42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4607 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4607  transcription activator, effector binding  100 
 
 		 156 aa  315  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0684789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0754  transcription activator, effector binding  33.33 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.287281  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2087  transcription activator effector binding  29.8 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000102768 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6173  transcriptional activator ligand binding domain protein  33.12 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0354767  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0005  hypothetical protein  29.11 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.251807  normal  0.30014 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1364  hypothetical protein  31.5 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.33275  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28460  transcriptional regulator, effector-binding domain/component  32.56 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1132  transcription activator, effector binding  29.49 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1653  transcriptional activator ligand binding domain protein  32 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0385055  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1851  transcription activator effector binding  26.17 
 
 		 241 aa  54.7  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.493771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0263  transcription activator, effector binding protein  31.55 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4913  transcriptional activator ligand binding domain protein  26.67 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00232908  normal  0.22679 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3492  transcriptional activator ligand binding domain protein  33.33 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2459  transcriptional activator ligand binding domain protein  28.29 
 
 		 550 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000187562  normal  0.0403698 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0304  transcription activator, effector binding  21.64 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2841  transcription activator effector binding  23.53 
 
 		 249 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.203894 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  28.86 
 
 		 274 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0182  transcription activator effector binding  24.29 
 
 		 236 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3657  transcription activator effector binding  26.43 
 
 		 259 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217912  hitchhiker  0.00540131 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22660  transcriptional regulator, effector-binding domain/component  34.74 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2946  transcription activator effector binding  22.79 
 
 		 298 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  hitchhiker  0.00143394 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  28.48 
 
 		 274 aa  48.5  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0593  transcription activator, effector binding  25 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2214  transcriptional activator ligand binding domain protein  29.77 
 
 		 210 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307481  normal  0.371698 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3920  transcription activator, effector binding  28.24 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2777  transcription activator, effector binding  22.02 
 
 		 242 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0772774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0371  hypothetical protein  21.8 
 
 		 240 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001595  hypothetical protein  30.71 
 
 		 309 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00208101  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0410  transcription activator effector binding  22 
 
 		 227 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.122194  normal  0.857811 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  31.65 
 
 		 270 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3847  transcriptional activator ligand binding domain protein  27.19 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3576  transcription activator, effector binding  22.94 
 
 		 242 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2719  transcription activator effector binding  21.32 
 
 		 257 aa  43.9  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0345  transcription activator effector binding  22.48 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 292 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07010  hypothetical protein  25.26 
 
 		 343 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5334  transcription activator effector binding  25.55 
 
 		 255 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  24 
 
 		 269 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0318  transcription activator effector binding  21.43 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  25.98 
 
 		 267 aa  41.6  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  27.41 
 
 		 276 aa  40.8  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  21.49 
 
 		 269 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>