More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1445 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  364  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  98.9 
 
 
182 aa  362  2e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  37.29 
 
 
188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  40.46 
 
 
173 aa  127  7.000000000000001e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  36.11 
 
 
182 aa  120  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  33.89 
 
 
179 aa  114  8.999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  34.08 
 
 
180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  38.2 
 
 
178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  33.51 
 
 
406 aa  111  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0973  cytochrome b561 family protein  36.21 
 
 
181 aa  110  9e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.304775  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  33.9 
 
 
184 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  34.48 
 
 
191 aa  108  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  41.45 
 
 
416 aa  107  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  36.93 
 
 
188 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  36.09 
 
 
180 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  34.73 
 
 
188 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1610  cytochrome B561  36.81 
 
 
176 aa  106  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  34.97 
 
 
222 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2570  cytochrome B561  34.95 
 
 
197 aa  106  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  32.98 
 
 
410 aa  105  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  33.33 
 
 
195 aa  105  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  34.78 
 
 
199 aa  104  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  36.96 
 
 
203 aa  104  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  34.22 
 
 
185 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  35.45 
 
 
190 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  31.67 
 
 
193 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0153  nickel-dependent hydrogenase b- type cytochrome subunit  37.36 
 
 
173 aa  103  2e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.520725  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  34.81 
 
 
192 aa  102  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  34.44 
 
 
182 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  32.04 
 
 
187 aa  102  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  32 
 
 
186 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  32.76 
 
 
186 aa  101  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  32.57 
 
 
186 aa  101  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  32.42 
 
 
183 aa  101  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  33.33 
 
 
187 aa  101  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  30 
 
 
193 aa  101  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  32.18 
 
 
186 aa  100  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  32.57 
 
 
186 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  32.57 
 
 
186 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  32.57 
 
 
186 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  36.05 
 
 
175 aa  100  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  37.85 
 
 
196 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  31.32 
 
 
189 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  31.67 
 
 
196 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1400  cytochrome B561  30.6 
 
 
397 aa  99.8  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1216  cytochrome b561  34.78 
 
 
183 aa  98.6  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000559854  normal  0.299312 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  36.57 
 
 
176 aa  99  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  32.2 
 
 
186 aa  98.2  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  35.03 
 
 
189 aa  97.8  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  35.2 
 
 
183 aa  97.4  9e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  32.95 
 
 
188 aa  97.1  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  35.09 
 
 
174 aa  97.1  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  37.22 
 
 
181 aa  97.1  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  32.39 
 
 
186 aa  97.1  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2093  cytochrome B561  36.05 
 
 
175 aa  97.1  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  32 
 
 
186 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  36 
 
 
176 aa  96.7  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2184  putative cytochrome B561  31.28 
 
 
400 aa  96.7  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3871  putative cytochrome b561  35.35 
 
 
195 aa  96.3  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  36.61 
 
 
183 aa  96.3  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  33.69 
 
 
203 aa  95.9  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  31.58 
 
 
192 aa  95.9  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0932  cytochrome b561 family protein  32.95 
 
 
173 aa  95.5  3e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  37.57 
 
 
188 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  35.39 
 
 
183 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  34.22 
 
 
201 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  30.68 
 
 
178 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  31.82 
 
 
184 aa  94.7  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  32.6 
 
 
189 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  32.04 
 
 
189 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  32.56 
 
 
197 aa  94.4  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  31.25 
 
 
184 aa  94.4  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2495  putative cytochrome B561  30 
 
 
188 aa  94  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.943457 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  36.81 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  36.57 
 
 
183 aa  93.2  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0583  cytochrome B561  35.11 
 
 
191 aa  93.2  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  31.87 
 
 
181 aa  93.2  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  33.7 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02672  cytochrome b561, putative  31.94 
 
 
188 aa  90.9  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  32.6 
 
 
183 aa  90.5  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2791  cytochrome B561  29.67 
 
 
182 aa  90.5  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  33.15 
 
 
190 aa  90.1  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  32.8 
 
 
188 aa  90.1  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  33.15 
 
 
183 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1120  cytochrome B561  34.44 
 
 
184 aa  89.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000137011  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2876  cytochrome B561  34.81 
 
 
185 aa  89.4  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.379711  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  29.61 
 
 
204 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  32.95 
 
 
183 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2152  cytochrome B561  36.47 
 
 
180 aa  89  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00081786  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  32.26 
 
 
197 aa  88.6  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  30.81 
 
 
189 aa  88.2  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  32.95 
 
 
183 aa  88.2  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  30.56 
 
 
183 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000195  cytochrome b561  31.46 
 
 
179 aa  88.6  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000187144  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  30.43 
 
 
181 aa  88.6  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1464  cytochrome B561  33.15 
 
 
179 aa  88.2  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1447  cytochrome B561  27.01 
 
 
174 aa  88.2  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  32.37 
 
 
183 aa  88.2  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1335  cytochrome b561 family protein  27.01 
 
 
174 aa  88.2  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2725  cytochrome b561 family protein  27.01 
 
 
174 aa  88.2  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>