More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1707 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1707  Cytochrome-c oxidase  100 
 
 
649 aa  1299    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  40.49 
 
 
548 aa  397  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  40.34 
 
 
554 aa  396  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  37.1 
 
 
638 aa  398  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  39.85 
 
 
590 aa  398  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  39.05 
 
 
587 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  39.37 
 
 
546 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  39.37 
 
 
546 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  39.81 
 
 
541 aa  391  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  40.55 
 
 
559 aa  386  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  40.42 
 
 
553 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  40.19 
 
 
541 aa  388  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  40.19 
 
 
555 aa  387  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  39.85 
 
 
541 aa  388  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  40.19 
 
 
541 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  39.28 
 
 
560 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  39.27 
 
 
559 aa  385  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  39.52 
 
 
556 aa  385  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  39.07 
 
 
565 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  38.57 
 
 
552 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  38.91 
 
 
539 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  39.39 
 
 
566 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  37.66 
 
 
564 aa  382  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  39.41 
 
 
615 aa  381  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  38.13 
 
 
558 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  37.3 
 
 
562 aa  380  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  38.34 
 
 
553 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  36.3 
 
 
575 aa  378  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  38.38 
 
 
555 aa  376  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  37.48 
 
 
555 aa  378  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  38.62 
 
 
563 aa  376  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  37.8 
 
 
555 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  37.8 
 
 
555 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  36.99 
 
 
542 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1931  cytochrome c oxidase, subunit I  38.39 
 
 
560 aa  365  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.452055 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3149  cytochrome c oxidase, subunit I  39.42 
 
 
558 aa  363  4e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2957  Cytochrome-c oxidase  36.71 
 
 
585 aa  362  8e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4245  cytochrome-c oxidase  38.49 
 
 
532 aa  362  8e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12210  cytochrome c oxidase, subunit I  37.8 
 
 
551 aa  362  1e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14130  cytochrome c oxidase, subunit I  38.73 
 
 
570 aa  359  9.999999999999999e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341017  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  37.89 
 
 
589 aa  358  1.9999999999999998e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  37.28 
 
 
535 aa  357  5e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  37.28 
 
 
535 aa  357  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  37.28 
 
 
535 aa  357  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  37.28 
 
 
535 aa  357  5e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  37.28 
 
 
535 aa  357  5e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  37.28 
 
 
535 aa  357  5e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  36.76 
 
 
581 aa  356  8.999999999999999e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  36.08 
 
 
572 aa  355  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  38.79 
 
 
583 aa  355  1e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6175  cytochrome-c oxidase  38.28 
 
 
535 aa  355  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0459  cytochrome-c oxidase  36.18 
 
 
671 aa  355  2e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  37.09 
 
 
535 aa  355  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0169  cytochrome c oxidase, subunit I  37.09 
 
 
535 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.98257  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3649  cytochrome c oxidase, subunit I  39.05 
 
 
582 aa  353  5.9999999999999994e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010381  normal  0.149508 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2216  cytochrome-c oxidase  39.06 
 
 
575 aa  352  8e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00587232  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04012  cytochrome c oxidase, subunit I  37.57 
 
 
537 aa  352  1e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1886  cytochrome c oxidase, subunit I  37.59 
 
 
594 aa  352  1e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704167 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0457  cytochrome c oxidase, subunit I  36.9 
 
 
535 aa  352  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3281  cytochrome c oxidase, subunit I  36.94 
 
 
593 aa  352  1e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6353  Cytochrome-c oxidase  39.19 
 
 
557 aa  351  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569681  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  37.68 
 
 
594 aa  351  2e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2857  cytochrome c oxidase, subunit I  37.89 
 
 
535 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978045  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2846  cytochrome-c oxidase  37.89 
 
 
535 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591708  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1802  cytochrome c oxidase subunit I type  38.24 
 
 
568 aa  352  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.115752 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2763  cytochrome c oxidase, subunit I  37.89 
 
 
535 aa  351  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281014  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2232  cytochrome-c oxidase  37.89 
 
 
535 aa  351  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2901  cytochrome-c oxidase  37.89 
 
 
535 aa  351  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1953  cytochrome c oxidase, subunit I  38.7 
 
 
575 aa  350  4e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000175318 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0277  cytochrome c oxidase, subunit I  38.09 
 
 
537 aa  350  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3821  cytochrome-c oxidase  37.23 
 
 
609 aa  350  6e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155592  normal  0.0385819 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0257  cytochrome-c oxidase  37.25 
 
 
531 aa  349  8e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0980  cytochrome-c oxidase  40.19 
 
 
562 aa  348  1e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0678468  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3116  cytochrome-c oxidase  37.38 
 
 
560 aa  349  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3557  cytochrome-c oxidase  37.01 
 
 
569 aa  348  1e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0159482  normal  0.969865 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1687  cytochrome c oxidase, subunit I  37 
 
 
590 aa  348  2e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.418885  normal  0.0786402 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0545  cytochrome c oxidase, subunit I  38.09 
 
 
537 aa  348  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3522  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  37.96 
 
 
648 aa  348  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4170  cytochrome-c oxidase  38.09 
 
 
537 aa  348  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.751334 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2015  cytochrome c oxidase, subunit I  37.66 
 
 
574 aa  348  2e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0590  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  36.25 
 
 
644 aa  348  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1561  cytochrome c oxidase, subunit I  37.59 
 
 
567 aa  347  3e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0534328  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1668  cytochrome c oxidase, subunit I  38.73 
 
 
580 aa  347  3e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.136706  normal  0.0936951 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1039  cytochrome c oxidase, subunit I  37.04 
 
 
536 aa  347  3e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4312  cytochrome c oxidase, subunit I  37.18 
 
 
530 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2810  cytochrome c oxidase, subunit I  36.52 
 
 
538 aa  347  4e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4181  cytochrome c oxidase subunit I type  37.18 
 
 
530 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0153  cytochrome-c oxidase  37.18 
 
 
530 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2961  cytochrome c oxidase, subunit I  36.52 
 
 
538 aa  347  5e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2493  cytochrome-c oxidase  38.64 
 
 
605 aa  347  5e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526922  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  37.25 
 
 
596 aa  347  5e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4113  cytochrome c oxidase, subunit I  37.18 
 
 
531 aa  347  5e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  35.47 
 
 
962 aa  346  8e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  36.89 
 
 
536 aa  346  8e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2671  Cytochrome-c oxidase  37.84 
 
 
554 aa  346  8e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.352805  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3792  cytochrome-c oxidase  37.18 
 
 
530 aa  346  8e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0253  cytochrome c oxidase, subunit I  37.57 
 
 
588 aa  346  8.999999999999999e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00642572 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0262  cytochrome c oxidase subunit I  37.52 
 
 
536 aa  346  8.999999999999999e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2861  cytochrome-c oxidase  36.59 
 
 
596 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480216  normal  0.0169225 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1016  cytochrome-c oxidase  39.55 
 
 
563 aa  345  1e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>