More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2565 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2565  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
141 aa  282  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  hitchhiker  0.00490818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3571  biopolymer transport protein ExbD/TolR  82.27 
 
 
141 aa  234  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161015  decreased coverage  0.00354496 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2948  biopolymer transport protein ExbD/TolR  79.29 
 
 
142 aa  231  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1555  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  82.98 
 
 
141 aa  231  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2304  biopolymer transport protein ExbD/TolR  82.98 
 
 
141 aa  231  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0677093  normal  0.134165 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4892  biopolymer transport protein ExbD/TolR  77.7 
 
 
144 aa  223  5.0000000000000005e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.310639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1924  biopolymer transport protein ExbD/TolR  75.36 
 
 
144 aa  219  7e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  76.26 
 
 
142 aa  217  3.9999999999999997e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2642  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  75.18 
 
 
147 aa  194  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333418  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2484  putative biopolymer transport exbD-related transmembrane protein  70.59 
 
 
147 aa  187  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0200822  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2554  biopolymer transport protein ExbD/TolR  65.96 
 
 
141 aa  186  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133317 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0536  biopolymer transport protein ExbD/TolR  61.43 
 
 
143 aa  164  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000196939  hitchhiker  0.000000905807 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  60 
 
 
143 aa  163  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395657  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2806  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  56.52 
 
 
142 aa  157  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0047121  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2529  biopolymer transport EXBD-like transmembrane protein  54.93 
 
 
143 aa  156  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.161438  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  56.52 
 
 
142 aa  153  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0584856  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3216  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.86 
 
 
141 aa  149  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300081  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3209  biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.15 
 
 
137 aa  147  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537129  normal  0.265512 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1028  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.21 
 
 
138 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000374903  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2091  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.43 
 
 
140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0833564  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1509  biopolymer transport exbD-related transmembrane protein  54.01 
 
 
138 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.171101  normal  0.278773 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0632  biopolymer ExbD/TolR family transporter  49.26 
 
 
141 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0285  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.41 
 
 
149 aa  122  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0313  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.15 
 
 
158 aa  120  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.13 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 
140 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1730  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.04 
 
 
132 aa  97.1  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.34 
 
 
141 aa  97.1  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1247  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.77 
 
 
140 aa  96.3  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00589  biopolymer transport protein  36.57 
 
 
154 aa  95.5  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265658  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.09 
 
 
145 aa  92.8  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  36.09 
 
 
145 aa  92.8  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14750  Biopolymer transport protein ExbD  33.33 
 
 
142 aa  92  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1613  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.3 
 
 
142 aa  92  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.921592  normal  0.194939 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2060  GTP cyclohydrolase I  37.31 
 
 
143 aa  87  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2151  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
140 aa  86.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0691787  normal  0.335965 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4176  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.65 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0268987  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.83 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  34.56 
 
 
134 aa  84  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.56 
 
 
134 aa  84  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.39 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1634  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.35 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0335583  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3846  biopolymer transport protein ExbD/TolR family  32.35 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.661546  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.83 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1061  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.06 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.88 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1317  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.31 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.893415  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25500  hypothetical protein  31.82 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.236019  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2179  hypothetical protein  31.82 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.39 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4033  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.08 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439813  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4149  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.03 
 
 
159 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0136307  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  36.29 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.47 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.376121  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4176  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.56 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0919098  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0267  biopolymer transport protein ExbD  30.23 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.134786  normal  0.162508 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0947  protein TolR  29.79 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.324869  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0673  biopolymer transport protein ExbD  30.23 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.717059  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0592  biopolymer transport protein ExbD  30.23 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  31.78 
 
 
133 aa  67  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0573  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.38 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.234389  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2462  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.62 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0870388  normal  0.859311 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3116  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.58 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.243499  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4650  TonB system transport protein ExbD  32.58 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  30 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2305  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.68 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.56 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0389  biopolymer transport protein ExbD  29.01 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.627769  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.03 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.203844  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.2 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  28.35 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.2 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0346  biopolymer transport protein ExbD  29.01 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.03 
 
 
141 aa  62.8  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1510  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.43 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43562  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0395  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.85 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30482  hitchhiker  0.000338676 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.46 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.09 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2066  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.78 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5556  biopolymer transport protein ExbD  31.01 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0784  protein TolR  30.77 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1158  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.59 
 
 
139 aa  62  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.399556  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2673  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.59 
 
 
139 aa  62  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3760  TonB system transport protein ExbD  31.97 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3905  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28 
 
 
133 aa  62  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.396754  normal  0.163087 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  28.91 
 
 
136 aa  61.6  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3597  TonB system transport protein ExbD  31.4 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1506  biopolymer transport protein  27.54 
 
 
136 aa  62  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000178844  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.56 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0605408  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
144 aa  61.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2358  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.08 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.309044  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1147  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.15 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2923  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.82 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.986403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2229  inner membrane protein  33.86 
 
 
141 aa  60.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243191  normal  0.205918 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1268  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.23 
 
 
156 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0930334  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2306  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.23 
 
 
156 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.426715  normal  0.290697 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3121  protein TolR  29.71 
 
 
142 aa  60.5  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1407  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.43 
 
 
139 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.757544  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3544  biopolymer transport protein ExbD  30.83 
 
 
156 aa  60.5  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.8 
 
 
137 aa  60.5  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>