106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3124 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009467  Acry_3124  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  211  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143828  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  45.54 
 
 
314 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  47.47 
 
 
303 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  46.46 
 
 
303 aa  84.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  42.42 
 
 
304 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  42.86 
 
 
328 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  43.88 
 
 
323 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  41.84 
 
 
328 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  41.41 
 
 
304 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  41.41 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  42.27 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  42.57 
 
 
310 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  40.59 
 
 
247 aa  71.2  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  42 
 
 
306 aa  70.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08977  AkePPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARV3]  41.84 
 
 
353 aa  69.7  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000540741  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  41.75 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  37 
 
 
304 aa  65.5  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.76 
 
 
310 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  38.1 
 
 
327 aa  62.8  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  37.25 
 
 
308 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  38.3 
 
 
338 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  37.23 
 
 
338 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  36.73 
 
 
308 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  36.08 
 
 
304 aa  60.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  36.11 
 
 
286 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  37.37 
 
 
296 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  36 
 
 
287 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  31.18 
 
 
338 aa  58.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  35 
 
 
281 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  35.05 
 
 
299 aa  57.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.19 
 
 
407 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  36.63 
 
 
533 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0398  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  40.74 
 
 
302 aa  57  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.993472 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  32.65 
 
 
281 aa  57  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  32.65 
 
 
281 aa  57  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  30.11 
 
 
338 aa  56.6  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  35.79 
 
 
307 aa  55.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  36.84 
 
 
307 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01840  lactonohydrolase, putative  36.46 
 
 
477 aa  53.9  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  34.55 
 
 
312 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2237  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35 
 
 
273 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3300  gluconolactonase  38.38 
 
 
291 aa  52  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.875463 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  36.04 
 
 
313 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0901  senescence marker protein-30 (SMP-30)  39.08 
 
 
294 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.936604  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4109  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.36 
 
 
282 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  30.69 
 
 
371 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  34.91 
 
 
316 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  33.96 
 
 
316 aa  50.8  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1474  putative gluconolactonase  33.96 
 
 
183 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.551174  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0046  gluconolactonase  33.96 
 
 
183 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  33.96 
 
 
313 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  33.96 
 
 
313 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  33.96 
 
 
313 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  33.96 
 
 
313 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  30.28 
 
 
316 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4078  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.84 
 
 
301 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4190  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.84 
 
 
301 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.78 
 
 
334 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05363  hypothetical protein  40 
 
 
296 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00449707 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.72 
 
 
300 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1799  gluconolactonase  39.51 
 
 
309 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328228  hitchhiker  0.000281102 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  32.61 
 
 
295 aa  48.5  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  31.43 
 
 
312 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  28.16 
 
 
351 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2018  gluconolactonase  40.26 
 
 
283 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2064  gluconolactonase  40.26 
 
 
283 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  33.33 
 
 
302 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2001  gluconolactonase  40.26 
 
 
283 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1381  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.22 
 
 
286 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.759773  normal  0.429128 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.24 
 
 
415 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1052  senescence marker protein-30 family protein  39.08 
 
 
294 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6939  gluconolactonase  34.02 
 
 
308 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000441161  normal  0.601759 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1362  Xylono-1,4-lactonase  33.33 
 
 
294 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2001  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.33 
 
 
302 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00903181  hitchhiker  0.0000000314659 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  29.66 
 
 
324 aa  47  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.11 
 
 
300 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0439453  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4580  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.11 
 
 
300 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0517  gluconolactonase  39.47 
 
 
311 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1974  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.33 
 
 
302 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.18647  hitchhiker  0.00196761 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2088  hypothetical protein  31.33 
 
 
300 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000545594 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1592  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.23 
 
 
300 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1725  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.65 
 
 
296 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000166829  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  31.82 
 
 
315 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4867  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.04 
 
 
309 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0126426  normal  0.175747 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3108  gluconolactonase  37.93 
 
 
303 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0128132  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  33.02 
 
 
322 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4476  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.38 
 
 
290 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0784664  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3453  gluconolactonase  38.1 
 
 
297 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2140  gluconolactonase  28.71 
 
 
296 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.977178 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  34 
 
 
340 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2046  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.21 
 
 
302 aa  42.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00681526  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.84 
 
 
569 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4241  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.41 
 
 
293 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.557262  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1188  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.7 
 
 
292 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227591  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  31.43 
 
 
332 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1002  gluconolactonase  37.5 
 
 
295 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.968927  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2143  hypothetical protein  32.5 
 
 
291 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  29.9 
 
 
340 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  33 
 
 
343 aa  41.2  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2099  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.14 
 
 
291 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.83958 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>