More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1710 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1710  ABC transporter related  100 
 
 		 238 aa  471  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0008  ABC transporter related  77.45 
 
 		 258 aa  348  3e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419449  hitchhiker  0.000235622 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0899  ABC transporter related  67.23 
 
 		 238 aa  320  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  52.79 
 
 		 233 aa  251  6e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  51.5 
 
 		 236 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  52.99 
 
 		 234 aa  244  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2394  ABC transporter related  51.46 
 
 		 241 aa  239  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.040758 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  51.71 
 
 		 251 aa  238  9e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4333  ABC transporter related  51.9 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175987  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  48.71 
 
 		 264 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  50.21 
 
 		 239 aa  235  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  51.07 
 
 		 234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.64 
 
 		 234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  47.64 
 
 		 234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  49.36 
 
 		 437 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  48.28 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  48.51 
 
 		 237 aa  233  1.0000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  48.74 
 
 		 239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.43 
 
 		 236 aa  232  3e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  45.57 
 
 		 238 aa  232  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  51.93 
 
 		 234 aa  232  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  49.79 
 
 		 238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  48.74 
 
 		 239 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3751  ABC transporter related  52.36 
 
 		 234 aa  231  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1776  ABC transporter related  50.42 
 
 		 244 aa  231  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  49.79 
 
 		 236 aa  231  6e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  49.79 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.5 
 
 		 234 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  48.09 
 
 		 247 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  44.73 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  49.79 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  44.73 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  44.73 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  44.73 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  48.51 
 
 		 258 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4793  ABC transporter related  48.07 
 
 		 233 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.262545  normal  0.126622 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  44.73 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  44.73 
 
 		 238 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  50.43 
 
 		 234 aa  230  2e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.73 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.73 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  45.15 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.73 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.73 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.73 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.73 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5326  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.42 
 
 		 243 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  47.66 
 
 		 247 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  47.66 
 
 		 247 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1617  ABC transporter related  49.36 
 
 		 234 aa  228  5e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.73 
 
 		 238 aa  228  5e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0545  ABC transporter related  50 
 
 		 234 aa  228  5e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.699298  hitchhiker  0.000807716 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2144  ABC transporter related  50 
 
 		 238 aa  228  6e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  50.64 
 
 		 234 aa  228  8e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  49.57 
 
 		 256 aa  227  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.26 
 
 		 234 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0338  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.29 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  49.37 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  46.78 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  48.93 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  46.41 
 
 		 238 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  44.73 
 
 		 238 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  48.28 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  50 
 
 		 245 aa  226  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  51.07 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.88 
 
 		 238 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3684  ABC transporter related  50.64 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  46.81 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  46.78 
 
 		 234 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  46.78 
 
 		 234 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  48.31 
 
 		 240 aa  226  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  49.57 
 
 		 234 aa  225  4e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3396  ABC transporter related  48.74 
 
 		 238 aa  225  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0282544 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  47.26 
 
 		 237 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.41 
 
 		 235 aa  224  6e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  48.28 
 
 		 235 aa  224  6e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  46.98 
 
 		 242 aa  225  6e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  46.98 
 
 		 242 aa  225  6e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.09 
 
 		 233 aa  224  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  49.37 
 
 		 247 aa  224  9e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  46.38 
 
 		 247 aa  224  9e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0703152 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  48.28 
 
 		 236 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3512  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49.14 
 
 		 243 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  45.99 
 
 		 238 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1619  ABC transporter related  48.74 
 
 		 244 aa  223  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  46.55 
 
 		 234 aa  224  1e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  48.28 
 
 		 235 aa  223  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  46.38 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  46.55 
 
 		 242 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5991  branched chain amino acid ABC tranpsorter ATP-binding protein  47.21 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  46.35 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  46.55 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  48.71 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  46.19 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3709  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.08 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0912  ABC transporter related  47.92 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  45.99 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  48.28 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  48.1 
 
 		 238 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  46.98 
 
 		 234 aa  222  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>