More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1548 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4952  dihydroxy-acid dehydratase  60.72 
 
 		 567 aa  665    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0136  dihydroxy-acid dehydratase  64.45 
 
 		 580 aa  703    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0617591 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0486  dihydroxy-acid dehydratase  65.12 
 
 		 589 aa  712    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10190  dihydroxy-acid dehydratase  64.87 
 
 		 575 aa  702    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.539259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2526  dihydroxy-acid dehydratase  64.16 
 
 		 573 aa  694    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1711  dihydroxy-acid dehydratase  62.05 
 
 		 571 aa  660    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.835753  normal  0.93934 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1134  dihydroxy-acid dehydratase  65.59 
 
 		 570 aa  717    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0498657  hitchhiker  0.00011132 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10650  dihydroxyacid dehydratase  64.09 
 
 		 582 aa  712    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0955511 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08500  dihydroxy-acid dehydratase  64.39 
 
 		 575 aa  689    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0463604  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0146  dihydroxy-acid dehydratase  64.45 
 
 		 580 aa  705    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1548  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 567 aa  1122    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0456866  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2389  dihydroxy-acid dehydratase  65.36 
 
 		 570 aa  703    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4076  dihydroxy-acid dehydratase  69.08 
 
 		 575 aa  736    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1852  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1334  dihydroxy-acid dehydratase  64.52 
 
 		 563 aa  697    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2540  dihydroxy-acid dehydratase  62.86 
 
 		 573 aa  714    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0297342  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11990  dihydroxy-acid dehydratase  60.68 
 
 		 579 aa  656    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.885522  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0705  dihydroxy-acid dehydratase  66.55 
 
 		 558 aa  716    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08490  dihydroxy-acid dehydratase  62.64 
 
 		 571 aa  636    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1406  dihydroxy-acid dehydratase  66.25 
 
 		 569 aa  724    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3419  dihydroxy-acid dehydratase  63.75 
 
 		 567 aa  708    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0155  dihydroxy-acid dehydratase  64.45 
 
 		 580 aa  705    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0173  dihydroxy-acid dehydratase  64.29 
 
 		 565 aa  707    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2280  dihydroxy-acid dehydratase  63.33 
 
 		 572 aa  722    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000860305 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0886  dihydroxy-acid dehydratase  55.7 
 
 		 558 aa  610  1e-173  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1109  dihydroxy-acid dehydratase  57.96 
 
 		 564 aa  591  1e-167  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0023  dihydroxy-acid dehydratase  51.9 
 
 		 563 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.393007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0019  dihydroxy-acid dehydratase  51.71 
 
 		 561 aa  583  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2082  dihydroxy-acid dehydratase  54.53 
 
 		 562 aa  580  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2114  dihydroxy-acid dehydratase  53.67 
 
 		 578 aa  578  1e-164  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1221  dihydroxy-acid dehydratase  53.69 
 
 		 561 aa  578  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.240035 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0624  dihydroxy-acid dehydratase  53.2 
 
 		 580 aa  579  1e-164  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0847  dihydroxy-acid dehydratase  52.42 
 
 		 567 aa  578  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0511705 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2999  dihydroxy-acid dehydratase  52.44 
 
 		 561 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3121  dihydroxy-acid dehydratase  52.26 
 
 		 561 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3155  dihydroxy-acid dehydratase  52.08 
 
 		 559 aa  574  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2979  dihydroxy-acid dehydratase  51.9 
 
 		 559 aa  570  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.633648  hitchhiker  0.000413857 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0062  dihydroxy-acid dehydratase  51.54 
 
 		 562 aa  568  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1240  dihydroxy-acid dehydratase  53.14 
 
 		 564 aa  568  1e-161  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.325015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16921  dihydroxy-acid dehydratase  52.54 
 
 		 556 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.438934 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1347  dihydroxy-acid dehydratase  52.93 
 
 		 577 aa  571  1e-161  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0142863 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1758  dihydroxy-acid dehydratase  53.33 
 
 		 563 aa  568  1e-160  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.771853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2821  dihydroxy-acid dehydratase  51 
 
 		 561 aa  565  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00495915 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0346  dihydroxy-acid dehydratase  51.91 
 
 		 557 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0368  dihydroxy-acid dehydratase  50.45 
 
 		 563 aa  561  1.0000000000000001e-159  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0848  dihydroxy-acid dehydratase  52.44 
 
 		 558 aa  558  1e-158  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103963  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3109  dihydroxy-acid dehydratase  50.98 
 
 		 573 aa  559  1e-158  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2269  dihydroxy-acid dehydratase  52.16 
 
 		 564 aa  561  1e-158  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.248787 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2347  dihydroxy-acid dehydratase  51.88 
 
 		 579 aa  559  1e-158  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2069  dihydroxy-acid dehydratase  50.54 
 
