More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1658 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1658  argininosuccinate lyase  100 
 
 
466 aa  920    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163866  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3075  argininosuccinate lyase  50.8 
 
 
455 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3168  argininosuccinate lyase  51.77 
 
 
464 aa  404  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0440728 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  48.03 
 
 
441 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3069  argininosuccinate lyase  48.89 
 
 
470 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3022  argininosuccinate lyase  50.91 
 
 
486 aa  400  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2403  argininosuccinate lyase  47.7 
 
 
455 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22260  argininosuccinate lyase  47.84 
 
 
500 aa  399  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2051  argininosuccinate lyase  48.47 
 
 
476 aa  396  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5449  argininosuccinate lyase  48.7 
 
 
463 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6070  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 
472 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566647  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1781  argininosuccinate lyase  43.62 
 
 
479 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2158  argininosuccinate lyase  51.21 
 
 
472 aa  393  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000750754  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1888  argininosuccinate lyase  52.85 
 
 
487 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1744  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
511 aa  388  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814038 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  39.91 
 
 
466 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1504  argininosuccinate lyase  46.19 
 
 
480 aa  386  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000851302 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  45.5 
 
 
478 aa  385  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1503  argininosuccinate lyase  46.19 
 
 
479 aa  385  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4138  argininosuccinate lyase  48.32 
 
 
454 aa  388  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2024  argininosuccinate lyase  48.05 
 
 
482 aa  384  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0998023 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25560  argininosuccinate lyase  47.72 
 
 
465 aa  382  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5465  argininosuccinate lyase  47.49 
 
 
472 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559884  hitchhiker  0.0094933 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  40.69 
 
 
462 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3155  argininosuccinate lyase  51.88 
 
 
481 aa  382  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0248  argininosuccinate lyase  44.54 
 
 
466 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.192442  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21670  argininosuccinate lyase  51.82 
 
 
502 aa  379  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335342  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  41.76 
 
 
462 aa  378  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3055  argininosuccinate lyase  46.37 
 
 
472 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.097869  normal  0.940422 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  41.78 
 
 
462 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  45.79 
 
 
441 aa  377  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2700  argininosuccinate lyase  46.7 
 
 
478 aa  377  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1895  argininosuccinate lyase  52.96 
 
 
487 aa  378  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329316  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1118  argininosuccinate lyase  46.3 
 
 
474 aa  376  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.542068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0740  argininosuccinate lyase  42.32 
 
 
463 aa  377  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121768  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2475  argininosuccinate lyase  47.62 
 
 
470 aa  376  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0548  argininosuccinate lyase  40.22 
 
 
463 aa  375  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  41.56 
 
 
462 aa  375  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  41.56 
 
 
462 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  41.32 
 
 
463 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0809  argininosuccinate lyase  43.84 
 
 
490 aa  373  1e-102  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1648  argininosuccinate lyase  51.11 
 
 
471 aa  373  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  41.56 
 
 
462 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  46.02 
 
 
464 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  41.56 
 
 
462 aa  375  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2366  argininosuccinate lyase  47.85 
 
 
476 aa  373  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23929  decreased coverage  0.0035121 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  41.32 
 
 
463 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1333  argininosuccinate lyase  47.61 
 
 
484 aa  371  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  41.11 
 
 
462 aa  371  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14330  argininosuccinate lyase  45.78 
 
 
486 aa  369  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00125191  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  45.06 
 
 
456 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  41.33 
 
 
462 aa  372  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  41.33 
 
 
462 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  45.47 
 
 
462 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0979  argininosuccinate lyase  47.53 
 
 
505 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  43.05 
 
 
458 aa  368  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1807  argininosuccinate lyase  42.86 
 
 
461 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  42.22 
 
 
459 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  42.27 
 
 
461 aa  366  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  42.83 
 
 
458 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1169  argininosuccinate lyase  42.16 
 
 
462 aa  366  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2396  argininosuccinate lyase  44.84 
 
 
482 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  40.81 
 
 
461 aa  366  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  42.89 
 
 
460 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1256  argininosuccinate lyase  53.98 
 
 
489 aa  365  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1295  argininosuccinate lyase  39.91 
 
 
504 aa  365  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220763  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0675  argininosuccinate lyase  47.58 
 
 
505 aa  368  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3523  argininosuccinate lyase  47.19 
 
 
470 aa  365  1e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286619 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0841  argininosuccinate lyase  43.05 
 
 
458 aa  365  1e-99  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.330511  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  42.12 
 
 
458 aa  364  2e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0264  argininosuccinate lyase  47.37 
 
 
462 aa  364  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.139923 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  45.31 
 
 
459 aa  363  3e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1094  argininosuccinate lyase  42.7 
 
 
466 aa  363  3e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0434705  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2475  argininosuccinate lyase  45.7 
 
 
474 aa  363  3e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000124507 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  45.09 
 
 
481 aa  363  3e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  48.04 
 
 
462 aa  363  5.0000000000000005e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  48.04 
 
 
462 aa  363  5.0000000000000005e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  42.72 
 
 
459 aa  362  6e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0960  argininosuccinate lyase  39.24 
 
 
459 aa  362  8e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0731187  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0979  argininosuccinate lyase  39.24 
 
 
459 aa  362  8e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.248554  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  42.51 
 
 
458 aa  362  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1072  argininosuccinate lyase  43.12 
 
 
461 aa  361  2e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000143666  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3307  argininosuccinate lyase  47.35 
 
 
470 aa  360  2e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1901  argininosuccinate lyase  45.3 
 
 
460 aa  360  2e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  43.02 
 
 
458 aa  360  3e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0730  argininosuccinate lyase  41.5 
 
 
461 aa  360  3e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.410396  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3006  argininosuccinate lyase  39.91 
 
 
462 aa  360  3e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365153  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02920  argininosuccinate lyase  42.92 
 
 
464 aa  360  3e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  43.6 
 
 
461 aa  360  4e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  42.79 
 
 
458 aa  360  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0497  argininosuccinate lyase  42.11 
 
 
476 aa  359  6e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2834  argininosuccinate lyase  47.07 
 
 
495 aa  359  6e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2754  argininosuccinate lyase  44.39 
 
 
467 aa  359  7e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  41.45 
 
 
466 aa  358  8e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  41.45 
 
 
493 aa  358  9e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0557  argininosuccinate lyase  45.16 
 
 
411 aa  358  9.999999999999999e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0533  argininosuccinate lyase  45.16 
 
 
411 aa  358  9.999999999999999e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0048  argininosuccinate lyase  44.77 
 
 
460 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  41.78 
 
 
458 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1123  argininosuccinate lyase ArgH-like protein  38.7 
 
 
458 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.168929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>