298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1061 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1061  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
158 aa  318  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1317  biopolymer transport protein ExbD/TolR  98.6 
 
 
143 aa  286  8e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.893415  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3209  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.62 
 
 
137 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537129  normal  0.265512 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.84 
 
 
140 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25500  hypothetical protein  41.73 
 
 
146 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.236019  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1028  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.4 
 
 
138 aa  101  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000374903  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2179  hypothetical protein  41.73 
 
 
146 aa  101  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2060  GTP cyclohydrolase I  39.13 
 
 
143 aa  100  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14750  Biopolymer transport protein ExbD  38.97 
 
 
142 aa  97.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1613  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.76 
 
 
142 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.921592  normal  0.194939 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2948  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.81 
 
 
142 aa  95.5  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1924  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.81 
 
 
144 aa  94.4  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.09 
 
 
141 aa  94.4  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4176  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.29 
 
 
142 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0268987  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0632  biopolymer ExbD/TolR family transporter  34.29 
 
 
141 aa  91.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1555  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.35 
 
 
141 aa  91.7  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2304  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.35 
 
 
141 aa  91.7  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0677093  normal  0.134165 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.09 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2565  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.06 
 
 
141 aa  89  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  hitchhiker  0.00490818 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.84 
 
 
141 aa  89.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4892  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.09 
 
 
144 aa  89.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.310639 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2091  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.33 
 
 
140 aa  87.8  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0833564  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2554  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.89 
 
 
141 aa  87.4  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133317 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2151  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.13 
 
 
140 aa  87.4  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0691787  normal  0.335965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3571  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.84 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161015  decreased coverage  0.00354496 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.33 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2484  putative biopolymer transport exbD-related transmembrane protein  38.35 
 
 
147 aa  86.3  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0200822  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2642  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.57 
 
 
147 aa  85.5  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333418  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1634  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.56 
 
 
143 aa  84  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0335583  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.34 
 
 
137 aa  84.3  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00589  biopolymer transport protein  36.15 
 
 
154 aa  83.6  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265658  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2529  biopolymer transport EXBD-like transmembrane protein  35.29 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.161438  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1509  biopolymer transport exbD-related transmembrane protein  38.06 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.171101  normal  0.278773 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3846  biopolymer transport protein ExbD/TolR family  34.06 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.661546  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2806  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.56 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0047121  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.81 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395657  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3216  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.69 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300081  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0536  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.81 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000196939  hitchhiker  0.000000905807 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.82 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0584856  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.6 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  33.6 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1510  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.5 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43562  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1247  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.58 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.6 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3815  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.77 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0446813  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0285  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.66 
 
 
149 aa  73.6  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.04 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0605408  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0313  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1899  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.04 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000511207 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1730  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.86 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.85 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  29.85 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3905  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.58 
 
 
133 aa  63.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.396754  normal  0.163087 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1506  biopolymer transport protein  28.57 
 
 
136 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000178844  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  32.52 
 
 
173 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.76 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140985 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2221  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.83 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109447  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.79 
 
 
166 aa  54.3  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1239  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.37 
 
 
148 aa  54.3  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.371549  normal  0.35298 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.22 
 
 
135 aa  54.3  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  25.81 
 
 
136 aa  53.9  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0915  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.69 
 
 
140 aa  53.9  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.574244  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0443  biopolymer ExbD/TolR family transporter  30.65 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102103  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0670  biopolymer ExbD/TolR family transporter  30.65 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  22.95 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.01 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  24.19 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0560  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.47 
 
 
137 aa  52  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.326497 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.51 
 
 
142 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  29.51 
 
 
142 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  29.51 
 
 
142 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.51 
 
 
142 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  29.51 
 
 
142 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  29.51 
 
 
140 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2991  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.02 
 
 
134 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  0.0282837 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  29.51 
 
 
142 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1961  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.46 
 
 
174 aa  51.6  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00643734  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.51 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.27 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2919  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.2 
 
 
134 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0661927  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2402  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.26 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.705571  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.28 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3166  protein TolR  23.33 
 
 
158 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  22.95 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2392  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.74 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.791616 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  22.95 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4033  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.35 
 
 
158 aa  51.2  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439813  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  28.46 
 
 
134 aa  50.8  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0453  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.69 
 
 
134 aa  50.8  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00775346  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.46 
 
 
143 aa  50.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3522  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.3 
 
 
133 aa  50.8  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0438  biopolymer ExbD/TolR family transporter  30.83 
 
 
137 aa  50.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.744335  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.85 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  28.46 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.09 
 
 
131 aa  50.4  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.376121  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0455  biopolymer transport protein (ExbD2)  27.54 
 
 
134 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0057258  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.46 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0784  protein TolR  25.6 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2155  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.4 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  24.17 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>