232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2634 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2634  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  562  1.0000000000000001e-159  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.167376  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  24.72 
 
 
270 aa  89.4  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  23.68 
 
 
284 aa  86.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  24.25 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  22.62 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  25.68 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.74 
 
 
275 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  23.46 
 
 
288 aa  77  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  23.02 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0487  Methyltransferase type 11  23.41 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000866959 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  24 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  31.51 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  23.62 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1565  methylase for ubiquinone/menaquinone biosynthesis  25 
 
 
247 aa  65.1  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.239027  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  37.23 
 
 
202 aa  62  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  43.59 
 
 
200 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  43.59 
 
 
200 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  28.93 
 
 
261 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  24.39 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  32.35 
 
 
268 aa  57  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.54 
 
 
291 aa  56.6  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  37.18 
 
 
199 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.69 
 
 
205 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2579  methyltransferase type 11  25.47 
 
 
217 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000242226  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  37.11 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.84 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.84 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  22.3 
 
 
299 aa  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  31.25 
 
 
242 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  39.74 
 
 
213 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  42.62 
 
 
354 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  23.03 
 
 
279 aa  50.4  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 
274 aa  50.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  21.05 
 
 
240 aa  50.4  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  28.04 
 
 
275 aa  50.1  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1999  2-heptaprenyl-1,4- naphthoquinonemethyltransferas e  38.16 
 
 
235 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.753273  normal  0.375757 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0618  methyltransferase type 12  37.18 
 
 
280 aa  50.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00582618  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1258  Methyltransferase type 11  27.45 
 
 
245 aa  49.7  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.760119 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  20.68 
 
 
273 aa  49.3  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  35.63 
 
 
268 aa  48.9  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2792  methyltransferase type 11  28.21 
 
 
281 aa  48.9  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 
253 aa  48.9  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  32.76 
 
 
194 aa  48.9  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  28.24 
 
 
243 aa  48.9  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  30.11 
 
 
289 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.79 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  32.73 
 
 
352 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.78 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  36.62 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  24.41 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  31.78 
 
 
263 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1634  hypothetical protein  26.45 
 
 
234 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0514  methyltransferase domain-containing protein  27.82 
 
 
242 aa  47.4  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0646  hypothetical protein  32.94 
 
 
280 aa  47  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0680  hypothetical protein  32.94 
 
 
280 aa  47  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  23.86 
 
 
220 aa  47  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  23.86 
 
 
220 aa  47  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  23.86 
 
 
220 aa  47  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.18 
 
 
234 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3719  methyltransferase type 12  36.59 
 
 
211 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000247431  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4362  Methyltransferase type 11  26.37 
 
 
246 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000726075  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  19.85 
 
 
287 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0489  methyltransferase type 12  31.43 
 
 
447 aa  47.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  23.86 
 
 
220 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4314  methyltransferase type 11  31.94 
 
 
212 aa  47  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  23.86 
 
 
220 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2798  Methyltransferase type 12  36.47 
 
 
237 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0280553  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  23.86 
 
 
220 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14451  SAM-dependent methyltransferase  34.91 
 
 
223 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  23.86 
 
 
220 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.21 
 
 
237 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0735  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  24.46 
 
 
212 aa  46.6  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.837751  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  45.45 
 
 
251 aa  46.6  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0530  putative methylase  29.35 
 
 
269 aa  46.6  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1175  Methyltransferase type 12  32.53 
 
 
245 aa  46.6  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  32.32 
 
 
263 aa  47  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  27.64 
 
 
242 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  23.76 
 
 
286 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.94 
 
 
264 aa  46.2  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  54.55 
 
 
225 aa  46.2  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0311  hypothetical protein  25.16 
 
 
237 aa  46.2  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.322092  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  35.48 
 
 
365 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  25.53 
 
 
280 aa  46.2  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  23.7 
 
 
279 aa  46.2  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0705  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
300 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  23.3 
 
 
283 aa  45.8  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  37.88 
 
 
256 aa  45.8  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  31.4 
 
 
233 aa  45.8  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2111  methyltransferase type 11  36.49 
 
 
224 aa  45.8  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  28.07 
 
 
271 aa  45.8  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  36.49 
 
 
390 aa  45.4  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  34.83 
 
 
253 aa  45.4  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 
272 aa  45.8  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.68 
 
 
251 aa  45.8  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  37.14 
 
 
246 aa  45.4  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  36.23 
 
 
258 aa  45.4  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1363  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  36.05 
 
 
374 aa  45.4  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000012191  normal  0.473534 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2086  hypothetical protein  28.22 
 
 
207 aa  45.4  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
208 aa  45.4  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>