More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4578 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4578  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 232 aa  457  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0933  two component transcriptional regulator  75 
 
 		 253 aa  328  3e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3871  two component transcriptional regulator  70.26 
 
 		 230 aa  312  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4632  two component transcriptional regulator  70.26 
 
 		 239 aa  311  5.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.920872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  54.39 
 
 		 220 aa  229  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  53.91 
 
 		 218 aa  221  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  52.42 
 
 		 220 aa  214  9e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4239  two component transcriptional regulator  51.1 
 
 		 220 aa  211  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0202421  normal  0.361244 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  51.74 
 
 		 221 aa  211  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  51.3 
 
 		 221 aa  210  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  52.16 
 
 		 219 aa  209  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  51.09 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  50.66 
 
 		 222 aa  206  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  51.29 
 
 		 219 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.74 
 
 		 219 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 220 aa  203  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6226  two component transcriptional regulator  51.53 
 
 		 221 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.75 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  51.98 
 
 		 220 aa  202  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5866  two component transcriptional regulator  51.97 
 
 		 221 aa  201  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  47.62 
 
 		 232 aa  202  5e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  50.43 
 
 		 221 aa  201  6e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  47.19 
 
 		 223 aa  200  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 220 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 220 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2328  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 227 aa  197  9e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0277  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.344057 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3430  transcriptional regulator  50.66 
 
 		 221 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  48.91 
 
 		 220 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2197  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.71 
 
 		 219 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3075  two component transcriptional regulator  51.1 
 
 		 220 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0867071  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  48.91 
 
 		 220 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3680  histidine kinase A domain-containing protein  50.22 
 
 		 220 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.894604 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3528  DNA-binding transcriptional regulator QseB  48.02 
 
 		 219 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0692  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 224 aa  194  7e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3362  DNA-binding transcriptional regulator QseB  48.02 
 
 		 219 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3358  DNA-binding transcriptional regulator QseB  48.02 
 
 		 219 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3427  DNA-binding transcriptional regulator QseB  48.02 
 
 		 219 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  0.844658 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3433  DNA-binding transcriptional regulator QseB  48.02 
 
 		 219 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  49.14 
 
 		 223 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1894  DNA-binding response regulator  51.97 
 
 		 220 aa  194  9e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 227 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  48.91 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  48.47 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2076  OmpR family two-component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000231542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3011  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1075  two component transcriptional regulator  50.66 
 
 		 220 aa  192  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2596  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.606495  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4829  DNA-binding response regulator  50.22 
 
 		 235 aa  192  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00101292  normal  0.0130353 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1255  hypothetical protein  47.66 
 
 		 225 aa  191  6e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1254  hypothetical protein  47.66 
 
 		 225 aa  191  6e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4876  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 221 aa  191  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.292661  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  46.47 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  48.48 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2066  two component transcriptional regulator QseB  48.03 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3429  DNA-binding transcriptional regulator QseB  46.26 
 
 		 219 aa  191  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  48.46 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0503  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 227 aa  189  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4243  response regulator receiver  52.42 
 
 		 219 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.376113 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  45.65 
 
 		 222 aa  188  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  49.14 
 
 		 220 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3786  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 		 279 aa  188  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  44.54 
 
 		 221 aa  188  7e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3459  DNA-binding transcriptional regulator QseB  46.7 
 
 		 219 aa  188  7e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469494  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4863  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 		 244 aa  187  9e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.494797 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  46.44 
 
 		 242 aa  187  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0751826 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0675  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.7 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0830  DNA-binding response regulator  50.66 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0346205  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2208  response regulator protein  50.66 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000167641  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1765  DNA-binding response regulator  50.66 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.003723  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0866  DNA-binding response regulator  50.66 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.775386  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0958  DNA-binding response regulator  50.66 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000129968  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0050  DNA-binding response regulator  50.66 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000526726  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1570  DNA-binding response regulator  50.66 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00189564  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0124  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 220 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.0356027 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1638  two component transcriptional regulator  48.9 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3511  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  51.53 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6233  two component transcriptional regulator  46.96 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4334  DNA-binding transcriptional regulator QseB  46.26 
 
 		 219 aa  186  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02897  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with QseC  46.26 
 
 		 219 aa  185  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0672  DNA-binding transcriptional regulator QseB  46.26 
 
 		 219 aa  185  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.033173 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 239 aa  185  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3314  DNA-binding transcriptional regulator QseB  46.26 
 
 		 219 aa  185  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02847  hypothetical protein  46.26 
 
 		 219 aa  185  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.196232  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  47.62 
 
 		 223 aa  185  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3399  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 223 aa  184  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 		 235 aa  184  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  43.61 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3203  DNA-binding transcriptional regulator QseB  46.26 
 
 		 219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2735  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6259  two component response regulator  43.23 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1783  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  45.89 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  50.43 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.81 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4141  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.34 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  41.92 
 
 		 218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  50.86 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>