342 aa  106  5e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  28.99 
 
 		 285 aa  106  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  29.31 
 
 		 280 aa  105  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  27.84 
 
 		 281 aa  106  6e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0022  degV family protein  27.11 
 
 		 288 aa  105  7e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.314645  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  26.9 
 
 		 637 aa  105  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  28.03 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  28.18 
 
 		 281 aa  102  7e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0171  DegV family protein  26.71 
 
 		 276 aa  102  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  27.82 
 
 		 280 aa  102  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  26.32 
 
 		 281 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  24.48 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  31.82 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  26.32 
 
 		 282 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  34.51 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  27.46 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  27.92 
 
 		 281 aa  99.8  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1656  hypothetical protein  27.15 
 
 		 281 aa  99.8  5e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  27.96 
 
 		 279 aa  99.8  5e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1266  degV family protein  27.3 
 
 		 276 aa  99.4  6e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  25.08 
 
 		 284 aa  99.4  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  29.52 
 
 		 281 aa  99  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  24.91 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  26.1 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  25.44 
 
 		 282 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  27.03 
 
 		 280 aa  98.2  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  26.1 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  28.67 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  26.35 
 
 		 280 aa  97.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  26.35 
 
 		 280 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  26.1 
 
 		 287 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  25.44 
 
 		 311 aa  96.7  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  25.51 
 
 		 280 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  26.86 
 
 		 312 aa  95.5  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  27.6 
 
 		 279 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  26.5 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  28.62 
 
 		 285 aa  94.7  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  26.97 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  27.72 
 
 		 277 aa  94  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  27.9 
 
 		 279 aa  93.2  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1644  degV family protein  25.8 
 
 		 604 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.524877  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3161  degV family protein  27.61 
 
 		 283 aa  93.2  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  27.64 
 
 		 279 aa  93.6  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  26.06 
 
 		 280 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  26.06 
 
 		 280 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  26.41 
 
 		 280 aa  92.8  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  28.85 
 
 		 290 aa  92.8  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  26.17 
 
 		 282 aa  92  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  26.17 
 
 		 282 aa  92  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  27.9 
 
 		 279 aa  92  9e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  26.3 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  26.3 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0933  degV family protein  26.67 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>