44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2587 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2587  O-antigen polymerase  100 
 
 		 409 aa  802    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4842  O-antigen polymerase  28.98 
 
 		 433 aa  159  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000342709  normal  0.0564871 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1176  O-antigen polymerase  28.92 
 
 		 433 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1130  O-antigen polymerase  29.95 
 
 		 438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1688  O-antigen polymerase  31.17 
 
 		 421 aa  127  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0910283  normal  0.076767 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1179  O-antigen polymerase  30.85 
 
 		 446 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1595  O-antigen polymerase  30.37 
 
 		 467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6427  O-antigen polymerase  28.39 
 
 		 439 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.445902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6232  O-antigen polymerase  28.68 
 
 		 441 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.394036  normal  0.503415 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3696  O-antigen polymerase  30.19 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0487808  normal  0.621123 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0892  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 428 aa  97.4  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0864328  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1380  O-antigen polymerase  27.8 
 
 		 313 aa  94.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.563149  normal  0.0271558 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1531  O-antigen polymerase  28.1 
 
 		 419 aa  87  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543111  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1378  O-antigen polymerase  27.3 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486003  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1091  exopolysaccharide production protein  29.32 
 
 		 429 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.802391  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3343  O-antigen polymerase  27.17 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0274  O-antigen polymerase  26.41 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1208  O-antigen polymerase  27.19 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923682 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1973  O-antigen polymerase  26.69 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15228 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2549  putative polysaccharide polymerase  26.88 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0665  O-antigen polymerase  29.95 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0304  O-antigen polymerase  24.93 
 
 		 451 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3184  O-antigen polymerase  25.27 
 
 		 442 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4944  O-antigen polymerase  25.54 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367217  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2821  O-antigen polymerase  26.16 
 
 		 437 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0963  O-antigen polymerase  23.59 
 
 		 460 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0257  O-antigen polymerase  28.96 
 
 		 453 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1077  O-antigen polymerase  25.48 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.7973  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0388  O-antigen polymerase  28.42 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0108  exopolysaccharide production protein, putative  26.91 
 
 		 441 aa  59.7  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4237  O-antigen polymerase  26.92 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201172  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0651  O-antigen polymerase  23.58 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0810  O-antigen polymerase  29.26 
 
 		 441 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  31.78 
 
 		 607 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4801  O-antigen polymerase  24.69 
 
 		 440 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.141517 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4354  O-antigen polymerase  30 
 
 		 443 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201605  normal  0.814699 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2875  O-antigen polymerase  29.29 
 
 		 440 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184555  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4579  O-antigen polymerase  35.8 
 
 		 448 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.17078 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  19.71 
 
 		 428 aa  46.6  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4530  O-antigen polymerase  23.53 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  35.23 
 
 		 595 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3247  O-antigen polymerase  26.92 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0559  hypothetical protein  29.11 
 
 		 569 aa  43.9  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1940  O-antigen polymerase  29.14 
 
 		 453 aa  43.1  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>