More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4982 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
368 aa  738    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  68.68 
 
 
367 aa  462  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  68.39 
 
 
367 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  62.67 
 
 
358 aa  451  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  62.64 
 
 
351 aa  443  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  62.01 
 
 
360 aa  440  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  66.48 
 
 
369 aa  425  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  61.78 
 
 
383 aa  424  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  53.89 
 
 
407 aa  360  1e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  38.21 
 
 
343 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  38.27 
 
 
355 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  38.27 
 
 
332 aa  179  9e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  36.86 
 
 
324 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  34.69 
 
 
314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  35.63 
 
 
329 aa  153  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 
341 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  34.55 
 
 
354 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  33.14 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  33.24 
 
 
328 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  32.57 
 
 
328 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  34.39 
 
 
330 aa  139  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  31.21 
 
 
327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  31.21 
 
 
327 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 
313 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  32.29 
 
 
328 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  31.38 
 
 
328 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 
333 aa  117  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  32.87 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  31.07 
 
 
344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  30.56 
 
 
328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  30.56 
 
 
328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 
329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  29.95 
 
 
843 aa  109  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  31.5 
 
 
320 aa  91.3  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  25.14 
 
 
389 aa  91.3  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 
338 aa  90.5  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 
361 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
346 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  26.89 
 
 
359 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  31.07 
 
 
347 aa  82.8  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1426  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  29.6 
 
 
362 aa  82.8  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  23.88 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0625  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  25 
 
 
413 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.484917 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  28.73 
 
 
348 aa  70.5  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  28.19 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2015  hypothetical protein  28.19 
 
 
347 aa  68.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.509344 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  26.48 
 
 
381 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  27.78 
 
 
313 aa  65.1  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 
342 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2785  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 
335 aa  63.9  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81235  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  29.31 
 
 
313 aa  63.9  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  25.21 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  25.29 
 
 
323 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1276  putative NAD/FAD-dependent oxidoreductase  27.12 
 
 
340 aa  59.3  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2190  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 
344 aa  59.3  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  38.82 
 
 
342 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 
346 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  38.82 
 
 
342 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  43.86 
 
 
491 aa  56.6  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  22.94 
 
 
478 aa  56.2  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  22.94 
 
 
478 aa  56.2  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  26.14 
 
 
316 aa  56.2  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  44.83 
 
 
482 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  23.23 
 
 
478 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1168  amine oxidase  34.86 
 
 
416 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1169  amine oxidase  34.86 
 
 
416 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1383  hypothetical protein  40 
 
 
436 aa  53.9  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152417  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1239  amine oxidase  34.86 
 
 
416 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2954  glutamate synthase subunit beta  59.52 
 
 
484 aa  52.8  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1137  glutamate synthase subunit beta  60 
 
 
484 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0331749  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  45.9 
 
 
467 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1489  amine oxidase  39.19 
 
 
419 aa  52.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0760  glutamate synthase subunit beta  60 
 
 
485 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.423731  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3381  hypothetical protein  50 
 
 
416 aa  50.8  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  41.38 
 
 
478 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  41.38 
 
 
478 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3208  amine oxidase  33.03 
 
 
416 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.884279 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  41.38 
 
 
478 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  41.38 
 
 
478 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  41.38 
 
 
478 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1312  amine oxidase  33.03 
 
 
416 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  38.33 
 
 
573 aa  50.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  47.73 
 
 
490 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  41.38 
 
 
478 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3065  amine oxidase  33.03 
 
 
416 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  51.16 
 
 
490 aa  50.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3051  amine oxidase  33.03 
 
 
416 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  46.94 
 
 
479 aa  50.1  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  47.73 
 
 
490 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  47.73 
 
 
487 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  47.73 
 
 
482 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  47.73 
 
 
485 aa  50.4  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  47.73 
 
 
482 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  47.92 
 
 
480 aa  50.4  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  47.73 
 
 
482 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3370  amine oxidase  50 
 
 
417 aa  50.4  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  42 
 
 
647 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  42 
 
 
647 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>