155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1005 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1005  cupin 4 family protein  100 
 
 		 373 aa  754    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0920  Cupin 4 family protein  99.2 
 
 		 373 aa  747    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5092  cupin 4 family protein  71.85 
 
 		 376 aa  541  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581531  normal  0.0289513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1332  cupin 4 family protein  71.5 
 
 		 378 aa  524  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2644  cupin 4  64.92 
 
 		 384 aa  488  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2658  cupin 4 family protein  67.62 
 
 		 393 aa  478  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0302893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3437  Cupin 4 family protein  64.21 
 
 		 381 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2568  hypothetical protein  62.67 
 
 		 382 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1191  cupin 4 family protein  58.85 
 
 		 413 aa  441  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327917  normal  0.915059 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3175  cupin 4  61.31 
 
 		 408 aa  434  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2642  cupin 4 family protein  56.12 
 
 		 418 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1614  hypothetical protein  51.83 
 
 		 382 aa  364  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000816657  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2523  Cupin 4 family protein  51.76 
 
 		 368 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000942208  decreased coverage  0.00000000060733 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1402  cupin 4 family protein  54.35 
 
 		 370 aa  352  5e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  hitchhiker  0.000000587517 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2001  cupin 4 family protein  51.17 
 
 		 406 aa  349  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.484534  hitchhiker  0.000000254865 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2694  cupin superfamily protein family  51.44 
 
 		 422 aa  345  7e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183857  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2127  cupin 4 family protein  50.78 
 
 		 407 aa  345  7e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14925  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2562  cupin domain-containing protein  51.44 
 
 		 395 aa  345  8e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245241  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2615  cupin domain-containing protein  51.44 
 
 		 395 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1183  cupin 4 family protein  50 
 
 		 408 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0687664  hitchhiker  0.0000384717 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5397  cupin domain-containing protein  49.21 
 
 		 406 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705727  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5986  cupin 4  49.47 
 
 		 406 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2091  cupin 4 family protein  49.47 
 
 		 406 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0444344  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2177  hypothetical protein  51.17 
 
 		 395 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0429596  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1450  hypothetical protein  51.17 
 
 		 395 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3141  hypothetical protein  51.17 
 
 		 407 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1910  hypothetical protein  50.13 
 
 		 422 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507646  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2110  cupin 4 family protein  49.21 
 
 		 406 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.191653  hitchhiker  0.00823788 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1108  cupin region  49.48 
 
 		 402 aa  332  6e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1148  hypothetical protein  48.56 
 
 		 409 aa  332  9e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1072  cupin 4  48.23 
 
 		 375 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.474375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1086  Cupin 4 family protein  48.42 
 
 		 409 aa  322  7e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0990  Cupin 4 family protein  48.09 
 
 		 375 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.210343 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1143  cupin region  44.09 
 
 		 415 aa  301  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000830013  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0585  hypothetical protein  43.75 
 
 		 377 aa  278  9e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.269935  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0838  cupin 4  43.32 
 
 		 392 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000238733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0982  cupin 4  43.32 
 
 		 392 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000496862  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0850  cupin 4 family protein  42.6 
 
 		 410 aa  272  6e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0989  Cupin 4 family protein  40.11 
 
 		 410 aa  261  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0764478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30100  hypothetical protein  48.1 
 
 		 389 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2577  hypothetical protein  47.75 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0294442  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2403  cupin 4 family protein  46.88 
 
 		 388 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.969826  normal  0.0823577 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1850  Cupin 4 family protein  40.87 
 
 		 397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.469672  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1816  cupin 4 family protein  45.14 
 
 		 388 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  0.222085 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3361  hypothetical protein  40.21 
 
 		 388 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.036154  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3193  transcription factor jumonji, jmjC  40.21 
 
 		 388 aa  235  7e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.021443 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1674  hypothetical protein  39.88 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3622  cupin 4 family protein  44.79 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3421  cupin 4 family protein  44.44 
 
 		 388 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4017  cupin 4 family protein  44.79 
 
 		 390 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593926  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28390  clavaminate synthase-like superfamily protein  44.79 
 
 		 388 aa  232  8.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0038  Cupin 4 family protein  39.64 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3599  transcription factor jumonji, jmjC  44.98 
 
 		 391 aa  229  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.404465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1404  Cupin 4 family protein  45.33 
 
 		 397 aa  224  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1765  cupin 4 family protein  39.14 
 
 		 383 aa  219  6e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0255627  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1874  hypothetical protein  35.54 
 
 		 395 aa  216  7e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1865  hypothetical protein  35.26 
 
 		 395 aa  213  5.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1132  transcription factor jumonji, jmjC  34.59 
 
 		 401 aa  211  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2447  cupin 4  40.41 
 
 		 397 aa  210  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2628  Cupin 4 family protein  42.97 
 
 		 471 aa  202  7e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229429  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3269  cupin 4 family protein  38.59 
 
 		 400 aa  193  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540912 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01200  transcription factor jumonji, JmjC  36.2 
 
 		 498 aa  191  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1274  Cupin 4 family protein  41.1 
 
 		 385 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2708  cupin 4 family protein  31.82 
 
 		 374 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.112259 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1557  cupin 4 family protein  35.47 
 
 		 386 aa  187  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0891  hypothetical protein  40.96 
 
 		 422 aa  186  4e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2004  Cupin 4 family protein  33.95 
 
 		 385 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.367195  hitchhiker  0.0000511749 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2354  cupin 4 family protein  33.68 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2199  cupin 4 family protein  34.47 
 
 		 381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00219592  hitchhiker  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02373  putative enzyme with RmlC-like domain  31.12 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.965281  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0804  cupin 4 family protein  40.56 
 
 		 422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2343  cupin 4 family protein  33.68 
 
 		 385 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2459  cupin 4 family protein  33.68 
 
 		 385 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1908  cupin 4 family protein  34.47 
 
 		 386 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0473  Cupin 4 family protein  36.82 
 
 		 373 aa  182  9.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1600  cupin 4 family protein  32.49 
 
 		 379 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1955  cupin family protein  33.33 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.280047  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1744  cupin 4 family protein  32.49 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1330  cupin family protein  33.33 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.233449  normal  0.341936 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0392  Cupin 4 family protein  36 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1569  cupin family protein  33.6 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486119  hitchhiker  0.00000357486 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01126  hypothetical protein  33.6 
 
 		 373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2519  Cupin 4 family protein  33.6 
 
 		 373 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0666495  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1997  cupin family protein  33.6 
 
 		 373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.446284 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1675  cupin 4 family protein  32.11 
 
 		 379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1306  cupin family protein  33.6 
 
 		 373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01134  hypothetical protein  33.6 
 
 		 373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1248  cupin family protein  33.6 
 
 		 373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1291  cupin family protein  33.6 
 
 		 373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2475  cupin 4 family protein  33.6 
 
 		 373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1346  cupin family protein  33.33 
 
 		 373 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.986526 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2541  cupin 4 family protein  34.3 
 
 		 376 aa  180  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2263  cupin 4 family protein  32.07 
 
 		 380 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1308  cupin family protein  33.06 
 
 		 373 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.579202  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2137  cupin family protein  33.06 
 
 		 373 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0624468 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2636  hypothetical protein  31.64 
 
 		 380 aa  178  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3067  cupin 4 family protein  32.93 
 
 		 373 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2408  cupin 4 family protein  33.95 
 
 		 380 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0501658  hitchhiker  0.000275258 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1952  hypothetical protein  28.91 
 
 		 390 aa  177  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2988  cupin family protein  32.63 
 
 		 373 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>