116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2938 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  59.96 
 
 		 521 aa  640    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  100 
 
 		 509 aa  1035    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  65.13 
 
 		 514 aa  685    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  60.29 
 
 		 544 aa  635    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  57.6 
 
 		 518 aa  610  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  53.73 
 
 		 512 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  55.56 
 
 		 522 aa  535  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  52.22 
 
 		 521 aa  510  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  52.21 
 
 		 521 aa  509  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  48.55 
 
 		 522 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  46.46 
 
 		 522 aa  460  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  49.03 
 
 		 521 aa  461  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  43.55 
 
 		 551 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  42.23 
 
 		 569 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  41.13 
 
 		 514 aa  382  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  43.36 
 
 		 660 aa  319  7e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  51.39 
 
 		 585 aa  309  8e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  53.74 
 
 		 401 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  49.06 
 
 		 405 aa  288  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1758  phage tail sheath protein  35.27 
 
 		 524 aa  272  1e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53821 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  44.59 
 
 		 724 aa  272  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  50.72 
 
 		 596 aa  269  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  43.11 
 
 		 599 aa  266  5e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  49.21 
 
 		 402 aa  266  7e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1505  tail sheath protein  33.89 
 
 		 522 aa  259  9e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3815  phage tail sheath protein  32.95 
 
 		 509 aa  255  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0931  hypothetical protein  32.76 
 
 		 509 aa  254  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.229261  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1889  hypothetical protein  32.76 
 
 		 509 aa  254  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0540146  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  50 
 
 		 405 aa  253  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  31.76 
 
 		 542 aa  251  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  43.05 
 
 		 1117 aa  246  6e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  45.33 
 
 		 821 aa  246  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  37.3 
 
 		 585 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  32.68 
 
 		 638 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1958  tail sheath protein  40.08 
 
 		 686 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4344  hypothetical protein  40.76 
 
 		 734 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500109  normal  0.105188 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  36.79 
 
 		 781 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1827  phage tail sheath protein  46.95 
 
 		 802 aa  179  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1824  tail sheath protein  37.21 
 
 		 690 aa  177  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3614  putative phage tail sheath protein FI  42.36 
 
 		 649 aa  171  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000782439 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1038  hypothetical protein  32.49 
 
 		 470 aa  169  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0832  phage tail sheath protein  35.43 
 
 		 644 aa  168  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5257  tail sheath protein  45.83 
 
 		 465 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3150  Phage tail sheath protein FI-like protein  44.62 
 
 		 700 aa  156  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81782  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1687  hypothetical protein  31.59 
 
 		 478 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0674  putative phage tail sheath protein FI  43.39 
 
 		 697 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3512  hypothetical protein  35.06 
 
 		 394 aa  146  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.222517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2545  hypothetical protein  43.85 
 
 		 479 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0845  Phage tail sheath protein FI-like protein  29.38 
 
 		 740 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1074  hypothetical protein  41.36 
 
 		 498 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0655  Phage tail sheath protein FI-like protein  29.39 
 
 		 740 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2466  hypothetical protein  41.85 
 
 		 497 aa  134  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3922  hypothetical protein  35.56 
 
 		 500 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000725372  hitchhiker  0.00401697 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3007  hypothetical protein  34.77 
 
 		 517 aa  131  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0373  hypothetical protein  39.78 
 
 		 522 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0681  hypothetical protein  23.86 
 
 		 517 aa  123  9e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  24.76 
 
 		 475 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  24.66 
 
 		 475 aa  100  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0897  hypothetical protein  23.85 
 
 		 499 aa  99  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.776782 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1041  hypothetical protein  23.85 
 
 		 499 aa  99  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4554  phage tail sheath protein  23.97 
 
 		 475 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00163736  normal  0.433622 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4553  phage tail sheath protein  23.77 
 
 		 475 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.558981 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4469  phage tail sheath protein  23.77 
 
 		 475 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  35.53 
 
 		 405 aa  93.6  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  29.11 
 
 		 485 aa  93.2  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2515  hypothetical protein  27.24 
 
 		 518 aa  85.9  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.874334  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  25.88 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  27.13 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  26.88 
 
 		 386 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  29.11 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  32.14 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  28.22 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  31.11 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  29.59 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  29.59 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  25.88 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  27.54 
 
 		 388 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  29.57 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  26.57 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  27.52 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3038  hypothetical protein  26.39 
 
 		 534 aa  65.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000011603 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  27.92 
 
 		 501 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2895  tail sheath protein  27.15 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.736844 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1918  phage tail sheath-like protein  25.99 
 
 		 391 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2664  tail sheath protein  22.62 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3482  phage tail sheath protein  23.14 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.101066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2592  tail sheath protein  23.15 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290828  hitchhiker  0.0000000176032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2626  tail sheath protein  23.15 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129054  hitchhiker  0.000000715616 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4345  phage tail sheath protein  22.98 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2099  tail sheath protein  23.12 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37400  Phage P2 tail sheath FI-like protein  26.26 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3192  tail sheath protein  25.76 
 
 		 389 aa  57  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3030  phage tail sheath protein  22.58 
 
 		 396 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296103 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1815  tail sheath protein  22.19 
 
 		 389 aa  56.2  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2378  phage tail sheath protein  26.37 
 
 		 478 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3308  phage tail sheath protein  27.37 
 
 		 391 aa  55.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0738809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4383  phage tail sheath protein  25.58 
 
 		 395 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301789  hitchhiker  0.000355682 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0863  tail sheath protein  22.01 
 
 		 389 aa  54.7  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360153  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0942  major tail sheath protein  23.05 
 
 		 390 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2493  major tail sheath protein  22.7 
 
 		 390 aa  53.9  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>