118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4362 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4362  Methyltransferase type 11  100 
 
 
246 aa  482  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000726075  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  53.65 
 
 
242 aa  237  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2798  Methyltransferase type 12  50.85 
 
 
237 aa  214  8e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0280553  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  50.66 
 
 
237 aa  203  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  41.67 
 
 
243 aa  171  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4732  Methyltransferase type 11  45.11 
 
 
241 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0044  Methyltransferase type 12  41.96 
 
 
152 aa  99.4  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0924465  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6880  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0173101  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0563  methyltransferase type 11  30.88 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149497  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  24.73 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  25.79 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  32.43 
 
 
296 aa  58.9  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1565  methyltransferase type 11  26.88 
 
 
247 aa  57  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.132389  hitchhiker  0.000000000856384 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1549  methyltransferase type 11  25.86 
 
 
255 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  27.45 
 
 
233 aa  57  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2792  methyltransferase type 11  26.53 
 
 
281 aa  56.6  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1418  Methyltransferase type 11  26.61 
 
 
248 aa  56.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  34.85 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09870  hypothetical protein  28.57 
 
 
247 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.261813  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4069  hypothetical protein  28.12 
 
 
261 aa  53.1  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  26.36 
 
 
251 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2180  methyltransferase type 12  28.12 
 
 
247 aa  52.8  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3796  methyltransferase type 11  29.03 
 
 
285 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0521  methyltransferase type 11  29.03 
 
 
285 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0543  methyltransferase type 11  29.03 
 
 
285 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0547  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 
285 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 
276 aa  52.8  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1302  hypothetical protein  28.57 
 
 
247 aa  52.4  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  23.89 
 
 
286 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0917  hypothetical protein  28.57 
 
 
247 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  29.76 
 
 
250 aa  52.4  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  26 
 
 
239 aa  52  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.59 
 
 
258 aa  52  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3449  methyltransferase type 11  28.12 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0501  methyltransferase type 11  29.03 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0602  methyltransferase type 11  27.96 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.445772  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  22.92 
 
 
272 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0013  hypothetical protein  34.21 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.62 
 
 
237 aa  50.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  43.21 
 
 
262 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1175  Methyltransferase type 12  26.28 
 
 
245 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3312  hypothetical protein  30.83 
 
 
211 aa  50.1  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
252 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  37.12 
 
 
291 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  27.59 
 
 
239 aa  49.3  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  29.03 
 
 
390 aa  49.7  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3653  methyltransferase type 12  26.88 
 
 
249 aa  49.7  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  23.21 
 
 
247 aa  49.7  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  28.45 
 
 
237 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2206  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 
269 aa  49.3  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000097592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  26.72 
 
 
237 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
238 aa  48.9  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2637  methyltransferase type 12  26.67 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325203  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3161  methyltransferase type 12  26.05 
 
 
247 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.086147 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.52 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  26.72 
 
 
237 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2634  hypothetical protein  26.37 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.167376  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  29.47 
 
 
231 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  33.96 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  33.96 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  33.96 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  33.96 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  27.87 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  30.48 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  33.96 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 
319 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  29.52 
 
 
238 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  29.52 
 
 
238 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1933  hypothetical protein  26.72 
 
 
237 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2080  hypothetical protein  26.72 
 
 
237 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  26.58 
 
 
248 aa  46.6  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  31.37 
 
 
266 aa  46.6  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
247 aa  46.6  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  33.02 
 
 
249 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4504  methyltransferase type 12  34.82 
 
 
198 aa  46.2  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210014  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.04 
 
 
345 aa  45.8  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  21.48 
 
 
232 aa  45.8  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  33.65 
 
 
249 aa  45.4  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  33.02 
 
 
249 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  33.02 
 
 
249 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  27.82 
 
 
201 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5435  methyltransferase type 12  28.78 
 
 
253 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  29.41 
 
 
276 aa  44.7  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  31.96 
 
 
252 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  29.59 
 
 
258 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  39.58 
 
 
308 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2042  methyltransferase type 11  35.58 
 
 
256 aa  43.9  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.646082  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  26.43 
 
 
256 aa  43.9  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  24.23 
 
 
262 aa  43.9  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  32.08 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  26.63 
 
 
305 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  30 
 
 
258 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1626  methyltransferase  37.31 
 
 
202 aa  43.5  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.542938  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  33.81 
 
 
200 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.32 
 
 
222 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  31.21 
 
 
251 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3590  methyltransferase type 12  30.05 
 
 
253 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.698799  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  36.05 
 
 
234 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35 
 
 
252 aa  43.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>