More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1785 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1785  response regulator receiver protein  100 
 
 		 120 aa  244  4e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0637089  normal  0.834554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4999  response regulator receiver protein  59.17 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1998  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0325  response regulator receiver protein  55.83 
 
 		 298 aa  137  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314809  normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30870  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  58.33 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3595  response regulator receiver  53.33 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682594  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0217  response regulator receiver protein  56.03 
 
 		 122 aa  130  9e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2317  response regulator receiver protein  49.17 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4220  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 120 aa  100  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3845  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3929  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 120 aa  98.6  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0321819 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 119 aa  97.4  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3311  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3119  response regulator receiver domain-containing protein  40.68 
 
 		 120 aa  94.7  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0403  chemotaxis protein CheY  38.98 
 
 		 120 aa  94.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.286627  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3419  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  41.13 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  40.65 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  39.84 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  39.02 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1205  CheY response regulator  37.19 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.310964  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  39.02 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  39.02 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  39.02 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  38.21 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3157  response regulator receiver protein  42.34 
 
 		 266 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  37.19 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0323  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47332  normal  0.784994 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3597  response regulator receiver  42.15 
 
 		 131 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.593554  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  36.94 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2000  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0651  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.747314  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0334  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.238286 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0302  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00186383  normal  0.501704 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5001  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3596  two component transcriptional regulator  38.66 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  34.71 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  40.52 
 
 		 423 aa  75.9  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2094  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1880  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.578036 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2111  Fis family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5477  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  36.97 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  36.97 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3302  chemotaxis response regulator, CheY4  37.5 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4035  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2219  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5320  winged helix family two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 242 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2365  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00457125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2097  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.371893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5228  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.661336  normal  0.450139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5367  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2248  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0154  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5606  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 229 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3838  response regulator receiver domain-containing protein  37.82 
 
 		 234 aa  74.3  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000539223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4072  chemotaxis receiver protein  33.61 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48520  phosphate regulon response regulator; PhoB  36.97 
 
 		 229 aa  73.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0667889  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  35.54 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  35.83 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  35.29 
 
 		 230 aa  73.9  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  35.54 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  35.54 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2657  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0140925  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2120  chemotaxis protein CheY  38.02 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4408  two component transcriptional regulator  36.13 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0897949 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1368  response regulator receiver domain-containing protein  35.4 
 
 		 386 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  32.77 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4400  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  35.54 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  32.77 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2585  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 385 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0237  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 440 aa  72.4  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2650  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6138  two-component response regulator PhoB  36.13 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2513  ATP-binding region, ATPase-like  34.15 
 
 		 945 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.543755  normal  0.160676 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2489  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 385 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 121 aa  72  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70750  two-component response regulator PhoB  36.13 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  38.4 
 
 		 122 aa  72  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1787  response regulator receiver protein  41.28 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.860265  normal  0.648843 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0495  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 423 aa  72.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5482  response regulator  34.92 
 
 		 297 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.420057  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  32.77 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5036  response regulator receiver  35.48 
 
 		 294 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.118598 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0184  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 302 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0239  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.82609  normal  0.256114 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1536  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  35.29 
 
 		 230 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>