37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1604 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1604  TonB family protein  100 
 
 
243 aa  424  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.013758  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0871  TonB family protein  64.61 
 
 
246 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286115 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0168  TonB family protein  40 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.500537 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  42.53 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  45.68 
 
 
285 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  37.97 
 
 
208 aa  52.8  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3878  TonB-like protein  42.7 
 
 
261 aa  52.8  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.781736  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  31.48 
 
 
249 aa  52.8  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  41.49 
 
 
859 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  37.65 
 
 
267 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  31.69 
 
 
225 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  36.84 
 
 
221 aa  48.5  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  43.55 
 
 
269 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  32.89 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  43.08 
 
 
289 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  36.84 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  36.05 
 
 
190 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  38.36 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  36.14 
 
 
237 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  39.19 
 
 
565 aa  46.2  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  41.67 
 
 
221 aa  45.8  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  28.21 
 
 
300 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  35.48 
 
 
271 aa  45.4  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  30.73 
 
 
228 aa  45.4  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  32.14 
 
 
332 aa  45.4  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  37.21 
 
 
252 aa  45.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2295  transport protein TonB  37.21 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  38.67 
 
 
283 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  26.57 
 
 
582 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  32.08 
 
 
215 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2441  TonB family protein  36.89 
 
 
210 aa  43.5  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124389  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  36.47 
 
 
277 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  31.82 
 
 
390 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  36.25 
 
 
319 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  30.41 
 
 
443 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01075  TonB family C-terminal domain protein  29.59 
 
 
170 aa  41.6  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453283  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06244  TonB family C-terminal domain protein  29.59 
 
 
170 aa  41.6  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.484779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>