More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0378 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0406  Polyprenyl synthetase  97.99 
 
 
349 aa  634    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.772266  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0407  Polyprenyl synthetase  98.28 
 
 
349 aa  664    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0378  farnesyltranstransferase  100 
 
 
349 aa  676    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5471  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4194  polyprenyl synthetase  85.67 
 
 
349 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5713  Geranyltranstransferase  41.19 
 
 
355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119458  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  43.86 
 
 
322 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1756  trans-hexaprenyltranstransferase  38.8 
 
 
344 aa  194  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.726809  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2582  hypothetical protein  38.94 
 
 
322 aa  193  4e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2709  hypothetical protein  38.94 
 
 
322 aa  192  6e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  36.74 
 
 
322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1574  octaprenyl-diphosphate synthase  37.79 
 
 
349 aa  188  1e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.836554 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  42.07 
 
 
332 aa  188  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1454  Polyprenyl synthetase  35.06 
 
 
324 aa  187  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.322683  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  35.92 
 
 
331 aa  186  6e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  42.09 
 
 
322 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  38.87 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  38.08 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  36.33 
 
 
324 aa  183  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  42.14 
 
 
322 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  41.58 
 
 
338 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  41.79 
 
 
322 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0890  polyprenyl synthetase  38.51 
 
 
309 aa  183  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0253423 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  39.38 
 
 
323 aa  182  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  36.67 
 
 
322 aa  182  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.38 
 
 
323 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  40.82 
 
 
340 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  38.13 
 
 
324 aa  181  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  38.3 
 
 
323 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  40.07 
 
 
322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5075  Polyprenyl synthetase  35.15 
 
 
326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  40.07 
 
 
322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  35.86 
 
 
331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  46.23 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  41.99 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  40.07 
 
 
322 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  40.78 
 
 
335 aa  180  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  36.11 
 
 
331 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  36.11 
 
 
331 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  36.11 
 
 
331 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  35.55 
 
 
326 aa  179  4.999999999999999e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  36.11 
 
 
331 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  38.06 
 
 
323 aa  179  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  41.01 
 
 
322 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.84 
 
 
322 aa  179  9e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  39.72 
 
 
323 aa  178  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  41.3 
 
 
328 aa  177  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  35.84 
 
 
323 aa  177  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  41.22 
 
 
333 aa  177  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  37.46 
 
 
322 aa  176  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0340  trans-hexaprenyltranstransferase  40.34 
 
 
321 aa  176  4e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104163  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  37.73 
 
 
327 aa  176  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  45.78 
 
 
356 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  38.13 
 
 
320 aa  176  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  38.14 
 
 
323 aa  176  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  35.97 
 
 
324 aa  176  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  40.14 
 
 
322 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  41.73 
 
 
322 aa  176  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  34.4 
 
 
324 aa  176  6e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  39.16 
 
 
333 aa  175  8e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  36.3 
 
 
326 aa  175  9e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  36.72 
 
 
322 aa  175  9e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  36.27 
 
 
322 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0458  polyprenyl synthetase  38.71 
 
 
338 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.480075 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  39.27 
 
 
323 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  39.16 
 
 
333 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6988  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.59 
 
 
321 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.955894  hitchhiker  0.000428726 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  39.46 
 
 
339 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  38.98 
 
 
330 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  39.16 
 
 
333 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  34.77 
 
 
324 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  37.38 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  39.27 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  39.27 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  39.27 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  36.43 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  35.23 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  37.01 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  39.27 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  39.27 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  39.79 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  39.27 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  39.27 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  39.27 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  38.54 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.18 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3006  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.15 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  36.43 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0855  polyprenyl synthetase  44.59 
 
 
336 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215594  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  33.73 
 
 
338 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  41.01 
 
 
322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  36.36 
 
 
322 aa  173  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  38.77 
 
 
370 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  38.77 
 
 
370 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  38.77 
 
 
370 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  38.77 
 
 
370 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  38.77 
 
 
370 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  38.05 
 
 
327 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  37.33 
 
 
358 aa  172  9e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  35.69 
 
 
320 aa  172  9e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  38.18 
 
 
342 aa  172  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>