More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1901 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1901  NUDIX hydrolase  100 
 
 
231 aa  448  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  54.46 
 
 
225 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1949  NUDIX hydrolase  52.99 
 
 
224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3375  NUDIX hydrolase  56.7 
 
 
225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16300  NTP pyrophosphohydrolase  60.13 
 
 
237 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18200  NUDIX family protein  56.84 
 
 
269 aa  171  6.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1716  NUDIX hydrolase  50.43 
 
 
223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  51.78 
 
 
229 aa  160  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0721  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
234 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0325  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 
278 aa  143  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760343  normal  0.0266533 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0509  NUDIX hydrolase  49.21 
 
 
291 aa  141  7e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1069  NUDIX hydrolase  47.69 
 
 
213 aa  139  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4847  NUDIX hydrolase  50.31 
 
 
203 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4317  NUDIX hydrolase  46.46 
 
 
230 aa  137  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0119  hypothetical protein  45.45 
 
 
221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4290  NUDIX hydrolase  45.36 
 
 
300 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4757  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0108621  hitchhiker  0.0018252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0257  NUDIX hydrolase  47.47 
 
 
246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8861  NUDIX hydrolase  43.38 
 
 
239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3928  NUDIX hydrolase  44.39 
 
 
234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13703  hypothetical protein  43.65 
 
 
273 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0211128 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0521  NUDIX hydrolase  45.21 
 
 
254 aa  132  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0470  hypothetical protein  45.83 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.779717 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0342  NUDIX hydrolase  44.74 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5201  NUDIX hydrolase  42.29 
 
 
259 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.839635  hitchhiker  0.000709273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4814  NUDIX hydrolase  42.29 
 
 
259 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4900  NUDIX hydrolase  42.29 
 
 
259 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5431  NUDIX hydrolase  38.66 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1375  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1374  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1991  NUDIX hydrolase  43.72 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25380  ADP-ribose pyrophosphatase  40.51 
 
 
212 aa  115  6.9999999999999995e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5317  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
217 aa  111  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.351824 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0206  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 
215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0488394  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0421  NUDIX hydrolase  49.66 
 
 
233 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218959  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  38.25 
 
 
195 aa  95.1  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  33.77 
 
 
199 aa  95.1  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2914  NUDIX hydrolase  37.57 
 
 
214 aa  93.6  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0196675  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4241  NUDIX hydrolase  49.54 
 
 
219 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  32.45 
 
 
199 aa  93.6  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  41.06 
 
 
245 aa  92  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 
235 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  32.65 
 
 
204 aa  90.1  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 
211 aa  89  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
243 aa  88.6  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  43.26 
 
 
211 aa  88.2  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 
214 aa  87.8  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 
195 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 
195 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  40 
 
 
195 aa  87.8  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26210  NUDIX family protein  36.65 
 
 
237 aa  87.4  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0881576  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 
195 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  40 
 
 
223 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 
202 aa  85.9  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  32.91 
 
 
200 aa  85.1  9e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  37.99 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  41.61 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
197 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  39.35 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  37.79 
 
 
242 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  39.35 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  29.57 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  38.16 
 
 
168 aa  82  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  38.16 
 
 
168 aa  82  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  41.72 
 
 
239 aa  81.6  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  29.15 
 
 
195 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  36.63 
 
 
203 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
204 aa  81.3  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15860  hypothetical protein  36.81 
 
 
203 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0480396 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 
220 aa  81.6  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  35 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  36.81 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  38.18 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1665  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.75 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  34.84 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  31.79 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4112  NUDIX hydrolase  48.62 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0690871  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  35.1 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
210 aa  79  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 
235 aa  78.6  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0464  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.75 
 
 
427 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.13 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 
195 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.26 
 
 
483 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.13 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.13 
 
 
333 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.13 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>