136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2892 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  100 
 
 
835 aa  1616    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0615  polysaccharide deacetylase  63.34 
 
 
843 aa  427  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00286732 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2882  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  60.98 
 
 
939 aa  427  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3348  hypothetical protein  56.52 
 
 
913 aa  373  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  47.68 
 
 
1129 aa  290  6e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  42.55 
 
 
837 aa  258  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  44.69 
 
 
792 aa  248  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  44.25 
 
 
778 aa  232  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  39.1 
 
 
743 aa  231  5e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  44.93 
 
 
776 aa  227  8e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  44.03 
 
 
553 aa  217  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.36 
 
 
821 aa  215  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  42.65 
 
 
784 aa  215  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  46.15 
 
 
376 aa  214  7e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6409  Peptidase S53 propeptide  37.84 
 
 
1027 aa  199  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.276013 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  36.59 
 
 
363 aa  196  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  36.59 
 
 
363 aa  196  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  40 
 
 
593 aa  195  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.74 
 
 
818 aa  193  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0377  hypothetical protein  50 
 
 
210 aa  183  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  35.43 
 
 
461 aa  181  4e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  39.7 
 
 
389 aa  181  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  40.82 
 
 
681 aa  179  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  36.27 
 
 
911 aa  177  5e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  36.41 
 
 
469 aa  177  6e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.31 
 
 
561 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  36.57 
 
 
2082 aa  174  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  37.53 
 
 
443 aa  174  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  39.24 
 
 
638 aa  173  9e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  38.35 
 
 
477 aa  174  9e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.09 
 
 
554 aa  173  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  40.44 
 
 
555 aa  173  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  40.5 
 
 
569 aa  172  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  32.41 
 
 
807 aa  171  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  35.98 
 
 
1848 aa  171  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  36.62 
 
 
714 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  36.02 
 
 
717 aa  169  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  33.33 
 
 
461 aa  168  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.63 
 
 
1919 aa  168  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  39.51 
 
 
551 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.31 
 
 
706 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  39.38 
 
 
579 aa  164  8.000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  38.07 
 
 
558 aa  164  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.8 
 
 
417 aa  162  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  40.45 
 
 
556 aa  162  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  38.54 
 
 
553 aa  161  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  39.52 
 
 
560 aa  160  8e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  41.27 
 
 
563 aa  157  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  38.26 
 
 
577 aa  156  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.4 
 
 
1679 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.07 
 
 
570 aa  152  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  34.26 
 
 
726 aa  149  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  36.9 
 
 
558 aa  147  9e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.81 
 
 
567 aa  146  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  36.32 
 
 
546 aa  146  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  36.82 
 
 
449 aa  146  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.43 
 
 
555 aa  141  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  35.8 
 
 
554 aa  137  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  32.48 
 
 
745 aa  134  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  33.68 
 
 
1222 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  35.39 
 
 
403 aa  132  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.56 
 
 
810 aa  124  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  34.48 
 
 
547 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  35.9 
 
 
737 aa  119  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  31.73 
 
 
817 aa  118  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  30.59 
 
 
597 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  36.71 
 
 
566 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  30.85 
 
 
575 aa  114  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.48 
 
 
787 aa  110  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  32.15 
 
 
618 aa  108  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  32.68 
 
 
900 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  30.3 
 
 
1207 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  31.59 
 
 
1126 aa  105  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  29.12 
 
 
1187 aa  105  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  33.03 
 
 
624 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.33 
 
 
692 aa  101  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  32.83 
 
 
602 aa  100  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  32.99 
 
 
447 aa  97.8  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  31.37 
 
 
544 aa  97.4  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  32.44 
 
 
941 aa  96.3  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  33.89 
 
 
921 aa  93.6  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  27.76 
 
 
341 aa  91.3  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.85 
 
 
535 aa  89  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.34 
 
 
1147 aa  88.6  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  29.24 
 
 
454 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28035  predicted protein  28.25 
 
 
371 aa  86.3  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00114793  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  36.95 
 
 
307 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  28.62 
 
 
418 aa  84.7  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.43 
 
 
454 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2961  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  34.52 
 
 
326 aa  82  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.462703  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  25.85 
 
 
558 aa  81.3  0.00000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  30.95 
 
 
2367 aa  80.5  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  33.68 
 
 
450 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  43.17 
 
 
209 aa  79.3  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  27.56 
 
 
375 aa  79  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  28.27 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3372  regulator of chromosome condensation RCC1  30.42 
 
 
375 aa  74.7  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.582545  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  28.65 
 
 
396 aa  73.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2561  regulator of chromosome condensation RCC1  45 
 
 
106 aa  70.9  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.111508  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  31.66 
 
 
332 aa  70.5  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>