More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0877 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0877  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 517 aa  1028    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0758  amino acid permease-associated region  89.6 
 
 		 524 aa  826    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5297  amino acid ABC transporter permease  56.78 
 
 		 535 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.00229664  normal  0.376722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5345  amino acid permease-associated region  56.58 
 
 		 513 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5206  amino acid permease-associated region  56.58 
 
 		 535 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959368  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0176  amino acid permease-associated region  58.17 
 
 		 512 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120124 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0840  amino acid permease-associated region  61.01 
 
 		 511 aa  560  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1744  amino acid permease-associated region  55.53 
 
 		 510 aa  540  9.999999999999999e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.579439  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0042  amino acid permease-associated region  57.65 
 
 		 507 aa  541  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10330  amino acid transporter  51.36 
 
 		 553 aa  515  1.0000000000000001e-145  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0813  amino acid permease-associated region  49.71 
 
 		 516 aa  474  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0679  amino acid permease-associated region  48.52 
 
 		 517 aa  470  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0773  amino acid permease-associated region  44 
 
 		 516 aa  382  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155381  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0951  amino acid permease-associated region  44.38 
 
 		 494 aa  368  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4853  amino acid permease-associated region  41.75 
 
 		 476 aa  345  1e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1574  amino acid permease-associated region  41.43 
 
 		 503 aa  334  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573119 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3054  amino acid permease-associated region  40.44 
 
 		 506 aa  330  3e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2756  amino acid permease-associated region  40.21 
 
 		 497 aa  330  5.0000000000000004e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00077559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0710  amino acid permease-associated region  34.93 
 
 		 513 aa  290  4e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4678  amino acid permease-associated region  33.2 
 
 		 508 aa  233  6e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4908  amino acid permease-associated region  32.02 
 
 		 484 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1629  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 485 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3425  amino acid permease-associated region  28.04 
 
 		 456 aa  148  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4004  amino acid permease-associated region  27.99 
 
 		 456 aa  147  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3079  amino acid permease-associated region  27.83 
 
 		 456 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0575  amino acid permease-associated region  26.86 
 
 		 455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02383  amino acid transporter transmembrane protein  24.95 
 
 		 458 aa  108  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  27.01 
 
 		 477 aa  88.2  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  22.79 
 
 		 466 aa  78.2  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  23.75 
 
 		 465 aa  77.4  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  23.58 
 
 		 542 aa  74.7  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  23.06 
 
 		 460 aa  73.2  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  22.56 
 
 		 462 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0935  amino acid permease-associated region  23.45 
 
 		 513 aa  71.6  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  23.81 
 
 		 449 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1252  amino acid permease-associated region  26.56 
 
 		 481 aa  71.2  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  24.35 
 
 		 463 aa  69.7  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  24.35 
 
 		 463 aa  68.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  24.04 
 
 		 549 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  27.62 
 
 		 478 aa  69.3  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  23.3 
 
 		 455 aa  68.6  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  24.93 
 
 		 440 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  25.52 
 
 		 566 aa  68.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  24.2 
 
 		 454 aa  67.8  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  24.57 
 
 		 466 aa  67.8  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  23.48 
 
 		 473 aa  67.8  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  24.65 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  22.43 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  22.43 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  26.01 
 
 		 518 aa  67  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0553  amino acid permease-associated region  22.47 
 
 		 466 aa  67  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.824768 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  24.53 
 
 		 476 aa  67  0.0000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0590  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 		 489 aa  66.6  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806794  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  24.03 
 
 		 491 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  20.5 
 
 		 502 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2573  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 457 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  23.55 
 
 		 495 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  23.1 
 
 		 491 aa  65.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  25.38 
 
 		 500 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  25.87 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  24.46 
 
 		 486 aa  64.7  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  22.13 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  24.24 
 
 		 538 aa  64.7  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  20.5 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  20.5 
 
 		 511 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  22.84 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  22.72 
 
 		 496 aa  63.9  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1963  amino acid permease-associated region  23.54 
 
 		 468 aa  63.5  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.281005 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  24.93 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3674  amino acid permease-associated region  25.88 
 
 		 487 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  22.07 
 
 		 450 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  23.99 
 
 		 481 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  22.68 
 
 		 471 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  26.41 
 
 		 494 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  22.68 
 
 		 471 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  22.68 
 
 		 471 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  22.68 
 
 		 471 aa  62  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  22.4 
 
 		 471 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00849  cationic amino acid transporter  23.81 
 
 		 476 aa  61.6  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000255765  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  22.68 
 
 		 471 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  24.24 
 
 		 463 aa  61.6  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  24.37 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3885  amino acid permease-associated region  25.93 
 
 		 487 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06078  cationic amino acid transporter  23.81 
 
 		 476 aa  61.6  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210338  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  24.33 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  22.68 
 
 		 471 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  22.25 
 
 		 450 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  25.68 
 
 		 461 aa  61.6  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0867  amino acid permease-associated region  22.29 
 
 		 469 aa  61.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0719  amino acid permease family protein  22.29 
 
 		 469 aa  61.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.544014  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  22.25 
 
 		 450 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04210  putative transporter  24.61 
 
 		 464 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  23.67 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0388  amino acid transporter  24.83 
 
 		 483 aa  60.5  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000257428  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 495 aa  60.5  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  24.02 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3252  amino acid permease-associated region  26.08 
 
 		 464 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719385  normal  0.223004 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  24.36 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 		 482 aa  59.7  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  23.43 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>