252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0091 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  496  1e-140  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1797  flagellar basal-body rod protein  56.43 
 
 
241 aa  281  6.000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.119466  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0311  hypothetical protein  39.58 
 
 
237 aa  192  4e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.322092  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0288  hypothetical protein  38.75 
 
 
239 aa  191  6e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1721  hypothetical protein  37.92 
 
 
239 aa  186  4e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0514  methyltransferase domain-containing protein  36.97 
 
 
242 aa  181  9.000000000000001e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  38.36 
 
 
232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0992  Methyltransferase type 11  26.78 
 
 
255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.358942  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  28.36 
 
 
261 aa  101  9e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  30.3 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  29.94 
 
 
299 aa  75.9  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  33.08 
 
 
284 aa  75.1  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  28.31 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  31.69 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  32.12 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  26.64 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  24.53 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  30 
 
 
295 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  24.68 
 
 
294 aa  63.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  31.58 
 
 
286 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  27.91 
 
 
289 aa  63.2  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  26.12 
 
 
286 aa  63.5  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  26.74 
 
 
278 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  34.31 
 
 
286 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  22.92 
 
 
291 aa  61.6  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  25.31 
 
 
275 aa  61.2  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  26.55 
 
 
283 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  27.91 
 
 
283 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  34.31 
 
 
278 aa  59.7  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  29.06 
 
 
283 aa  59.7  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  29.29 
 
 
279 aa  59.3  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  26.09 
 
 
268 aa  59.3  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  23.79 
 
 
284 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  31.58 
 
 
270 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  29.85 
 
 
265 aa  56.6  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  28.7 
 
 
302 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  36.11 
 
 
276 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  31.31 
 
 
274 aa  55.8  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  26.36 
 
 
287 aa  55.5  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4055  putative methyltransferase  32.38 
 
 
194 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  27.93 
 
 
279 aa  54.3  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  25.37 
 
 
280 aa  53.9  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3030  methyltransferase type 12  27.61 
 
 
274 aa  53.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  37.18 
 
 
241 aa  52.8  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  29.01 
 
 
270 aa  53.1  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  30.85 
 
 
273 aa  52.8  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 
293 aa  52.8  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
280 aa  52.4  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  29.13 
 
 
291 aa  52.4  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  33.33 
 
 
271 aa  52.4  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1749  methyltransferase type 12  41.18 
 
 
215 aa  52.4  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.110719  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  27.59 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  31.71 
 
 
268 aa  51.6  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.47 
 
 
291 aa  51.6  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4249  16S rRNA methyltransferase GidB  27.78 
 
 
206 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0403  putative methyltransferase  35.53 
 
 
210 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00297063  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4539  16S rRNA methyltransferase GidB  27.78 
 
 
206 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1950  putative methyltransferase  29.84 
 
 
270 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2634  hypothetical protein  21.05 
 
 
268 aa  50.4  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.167376  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  37.84 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  37.84 
 
 
254 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  24.79 
 
 
291 aa  50.1  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  28.93 
 
 
302 aa  50.1  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  32.39 
 
 
273 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.88 
 
 
232 aa  49.7  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.93 
 
 
212 aa  49.7  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  31.25 
 
 
264 aa  49.7  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  32.39 
 
 
273 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  27.03 
 
 
209 aa  49.3  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 
259 aa  48.9  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  23.21 
 
 
279 aa  48.9  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1845  methyltransferase type 11  31.78 
 
 
234 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  30.68 
 
 
221 aa  48.5  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
250 aa  48.5  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  32.97 
 
 
219 aa  48.5  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
218 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0221  Methyltransferase type 11  35.85 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  27.14 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0697  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  25.51 
 
 
216 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0276525  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  26.04 
 
 
239 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2071  hypothetical protein  30 
 
 
144 aa  47.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  32 
 
 
279 aa  47.4  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  28 
 
 
279 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.53 
 
 
232 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4911  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37.25 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.168902 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  22.81 
 
 
277 aa  47  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000529075  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  29.52 
 
 
266 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5617  ribosomal L11 methyltransferase  32.53 
 
 
276 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.03 
 
 
256 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34303  predicted protein  41.38 
 
 
252 aa  46.6  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.294482  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.03 
 
 
256 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  34.33 
 
 
277 aa  46.6  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  22.33 
 
 
263 aa  47  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.03 
 
 
256 aa  47  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  24.35 
 
 
246 aa  47  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  25.95 
 
 
220 aa  46.6  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0671  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
312 aa  46.2  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0647  Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  25.51 
 
 
216 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.14282 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1398  16S rRNA methyltransferase GidB  31.03 
 
 
225 aa  46.2  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00046822  hitchhiker  0.000739039 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 
285 aa  45.8  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>