181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2955 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  100 
 
 
475 aa  940  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  55.97 
 
 
447 aa  430  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  50 
 
 
438 aa  372  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  1.56043e-06 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  50.73 
 
 
486 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  42.89 
 
 
434 aa  337  4e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  47.46 
 
 
452 aa  335  1e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  43.24 
 
 
441 aa  333  5e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  46.56 
 
 
425 aa  332  9e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  44.37 
 
 
433 aa  329  7e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  45.05 
 
 
435 aa  318  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  46.44 
 
 
432 aa  316  6e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  43.79 
 
 
437 aa  313  4e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  43.48 
 
 
473 aa  306  7e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  43.56 
 
 
437 aa  303  6e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  43.41 
 
 
439 aa  296  4e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  41.01 
 
 
427 aa  296  4e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  41.37 
 
 
437 aa  278  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  40.04 
 
 
445 aa  277  4e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  41.45 
 
 
438 aa  276  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  33.48 
 
 
437 aa  275  9e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  33.04 
 
 
437 aa  274  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  37.31 
 
 
428 aa  271  3e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  32.59 
 
 
434 aa  270  3e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  1.5326e-08 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  32.59 
 
 
437 aa  269  6e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  32.67 
 
 
438 aa  269  8e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  32.37 
 
 
437 aa  267  3e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  32.37 
 
 
437 aa  267  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  32.08 
 
 
437 aa  266  5e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  32.15 
 
 
437 aa  266  5e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  32.08 
 
 
437 aa  266  5e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  38.99 
 
 
436 aa  264  3e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  32.96 
 
 
437 aa  263  7e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  38.5 
 
 
470 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  34.2 
 
 
424 aa  223  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  33.05 
 
 
460 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  31.72 
 
 
464 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  33.19 
 
 
417 aa  207  4e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  34.15 
 
 
423 aa  204  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.36 
 
 
445 aa  200  4e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  30.91 
 
 
412 aa  200  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  31.73 
 
 
429 aa  199  1e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  32.46 
 
 
442 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  32.82 
 
 
464 aa  193  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  33.55 
 
 
440 aa  189  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  31.29 
 
 
469 aa  188  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  31.86 
 
 
415 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  31.19 
 
 
415 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  31.42 
 
 
415 aa  183  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  30.56 
 
 
439 aa  180  5e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  30.34 
 
 
478 aa  165  1e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.35 
 
 
409 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  32.77 
 
 
466 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.06 
 
 
449 aa  127  4e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  33.77 
 
 
411 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  30.2 
 
 
418 aa  122  1e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  24.34 
 
 
574 aa  118  2e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.04 
 
 
417 aa  111  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.1 
 
 
429 aa  110  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  22.82 
 
 
556 aa  108  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.76 
 
 
462 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  28.82 
 
 
427 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14850  D-arabinono-1,4-lactone oxidase  31.93 
 
 
246 aa  100  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156556  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  30.75 
 
 
430 aa  100  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  25 
 
 
437 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  29.22 
 
 
421 aa  96.3  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  30.5 
 
 
423 aa  95.1  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  26.45 
 
 
446 aa  95.5  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  35 
 
 
418 aa  93.2  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  27.47 
 
 
421 aa  90.5  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  38.62 
 
 
424 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.75 
 
 
504 aa  87.4  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  29.8 
 
 
448 aa  80.9  4e-14  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  33.51 
 
 
413 aa  81.3  4e-14  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  1.42311e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  29.44 
 
 
366 aa  78.6  2e-13  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  28.46 
 
 
572 aa  78.6  2e-13  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  24.08 
 
 
483 aa  73.6  7e-12  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1781  FAD/FMN-containing dehydrogenase  21.53 
 
 
642 aa  73.6  7e-12  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.926813  normal  0.0106686 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.73 
 
 
453 aa  63.9  6e-09  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.78 
 
 
472 aa  60.5  7e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02192  conserved hypothetical protein  27.68 
 
 
376 aa  59.3  1e-07  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118307  normal  0.261701 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14476  predicted protein  30.34 
 
 
558 aa  59.3  2e-07  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10062  oxidoreductase  33.89 
 
 
479 aa  59.3  2e-07  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.761932 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  36.18 
 
 
1070 aa  57.8  4e-07  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  25.36 
 
 
481 aa  57.4  6e-07  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.35 
 
 
805 aa  57  7e-07  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.258933  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2963  FAD binding domain-containing protein  30.35 
 
 
805 aa  57  7e-07  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000276895 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  33.01 
 
 
452 aa  57  7e-07  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  23.08 
 
 
474 aa  57  8e-07  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  27.22 
 
 
478 aa  57  8e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  35.71 
 
 
446 aa  56.6  9e-07  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  32.52 
 
 
455 aa  56.6  9e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  27.22 
 
 
468 aa  56.6  9e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  27.22 
 
 
478 aa  56.6  1e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  29.44 
 
 
457 aa  55.5  2e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.16 
 
 
463 aa  55.5  2e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  26.95 
 
 
478 aa  55.5  2e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  29.44 
 
 
457 aa  55.5  2e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.04 
 
 
490 aa  55.1  3e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  24.85 
 
 
475 aa  54.7  3e-06  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.65 
 
 
462 aa  55.1  3e-06  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>