More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0213 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0213  CheW protein  100 
 
 		 141 aa  264  4e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.178938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2324  CheW protein  46.88 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0315  putative CheW protein  48.25 
 
 		 146 aa  94.7  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0805582  normal  0.229425 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4225  CheW protein  38.24 
 
 		 151 aa  89.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.497298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1792  CheW protein  48.15 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.666694 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  38.35 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1525  CheW protein  43.1 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361906  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3603  CheW protein  39.42 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861446  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1818  CheW protein  35.51 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1873  CheW protein  35.51 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101354  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1530  CheW domain-containing protein  36.23 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1810  CheW protein  36.23 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000143406  normal  0.276017 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  34.31 
 
 		 160 aa  77  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3919  CheW protein  35.51 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5006  CheW protein  46.3 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3677  CheW-like protein  34.78 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.340799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3375  CheW protein  34.06 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0270944  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4034  CheW protein  37.68 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.488441  normal  0.598337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3802  CheW protein  34.56 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  29.5 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4246  CheW protein  34.56 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1713  CheW protein  34.78 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0659  CheW protein  38.84 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.575233  normal  0.716686 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  30.94 
 
 		 170 aa  73.6  0.0000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0521  CheW-like protein  37.4 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.77009 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  32.85 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30980  CheW protein  39.81 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  30.71 
 
 		 165 aa  72  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  35.88 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  30.71 
 
 		 165 aa  72  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2003  CheW protein  37.72 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0578815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  33.09 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2562  CheW protein  35.34 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.424252  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1907  CheW domain protein  43.01 
 
 		 170 aa  70.5  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.96206  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0989  CheW protein  32.84 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1071  CheW protein  28.21 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0525  CheW protein  33.33 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  31.34 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  31.29 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  32.52 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6558  CheW protein  34.96 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.675554 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  28.06 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  28.06 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  31.71 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  28.24 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  34.06 
 
 		 173 aa  67  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  28.67 
 
 		 189 aa  67  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  32.33 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  31.67 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  26.15 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  30.08 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  30 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  28.47 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  29.55 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  27.82 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  30.83 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0581  CheW protein  29.32 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  29.55 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  29.71 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  29.55 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  36.27 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  29.55 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  30.83 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  27.07 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  28.87 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  31.39 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  28.46 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  29.29 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  32.58 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  35.92 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  29.93 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  29.93 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  28.99 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  28.89 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  30.66 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  31.85 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3577  CheW protein  27.44 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  31.91 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  27.54 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0927  CheW protein  28.46 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  31.91 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.57 
 
 		 159 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  28.57 
 
 		 159 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  28.57 
 
 		 159 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  28.03 
 
 		 174 aa  63.5  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  28.57 
 
 		 159 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  30.15 
 
 		 166 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  28.24 
 
 		 157 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.66 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  32.19 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  35.92 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  27.61 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  27.61 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  27.61 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  29.2 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  33.33 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  29.2 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  32.12 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4837  CheW protein  39.13 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  29.01 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>