 		 553 aa  556  1e-157  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.297693  normal  0.926907 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1673  dihydroxy-acid dehydratase  51.72 
 
 		 557 aa  555  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379644  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0179  dihydroxy-acid dehydratase  52.62 
 
 		 565 aa  555  1e-157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0711  dihydroxy-acid dehydratase  52.17 
 
 		 557 aa  556  1e-157  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1925  dihydroxy-acid dehydratase  52.06 
 
 		 561 aa  556  1e-157  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.906776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3010  dihydroxy-acid dehydratase  52.42 
 
 		 576 aa  553  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496774 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0129  dihydroxy-acid dehydratase  52.48 
 
 		 577 aa  554  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1222  dihydroxy-acid dehydratase  51.81 
 
 		 557 aa  553  1e-156  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.640338  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0324  dihydroxy-acid dehydratase  52.7 
 
 		 571 aa  553  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1260  dihydroxy-acid dehydratase  51.63 
 
 		 557 aa  550  1e-155  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.77083  normal  0.952172 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0900  dihydroxy-acid dehydratase  52.16 
 
 		 564 aa  549  1e-155  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0740  dihydroxy-acid dehydratase  51.17 
 
 		 562 aa  551  1e-155  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0180  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 		 556 aa  547  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1247  dihydroxy-acid dehydratase  53.19 
 
 		 595 aa  545  1e-154  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.853909 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0782  dihydroxy-acid dehydratase  47.74 
 
 		 557 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.729892  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0827  dihydroxy-acid dehydratase  50.45 
 
 		 557 aa  547  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08091  dihydroxy-acid dehydratase  47.74 
 
 		 559 aa  547  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.287074  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1370  dihydroxy-acid dehydratase  51.72 
 
 		 557 aa  546  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08121  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 		 556 aa  547  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2116  dihydroxy-acid dehydratase  51.97 
 
 		 558 aa  547  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296352  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08361  dihydroxy-acid dehydratase  47.56 
 
 		 557 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0832  dihydroxy-acid dehydratase  50.64 
 
 		 557 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204756  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0677  dihydroxy-acid dehydratase  51 
 
 		 557 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1020  dihydroxy-acid dehydratase  51 
 
 		 557 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0472909  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1326  dihydroxy-acid dehydratase  52.06 
 
 		 566 aa  542  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.303836  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1647  dihydroxy-acid dehydratase  51 
 
 		 557 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.332058  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2952  dihydroxy-acid dehydratase  51 
 
 		 557 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0058068  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2334  dihydroxy-acid dehydratase  51 
 
 		 557 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00290796  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08341  dihydroxy-acid dehydratase  47.2 
 
 		 557 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.924218  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1180  dihydroxy-acid dehydratase  50.82 
 
 		 557 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3131  dihydroxy-acid dehydratase  53.64 
 
 		 576 aa  540  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696259  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1027  dihydroxy-acid dehydratase  51 
 
 		 557 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11595  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0988  dihydroxy-acid dehydratase  49.36 
 
 		 557 aa  535  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0680  dihydroxy-acid dehydratase  48.31 
 
 		 564 aa  537  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106773  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1909  dihydroxy-acid dehydratase  51.41 
 
 		 576 aa  538  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.832097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5793  dihydroxy-acid dehydratase  51 
 
 		 557 aa  538  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351546 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2806  dihydroxy-acid dehydratase  52.52 
 
 		 574 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1851  dihydroxy-acid dehydratase  51 
 
 		 557 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2467  dihydroxy-acid dehydratase  51 
 
 		 557 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.43029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2511  dihydroxy-acid dehydratase  50.82 
 
 		 557 aa  537  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2462  dihydroxy-acid dehydratase  50.82 
 
 		 557 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345339  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1954  dihydroxy-acid dehydratase  51.58 
 
 		 576 aa  536  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1984  dihydroxy-acid dehydratase  53.51 
 
 		 577 aa  537  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.9458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2230  dihydroxy-acid dehydratase  51.76 
 
 		 576 aa  537  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3669  dihydroxy-acid dehydratase  51.34 
 
 		 562 aa  535  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.281782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2924  dihydroxy-acid dehydratase  51.16 
 
 		 576 aa  531  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0639  dihydroxy-acid dehydratase  49.36 
 
 		 557 aa  534  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2530  dihydroxy-acid dehydratase  50.45 
 
 		 564 aa  532  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2052  dihydroxy-acid dehydratase  49.91 
 
 		 564 aa  531  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2379  dihydroxy-acid dehydratase  50.09 
 
 		 557 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1553  dihydroxy-acid dehydratase  52.99 
 
 		 563 aa  533  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143997  normal  0.944928 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1844  dihydroxy-acid dehydratase  50 
 
 		 554 aa  533  1e-150  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>