More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0212 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0212  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 306 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0216  LysR family transcriptional regulator  67 
 
 		 301 aa  403  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2279  LysR family transcriptional regulator  63.95 
 
 		 299 aa  394  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3345  LysR family transcriptional regulator  68.88 
 
 		 286 aa  387  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3126  LysR family transcriptional regulator  61.36 
 
 		 296 aa  362  3e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 300 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  47.59 
 
 		 300 aa  273  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 302 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08550  Transcriptional regulator, LysR family  47.81 
 
 		 307 aa  259  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.763554  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  42.12 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 293 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7143  transcriptional regulator, LysR family  38.98 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.297032  normal  0.653171 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2909  transcriptional regulator, LysR family  37.58 
 
 		 299 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0304015  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 297 aa  182  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3285  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  41.28 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  41.31 
 
 		 295 aa  178  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  34.33 
 
 		 299 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2713  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.15 
 
 		 299 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  34.33 
 
 		 299 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 305 aa  176  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0639  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 296 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  40.57 
 
 		 296 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  34 
 
 		 301 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 301 aa  176  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 301 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  34 
 
 		 301 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  34 
 
 		 301 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  41.76 
 
 		 306 aa  175  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  34 
 
 		 301 aa  175  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  34 
 
 		 301 aa  175  9e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 302 aa  175  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3044  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.727695 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1131  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 294 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3676  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 317 aa  172  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0866147  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3612  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.395284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2752  transcriptional regulator, LysR family  35.17 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000767643 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5792  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 304 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1850  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 328 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2461  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 328 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6115  transcriptional regulator, LysR family  34.92 
 
 		 299 aa  165  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2312  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 302 aa  165  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.015479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.37 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2265  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2155  LysR family substrate binding transcriptional regulator  36.61 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.971753  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2466  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1346  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 294 aa  162  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.638115  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1181  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  36.28 
 
 		 331 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2378  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2510  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0833  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1028  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  34.69 
 
 		 331 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1021  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  35.29 
 
 		 337 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.127351  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  38.37 
 
 		 302 aa  159  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0617  transcriptional regulator, LysR family  33.89 
 
 		 300 aa  159  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4639  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 309 aa  159  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4359  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 303 aa  158  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 297 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3441  transcriptional regulator, LysR family  34.12 
 
 		 297 aa  158  9e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2327  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0828  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  36.63 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.767447  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3370  hypothetical protein  35.42 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562011  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3663  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.148857  normal  0.207098 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3465  hypothetical protein  35.42 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2114  LysR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 313 aa  157  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28902  normal  0.253639 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3363  hypothetical protein  35.42 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354704  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68920  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196948  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0678  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  36.88 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  34.23 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3771  LysR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal  0.377047 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5585  LysR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2953  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  36.88 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0041469  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1646  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  36.88 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.636647  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4879  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3752  LysR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4592  LysR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2333  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  36.88 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0128681  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  37.37 
 
 		 301 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 301 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1424  transcriptional regulator, LysR family  37.31 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.442699 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1360  transcriptional regulator, LysR family  37.31 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325341  normal  0.0430016 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2588  transcription regulator protein  35.39 
 
 		 314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4959  LysR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 298 aa  155  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 305 aa  155  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3296  StmR  35.76 
 
 		 292 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.618402 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0232  cat operon transcriptional activator CatR  37.35 
 
 		 295 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.691367  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3948  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1573  cat operon transcriptional activator CatR  37.35 
 
 		 295 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>