264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1976 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1976  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
541 aa  1056    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0537449  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  31.45 
 
 
460 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  31.13 
 
 
460 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  30.79 
 
 
967 aa  134  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  30.42 
 
 
455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
1398 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1334  glycosyltransferase, putative  31.27 
 
 
431 aa  120  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218572  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 
1229 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.23 
 
 
815 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 
838 aa  114  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 
1243 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 
1241 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 
831 aa  108  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 
1241 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  30.58 
 
 
1635 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  31.35 
 
 
1261 aa  103  8e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  29.68 
 
 
859 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
860 aa  101  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
846 aa  100  6e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  29.29 
 
 
846 aa  100  6e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
850 aa  96.7  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2976  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 
389 aa  93.2  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2590  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
389 aa  93.2  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.998711  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3302  WcbB  33.47 
 
 
383 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176129  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5364  glycosyl transferase group 1  32.9 
 
 
432 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3255  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.47 
 
 
372 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3291  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.47 
 
 
372 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2308  glycosyltransferase, putative  33.05 
 
 
383 aa  90.9  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.865333  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2186  putative glycosyltransferase  33.05 
 
 
383 aa  90.9  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0520  putative glycosyltransferase  33.05 
 
 
383 aa  90.9  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.326748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1079  putative glycosyltransferase  33.05 
 
 
383 aa  90.9  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.256775  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4007  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 
388 aa  87.4  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0399427  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0745  glycosyl transferase, group 1  34.93 
 
 
426 aa  86.7  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8689  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
435 aa  84  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6411  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
435 aa  84  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1326  glycosyltransferase, putative  29.22 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4974  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 
456 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5026  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
459 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2295  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 
412 aa  82  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.380309  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3578  glycosyl transferase  29.49 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.643047  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4511  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 
456 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0770  glycosyl transferase, group 1  32.6 
 
 
399 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 
381 aa  81.3  0.00000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
434 aa  80.5  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1162  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 
384 aa  77.4  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.020878  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0643  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.984184 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3194  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
362 aa  77.4  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  37.32 
 
 
380 aa  77  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1534  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 
388 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3858  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 
321 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 
1915 aa  75.5  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2582  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
1332 aa  75.1  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.35538  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0739  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
383 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  33.11 
 
 
375 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 
366 aa  74.3  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2119  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632513  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3020  hypothetical protein  27.97 
 
 
417 aa  73.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4924  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 
386 aa  73.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  32.43 
 
 
375 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  28.68 
 
 
380 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2434  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
426 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121663  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1733  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 
384 aa  71.6  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
395 aa  70.1  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  36.69 
 
 
381 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4016  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 
423 aa  69.7  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 
417 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1615  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase WcbB, putative  24.2 
 
 
447 aa  68.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.921217  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  35.11 
 
 
382 aa  68.2  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  35.61 
 
 
384 aa  67.8  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  22.26 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0750  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
773 aa  67.8  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  35.11 
 
 
363 aa  67.4  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 
380 aa  67  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  26 
 
 
400 aa  67  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
343 aa  66.6  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 
366 aa  65.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1991  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
358 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000239658 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0354  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
343 aa  65.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 
376 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 
471 aa  64.7  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  23.91 
 
 
375 aa  64.7  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  35.82 
 
 
381 aa  64.7  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  26.87 
 
 
372 aa  64.3  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0219  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
415 aa  64.3  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2724  glycosyl transferase group 1  37.98 
 
 
430 aa  63.9  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5391  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
375 aa  63.5  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.919124 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  35.77 
 
 
367 aa  63.5  0.000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 
434 aa  63.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2303  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.16 
 
 
507 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.500428  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
387 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2181  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.16 
 
 
507 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
387 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0525  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.16 
 
 
507 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.317265  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  35.04 
 
 
371 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1074  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.16 
 
 
507 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.109997  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  31.12 
 
 
370 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0277  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 
503 aa  63.5  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>