114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0703 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0703  regulatory protein RecX  100 
 
 
204 aa  412  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3105  regulatory protein RecX  27.33 
 
 
164 aa  62.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201056  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  32.16 
 
 
168 aa  62  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  31.41 
 
 
150 aa  60.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  33.77 
 
 
152 aa  58.9  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  33.33 
 
 
154 aa  59.3  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  30.77 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3239  recombination regulator RecX  33.64 
 
 
182 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00185832  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  34.21 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3374  recombination regulator RecX  33.64 
 
 
187 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  34.04 
 
 
149 aa  56.2  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02827  hypothetical protein  32.17 
 
 
143 aa  55.5  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06801  hypothetical protein  32.17 
 
 
143 aa  55.5  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  29.61 
 
 
214 aa  55.5  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  30.82 
 
 
156 aa  55.1  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  29.41 
 
 
167 aa  55.1  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  27.39 
 
 
210 aa  54.7  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1591  regulatory protein RecX  28.67 
 
 
158 aa  54.3  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0496  regulatory protein RecX  31.29 
 
 
157 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012362 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0982  recombination regulator RecX  33.33 
 
 
162 aa  53.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0020  regulatory protein RecX  30.87 
 
 
150 aa  52.8  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0569  regulatory protein RecX  29.68 
 
 
155 aa  52.8  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.51496 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  27.15 
 
 
156 aa  52.4  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  29.82 
 
 
160 aa  51.6  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0441  regulatory protein RecX  29.94 
 
 
262 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  28.99 
 
 
149 aa  51.6  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  33.33 
 
 
168 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0552  recombination regulator RecX  28.95 
 
 
159 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0273  recombination regulator RecX  30.25 
 
 
327 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0973  recombination regulator RecX  30.25 
 
 
327 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5978  recombination regulator RecX  32 
 
 
289 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.129399 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2040  recombination regulator RecX  31.76 
 
 
297 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1119  regulatory protein RecX  24.18 
 
 
188 aa  50.4  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2651  recombination regulator RecX  31.76 
 
 
297 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  30.63 
 
 
163 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2673  recombination regulator RecX  30.25 
 
 
327 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2403  recombination regulator RecX  30.25 
 
 
327 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0811  recombination regulator RecX  30.25 
 
 
327 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0815  recombination regulator RecX  30.25 
 
 
327 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0016  recombination regulator RecX  30.25 
 
 
327 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  27.33 
 
 
154 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  28.48 
 
 
214 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  30.83 
 
 
150 aa  49.3  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0651  recombination regulator RecX  32.43 
 
 
285 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3294  regulatory protein RecX  30.25 
 
 
235 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.808849  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  28.86 
 
 
162 aa  49.7  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  26.85 
 
 
152 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  31.08 
 
 
156 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2572  recombination regulator RecX  31.76 
 
 
293 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  27.88 
 
 
170 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  28.87 
 
 
206 aa  48.5  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3541  hypothetical protein  32.39 
 
 
178 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.795937 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1115  recombination regulator RecX  33.66 
 
 
162 aa  48.5  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  28.97 
 
 
148 aa  48.5  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3212  recombination regulator RecX  32.67 
 
 
164 aa  48.5  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  26.35 
 
 
179 aa  48.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  28.21 
 
 
185 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2698  recombination regulator RecX  32.62 
 
 
293 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  21.79 
 
 
269 aa  47.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  26.12 
 
 
267 aa  47.4  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  28.82 
 
 
202 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  27.21 
 
 
223 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2629  transcriptional regulator for RecA  27.55 
 
 
220 aa  46.6  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  31.25 
 
 
227 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  27.7 
 
 
155 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  24.75 
 
 
222 aa  46.2  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  25.52 
 
 
253 aa  46.2  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0639  regulatory protein RecX  31.76 
 
 
198 aa  46.2  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0644  recombination regulator RecX  29.27 
 
 
325 aa  46.6  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490193  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  29.82 
 
 
222 aa  46.2  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0672  regulatory protein RecX  29.01 
 
 
235 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.175014 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  27.34 
 
 
150 aa  46.6  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  28.57 
 
 
357 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0778  regulatory protein RecX  27.27 
 
 
224 aa  46.2  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000705154  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2680  recombination regulator RecX  30.41 
 
 
302 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.521249  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  25.74 
 
 
192 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  26.05 
 
 
184 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  30.99 
 
 
178 aa  45.4  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  29.05 
 
 
163 aa  45.4  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5194  regulatory protein RecX  30.46 
 
 
150 aa  45.4  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.910753  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1304  recombination regulator RecX  26.47 
 
 
154 aa  45.1  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  28 
 
 
153 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  32.11 
 
 
191 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  26.67 
 
 
156 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1509  regulatory protein RecX  28.81 
 
 
151 aa  44.3  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99842  normal  0.151917 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  26.67 
 
 
156 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  27.81 
 
 
229 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  27.52 
 
 
153 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  27.66 
 
 
198 aa  43.9  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3614  regulatory protein RecX  33.93 
 
 
177 aa  43.9  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0968404  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  23.81 
 
 
160 aa  44.3  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3955  regulatory protein RecX  26.47 
 
 
168 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  30.1 
 
 
161 aa  43.9  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3173  recombination regulator RecX  28.48 
 
 
166 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0784826  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  31.17 
 
 
226 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  27.7 
 
 
156 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  24.83 
 
 
271 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  25.28 
 
 
179 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0467  recombination regulator RecX  24.86 
 
 
182 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  27.7 
 
 
152 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>