288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1236 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1236  protein of unknown function DUF163  100 
 
 		 145 aa  297  4e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0319909  normal  0.195697 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1137  protein of unknown function DUF163  55.86 
 
 		 145 aa  156  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.240121  normal  0.0364065 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2319  hypothetical protein  45.52 
 
 		 145 aa  133  9e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1641  hypothetical protein  36.55 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.230899  normal  0.661833 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  35.9 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16031  hypothetical protein  40.28 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  36.54 
 
 		 156 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  36.54 
 
 		 156 aa  90.1  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  34.62 
 
 		 156 aa  90.1  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1183  hypothetical protein  38.3 
 
 		 144 aa  90.1  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  33.97 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  33.97 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  33.97 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  35.9 
 
 		 156 aa  88.2  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  35.71 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  35.26 
 
 		 156 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2291  hypothetical protein  33.56 
 
 		 155 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  35.26 
 
 		 156 aa  87  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  37.18 
 
 		 156 aa  87  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  37.18 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  37.18 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  37.18 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  37.18 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1070  rRNA large subunit methyltransferase  37.18 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  37.18 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  37.18 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3199  rRNA large subunit methyltransferase  35.48 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0492492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2393  rRNA large subunit methyltransferase  37.18 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  35.22 
 
 		 159 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  33.97 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  30.38 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1342  rRNA large subunit methyltransferase  35.9 
 
 		 156 aa  84.7  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1287  hypothetical protein  39.16 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2794  hypothetical protein  34.84 
 
 		 156 aa  84.3  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  37.01 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0780  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 159 aa  84  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329962  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  84  6e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0362  hypothetical protein  35.03 
 
 		 156 aa  83.6  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1993  rRNA large subunit methyltransferase  35.26 
 
 		 156 aa  83.6  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350093  normal  0.83098 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1707  rRNA large subunit methyltransferase  34.19 
 
 		 155 aa  83.6  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11098  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  34.81 
 
 		 165 aa  83.6  9e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2195  rRNA large subunit methyltransferase  35.9 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1738  protein of unknown function DUF163  31.41 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1902  rRNA large subunit methyltransferase  34.19 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0816634  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  31.41 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000142803  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2526  rRNA large subunit methyltransferase  34.84 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.631198  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  33.95 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0866  rRNA large subunit methyltransferase  34.19 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  28.3 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  34.19 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  35.71 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1733  rRNA large subunit methyltransferase  34.19 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0083  hypothetical protein  33.55 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000837778  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0083  hypothetical protein  33.55 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0170502  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2624  rRNA large subunit methyltransferase  36.13 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0866518  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  31.58 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0576  hypothetical protein  34.51 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.262239 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  32.26 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2439  hypothetical protein  42 
 
 		 173 aa  80.1  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  35.06 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3525  rRNA large subunit methyltransferase  32.9 
 
 		 155 aa  80.1  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144296  normal  0.0487834 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  33.33 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1544  hypothetical protein  35.26 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00441553  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09451  hypothetical protein  33.57 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499948  normal  0.0862143 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1948  rRNA large subunit methyltransferase  33.97 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0544  protein of unknown function DUF163  35 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  35.06 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0155  rRNA large subunit methyltransferase  34.19 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  32.7 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  30.34 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0613  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  29.56 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  32.26 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1973  rRNA large subunit methyltransferase  34.19 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1773  rRNA large subunit methyltransferase  30.36 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  28.95 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2080  rRNA large subunit methyltransferase  33.97 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0523  rRNA large subunit methyltransferase  28.93 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.238061  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0057  hypothetical protein  44.19 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1059  rRNA large subunit methyltransferase  30.82 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3453  rRNA large subunit methyltransferase  32.28 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  29.03 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0119  protein of unknown function DUF163  33.33 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  30.77 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  0.0000000861677 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0088  rRNA large subunit methyltransferase  33.55 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0114414  normal  0.53865 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  30.92 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0377  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0845  protein of unknown function DUF163  34.9 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0190186 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1809  hypothetical protein  32.21 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.454132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0256  rRNA large subunit methyltransferase  30.19 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1551  hypothetical protein  36.67 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1242  rRNA large subunit methyltransferase  41.75 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0322  rRNA large subunit methyltransferase  29.68 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.072258  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2688  rRNA large subunit methyltransferase  32.26 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169878  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  31.41 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0447  rRNA large subunit methyltransferase  28.93 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399021  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0162  rRNA large subunit methyltransferase  30.19 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  27.5 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0024  hypothetical protein  45.88 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.820161  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>