190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1314 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1314  Radical SAM domain protein  100 
 
 
311 aa  649    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.263305 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1721  radical SAM domain-containing protein  59.58 
 
 
302 aa  373  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0327  Radical SAM domain protein  38.98 
 
 
281 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1167  radical SAM family protein  39.47 
 
 
261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000379498  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0182  radical SAM domain-containing protein  36.02 
 
 
256 aa  159  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2078  hypothetical protein  43.18 
 
 
182 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.583376 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1991  radical SAM domain-containing protein  30.88 
 
 
294 aa  123  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1782  radical SAM domain-containing protein  38.61 
 
 
281 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.425379  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0286  radical SAM domain-containing protein  38.3 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1409  radical SAM domain-containing protein  36.5 
 
 
267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47505  normal  0.209816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1963  radical SAM domain-containing protein  31.27 
 
 
389 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.003672  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  31.32 
 
 
350 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  31.42 
 
 
384 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  32.64 
 
 
377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1829  radical SAM domain-containing protein  36.84 
 
 
276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  32.02 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0739  Radical SAM domain protein  39.13 
 
 
245 aa  110  3e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.93142  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  30.86 
 
 
386 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2102  Radical SAM domain protein  29.55 
 
 
302 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0830  radical SAM domain-containing protein  38.54 
 
 
242 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0959  radical SAM domain-containing protein  36.92 
 
 
258 aa  108  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00609549  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0807  radical SAM domain-containing protein  38.54 
 
 
242 aa  107  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  30.54 
 
 
386 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  30.54 
 
 
393 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1926  radical SAM domain-containing protein  30.66 
 
 
288 aa  105  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0235565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1698  transporter  29.37 
 
 
325 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  30.96 
 
 
387 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28900  DNA repair photolyase  28.72 
 
 
350 aa  103  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  30.08 
 
 
390 aa  102  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  30.08 
 
 
390 aa  102  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4818  Radical SAM domain protein  31.49 
 
 
350 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  30.83 
 
 
385 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.290609 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0556  Radical SAM domain protein  35.68 
 
 
258 aa  101  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.162631  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  31.17 
 
 
386 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  30.83 
 
 
385 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  30.83 
 
 
385 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0729  radical SAM domain-containing protein  29.25 
 
 
345 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2161  radical SAM domain-containing protein  32.99 
 
 
373 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0231722 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1011  radical SAM domain-containing protein  34.1 
 
 
301 aa  99.8  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  32.93 
 
 
362 aa  100  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  29.58 
 
 
421 aa  99.4  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0922  radical SAM domain-containing protein  29.01 
 
 
387 aa  98.6  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56559  normal  0.49234 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1952  Radical SAM domain protein  29.12 
 
 
344 aa  98.6  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3183  Radical SAM domain protein  26.55 
 
 
370 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177318 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  30.3 
 
 
387 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  29.32 
 
 
390 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2296  radical SAM family protein  27.67 
 
 
341 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2343  radical SAM domain-containing protein  27.67 
 
 
341 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2335  radical SAM domain-containing protein  27.67 
 
 
358 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.799816  hitchhiker  0.00678012 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1725  radical SAM domain-containing protein  27.05 
 
 
349 aa  96.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2190  radical SAM domain-containing protein  34.2 
 
 
373 aa  96.3  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32306  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12598  hypothetical protein  28.85 
 
 
340 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  34.74 
 
 
380 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  30.89 
 
 
395 aa  94  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3517  Radical SAM domain protein  36.11 
 
 
390 aa  94  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  34.74 
 
 
374 aa  94  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  32.69 
 
 
363 aa  93.6  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  34.82 
 
 
366 aa  92.8  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4479  DNA repair photolyase-like protein  24.91 
 
 
320 aa  93.2  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.123605  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  28.95 
 
 
353 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2670  Radical SAM domain protein  27.51 
 
 
290 aa  92.4  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  28.87 
 
 
352 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4284  Radical SAM domain protein  29.83 
 
 
352 aa  91.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
362 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2004  Radical SAM domain protein  26.79 
 
 
368 aa  90.5  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  0.180359 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  32.18 
 
 
362 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6097  Radical SAM domain-containing protein  28.93 
 
 
338 aa  90.5  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2599  radical SAM domain-containing protein  29.62 
 
 
338 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  30.81 
 
 
437 aa  90.1  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0619  hypothetical protein  29.51 
 
 
290 aa  90.1  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 
372 aa  89.7  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  33.01 
 
 
352 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  32.78 
 
 
375 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1472  Radical SAM domain protein  34.2 
 
 
270 aa  89.4  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1281  radical SAM domain-containing protein  35.23 
 
 
294 aa  89.4  7e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  33.01 
 
 
352 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  29.64 
 
 
352 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  30.34 
 
 
352 aa  89  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3325  radical SAM family protein  32.98 
 
 
368 aa  88.6  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000113455 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0556  Radical SAM domain protein  31.63 
 
 
359 aa  88.6  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4095  radical SAM domain-containing protein  31.84 
 
 
362 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138855  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1419  radical SAM domain-containing protein  31.16 
 
 
359 aa  87.8  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1181  radical SAM family protein  33.51 
 
 
362 aa  87.4  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0204222  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0685  radical SAM domain-containing protein  30.09 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0316247 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2549  radical SAM family protein  33.17 
 
 
362 aa  87  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  29.56 
 
 
352 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  30.73 
 
 
356 aa  85.9  9e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1500  radical SAM family protein  31.46 
 
 
358 aa  85.1  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1469  radical SAM family protein  31.19 
 
 
360 aa  85.5  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.637197 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2906  radical SAM family protein  30.69 
 
 
306 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  32.63 
 
 
352 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  27.31 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2459  hypothetical protein  29.73 
 
 
354 aa  84.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0853217 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2293  Radical SAM domain protein  30.09 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.972622  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3675  radical SAM domain-containing protein  34.68 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.852388 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2803  radical SAM domain-containing protein  30.09 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.246146 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3344  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 
362 aa  84  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000768449  normal  0.0781434 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1163  radical SAM domain-containing protein  31.09 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000309895 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1220  radical SAM domain-containing protein  27.02 
 
 
329 aa  84  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0539702  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0708  radical SAM domain-containing protein  32.67 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>